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基于转录组的人肝脏分泌蛋白质组研究

军事医学科学院研究生学位论文独创性声明第1页
军事医学科学院研究生学位论文版权使用授权书第2-6页
摘要第6-9页
Abstract第9-12页
英文缩写词第12-13页
1 前言第13-15页
2 分泌蛋白质组预测系统的建立第15-17页
   ·预测方法第15页
     ·信号序列的预测第15页
     ·跨膜区预测第15页
     ·线粒体转运肽的预测第15页
     ·GPI锚修饰的预测第15页
   ·预测体系第15-17页
3 对分泌蛋白质组预测体系的评估第17-18页
   ·数据集第17页
   ·评估参数第17页
     ·准确率(Precise)第17页
     ·回复率(Recall)第17页
   ·结果和讨论第17-18页
4 人肝脏分泌蛋白质组的确定第18-19页
   ·人肝脏中表达的基因第19页
   ·蛋白质序列数据的收集第19页
   ·人肝脏分泌蛋白质组的确定第19页
5 人肝脏分泌蛋白质组的特征第19-35页
   ·INTERPRO结构域分析第19-21页
   ·人肝脏分泌蛋白质组中被富集的代谢途径第21-22页
   ·人肝脏分泌蛋白质组中参与溶血与凝血反应的蛋白质第22-26页
   ·人肝脏分泌蛋白质组中与肝脏造血功能相关的蛋白质第26-28页
   ·人肝脏分泌蛋白质组中与癌症和疾病相关的蛋白质第28-29页
   ·信号序列和蛋白质分泌途径第29-30页
     ·信号序列第29页
     ·蛋白质分泌途径第29-30页
   ·含有宿主细胞定向信号(HCT)的蛋白质第30-35页
6 人肝脏分泌蛋白质组与血浆蛋白质组之间的关系第35-37页
参考文献第37-43页
参考网址第43-44页
附录第44-116页
 表3.1 用于评估分泌蛋白质组预测体系的5178个蛋白质的序列接受号第44-51页
 表3.2-1 5178个蛋白质中被错误预测为分泌蛋白的146个蛋白质第51-54页
 表3.2-2 5178个蛋白质中未被正确预测出来127个分泌蛋白质第54-58页
 表4.3 1597个分泌蛋白及其1037个编码基因第58-72页
 表5.6.2-1 人肝脏分泌蛋白质组中的Ⅰ型信号序列第72-92页
 表5.6.2-2 人肝脏分泌蛋白质组中的非典型Ⅰ型信号序列第92-102页
 表5.6.2-3 人肝脏分泌蛋白质组中的Ⅱ型信号序列第102页
 表5.6.2-4 人肝脏分泌蛋白质组中的RR型信号序列第102-105页
 表6-1 人肝脏分泌蛋白质组和人血浆蛋白质组中同时出现的蛋白质及其编码基因第105-116页
综述:蛋白质亚细胞定位预测方法第116-123页
致谢第123-127页
在读期间发表的论文、摘要列表第127-128页

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