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基于活菌内标的单核细胞增生李斯特菌荧光定量PCR方法的建立

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
1 文献综述第14-44页
   ·单核细胞增生李斯特菌生物学特性第14-23页
     ·基本特征第14-15页
     ·分布第15-16页
     ·生活周期第16-17页
     ·对理化因素的抵抗力第17页
     ·血清学分型第17-18页
     ·主要毒力因子第18-22页
     ·李斯特菌病的临床特征第22页
     ·李斯特菌病的暴发情况第22-23页
   ·单核细胞增生李斯特菌检测技术第23-34页
     ·生化鉴定技术第23-25页
     ·免疫学检测技术第25-27页
     ·核酸分子杂交检测技术第27-28页
     ·PCR检测技术第28-34页
   ·荧光定量PCR的原理和分类第34-37页
     ·原理第34-35页
     ·分类第35-37页
     ·存在的缺点第37页
   ·扩增内标的研究概况第37-43页
     ·导致假阴性出现的原因第37-40页
     ·扩增内标在PCR检测中的应用第40-41页
     ·扩增内标的制备方法第41-43页
   ·研究目标第43-44页
2 单核细胞增生李斯特菌的鉴定与验证第44-59页
   ·材料与方法第44-55页
     ·菌株第44-45页
     ·培养基第45页
     ·主要试剂及配制第45-46页
     ·主要仪器设备第46页
     ·菌株的培养和革兰氏染色第46页
     ·Biolog细菌鉴定系统第46-48页
     ·VITEK-32全自动微生物鉴定/药物分析系统第48-50页
     ·BD BBL Crystal细菌鉴定系统第50-52页
     ·基于PCR技术的细菌鉴定方法第52-53页
     ·血清学鉴定第53-55页
   ·结果与分析第55-58页
     ·Biolog鉴定结果第55页
     ·VITEK-32鉴定结果第55页
     ·BD BBL Crystall鉴定结果第55-56页
     ·PCR方法鉴定结果第56页
     ·各种鉴定方法的比较第56-57页
     ·血清学鉴定结果第57-58页
   ·讨论第58-59页
3 单核细胞增生李斯特菌活菌内标序列的设计与合成第59-74页
   ·材料与方法第59-66页
     ·菌种和质粒第59-60页
     ·培养基及试剂的配制第60页
     ·仪器和设备第60-61页
     ·hly基因的保守区段分析第61页
     ·特异性检测引物与探针的设计第61页
     ·扩增内标序列的设计第61-62页
     ·扩增内标序列的合成第62-64页
     ·扩增内标序列与载体连接第64-65页
     ·感受态细胞的制备第65页
     ·连接产物的转化第65页
     ·阳性转化子的筛选第65页
     ·质粒的提取第65-66页
     ·阳性克隆的测序鉴定第66页
   ·结果与分析第66-71页
     ·hly基因序列比对结果第66-69页
     ·引物与探针的合成第69页
     ·扩增内标序列的筛选结果第69-70页
     ·扩增内标序列的PCR检测第70-71页
     ·阳性克隆片段的序列测定第71页
   ·讨论第71-74页
4 带有内标序列的单核细胞增生李斯特菌突变株的构建第74-101页
   ·材料与方法第74-91页
     ·菌株第74页
     ·培养基第74-75页
     ·质粒第75-77页
     ·主要试剂及溶液的配制第77-78页
     ·主要仪器设备第78-79页
     ·DNA模板的提取第79页
     ·引物的设计与合成第79-80页
     ·PCR扩增第80-81页
     ·PCR产物及载体的酶切、回收与纯化第81-82页
     ·DNA片断的连接第82页
     ·感受态细胞的制备第82-83页
     ·连接产物的转化第83页
     ·重组质粒的快速鉴定第83页
     ·质粒的提取第83-84页
     ·重组质粒的酶切鉴定第84页
     ·同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建第84-86页
     ·单核细胞增生李斯特菌感受态细胞的制备第86页
     ·电转单核细胞增生李斯特菌感受态细胞第86页
