| 论文提要 | 第1-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-18页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第9-11页 |
| ·计算机模拟概述 | 第11-15页 |
| ·本论文的内容 | 第15-18页 |
| 第二章 理论计算方法简介 | 第18-39页 |
| ·同源模建 | 第19-20页 |
| ·分子对接 | 第20-22页 |
| ·力场 | 第22-25页 |
| ·分子力学 | 第25-29页 |
| ·分子动力学 | 第29-32页 |
| ·量子化学方法 | 第32-39页 |
| 第三章 几类蛋白质的结构预测及其与小分子对接的研究 | 第39-120页 |
| ·茉莉酮酸甲酯酶的结构预测及其与小分子对接 | 第39-55页 |
| ·β-樱草糖柑酶的结构预测及其与小分子对接 | 第55-70页 |
| ·大阿米芹中的香柠檬烯醇甲基转移酶的三维结构模建及底物专一性研究 | 第70-91页 |
| ·极光激酶C 的结构预测及其与小分子抑制剂的对接 | 第91-106页 |
| ·Furcatin 水解酶的三维结构模建和与furcatin 的对接研究 | 第106-118页 |
| ·本章小结 | 第118-120页 |
| 第四章 几类蛋白质的结构预测，与小分子对接及反应机理的研究 | 第120-160页 |
| ·红平红球菌中酰氨酶的结构预测，与小分子对接及反应机理的研究 | 第120-143页 |
| ·幽门螺杆菌中甲酰氨酶的结构预测，与小分子对接及反应机理的研究 | 第143-159页 |
| ·本章小结 | 第159-160页 |
| 参考文献 | 第160-178页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第178-179页 |
| 论文摘要 | 第179-184页 |
| Abstract | 第184-191页 |
| 致谢 | 第191页 |