     ·质粒的提取第86-87页
     ·阳性转化子的菌落PCR及酶切鉴定第87页
     ·同源交换突变株的筛选第87-89页
     ·同源交换突变株的PCR鉴定第89-90页
     ·同源交换突变株的RT-PCR鉴定第90-91页
     ·突变株内标序列的测序分析第91页
   ·结果与分析第91-99页
     ·hly基因上游和下游同源片段的PCR扩增第91-92页
     ·中间质粒pSK-UIKD的构建第92-94页
     ·同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建第94-95页
     ·质粒pKSV7-UIKD的酶切鉴定第95页
     ·同源交换突变株的获得第95-96页
     ·同源交换突变株的PCR验证结果第96-97页
     ·同源交换突变株的RT-PCR验证结果第97-98页
     ·突变株内标序列的测序分析结果第98-99页
   ·讨论第99-101页
     ·同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建第99页
     ·同源重组质粒pKSV7-UIKD的电转化第99-100页
     ·同源交换突变株的筛选与鉴定第100-101页
5 添加活菌内标的荧光定量PCR检测方法的研究第101-128页
   ·材料与方法第101-110页
     ·菌株第101-102页
     ·培养基第102-103页
     ·主要试剂第103页
     ·主要仪器设备第103页
     ·菌种活化与培养第103-104页
     ·基因组DNA提取第104页
     ·含扩增内标荧光定量PCR检测方法的建立第104-106页
     ·含扩增内标荧光定量PCR检测方法的评价第106页
     ·活菌内标在准确定量中的运用(LM-IAC AQ-PCR)第106-108页
     ·活菌内标在全程监控假阴性中的运用(LM-IAC EQ-PCR)第108-110页
   ·结果与分析第110-125页
     ·荧光阈值的设定第110页
     ·TaqMan探针浓度的选择第110页
     ·活菌内标添加量的确定第110-111页
     ·特异性评价第111-112页
     ·灵敏度评价第112-113页
     ·DNA提取方法的选择第113-115页
     ·野生菌和活菌内标PCR扩增效率的评价第115-116页
     ·野生菌和活菌内标DNA提取效率的评价第116-118页
     ·回归方程的建立第118-119页
     ·LM-IAC AQ-PCR定量方法的评价第119-120页
     ·野生菌与活菌内标生化特性比较第120页
     ·野生菌和活菌内标生长曲线的测定第120-121页
     ·混合培养中活菌内标平板计数卡那霉素加入量的确定第121-122页
     ·混合培养中活菌内标加入量对野生菌生长的影响第122-123页
     ·LM-IAC EQ-PCR全程监控假阴性的评价第123-125页
   ·讨论第125-128页
     ·活菌内标在单核细胞增生李斯特菌准确定量中的运用第125-126页
     ·活菌内标在荧光定量PCR检测中全程监控假阴性的运用第126-128页
6 添加多重扩增内标的PCR检测方法的建立第128-145页
   ·材料与方法第128-133页
     ·供试菌株第128-129页
     ·培养基及试剂的配制第129页
     ·仪器和设备第129-130页
     ·DNA模板的提取和定量第130页
     ·含多重扩增内标的PCR检测方法(mIAC PCR)的建立第130-132页
     ·PCR结果的电泳检测第132页
     ·mIAC PCR检测方法的评价第132-133页
   ·结果与分析第133-143页
     ·多重内标的PCR验证第133页
     ·未添加多重扩增内标时的纯DNA检测灵敏度第133-135页
     ·添加有多重扩增内标时的纯DNA检测灵敏度第135-136页
     ·mIAC PCR检测方法特异性评价第136-140页
     ·人工污染样品的检测第140-143页
   ·讨论第143-145页
7 结论及创新性第145-146页
   ·结论第145页
   ·特色和创新第145-146页
参考文献第146-159页
致谢第159-160页
附录第160页

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