军事医学科学院研究生学位论文独创性声明 | 第1页 |
军事医学科学院研究生学位论文版权使用授权书 | 第2-6页 |
摘要 | 第6-9页 |
Abstract | 第9-12页 |
英文缩写词 | 第12-13页 |
1 前言 | 第13-15页 |
2 分泌蛋白质组预测系统的建立 | 第15-17页 |
·预测方法 | 第15页 |
·信号序列的预测 | 第15页 |
·跨膜区预测 | 第15页 |
·线粒体转运肽的预测 | 第15页 |
·GPI锚修饰的预测 | 第15页 |
·预测体系 | 第15-17页 |
3 对分泌蛋白质组预测体系的评估 | 第17-18页 |
·数据集 | 第17页 |
·评估参数 | 第17页 |
·准确率(Precise) | 第17页 |
·回复率(Recall) | 第17页 |
·结果和讨论 | 第17-18页 |
4 人肝脏分泌蛋白质组的确定 | 第18-19页 |
·人肝脏中表达的基因 | 第19页 |
·蛋白质序列数据的收集 | 第19页 |
·人肝脏分泌蛋白质组的确定 | 第19页 |
5 人肝脏分泌蛋白质组的特征 | 第19-35页 |
·INTERPRO结构域分析 | 第19-21页 |
·人肝脏分泌蛋白质组中被富集的代谢途径 | 第21-22页 |
·人肝脏分泌蛋白质组中参与溶血与凝血反应的蛋白质 | 第22-26页 |
·人肝脏分泌蛋白质组中与肝脏造血功能相关的蛋白质 | 第26-28页 |
·人肝脏分泌蛋白质组中与癌症和疾病相关的蛋白质 | 第28-29页 |
·信号序列和蛋白质分泌途径 | 第29-30页 |
·信号序列 | 第29页 |
·蛋白质分泌途径 | 第29-30页 |
·含有宿主细胞定向信号(HCT)的蛋白质 | 第30-35页 |
6 人肝脏分泌蛋白质组与血浆蛋白质组之间的关系 | 第35-37页 |
参考文献 | 第37-43页 |
参考网址 | 第43-44页 |
附录 | 第44-116页 |
表3.1 用于评估分泌蛋白质组预测体系的5178个蛋白质的序列接受号 | 第44-51页 |
表3.2-1 5178个蛋白质中被错误预测为分泌蛋白的146个蛋白质 | 第51-54页 |
表3.2-2 5178个蛋白质中未被正确预测出来127个分泌蛋白质 | 第54-58页 |
表4.3 1597个分泌蛋白及其1037个编码基因 | 第58-72页 |
表5.6.2-1 人肝脏分泌蛋白质组中的Ⅰ型信号序列 | 第72-92页 |
表5.6.2-2 人肝脏分泌蛋白质组中的非典型Ⅰ型信号序列 | 第92-102页 |
表5.6.2-3 人肝脏分泌蛋白质组中的Ⅱ型信号序列 | 第102页 |
表5.6.2-4 人肝脏分泌蛋白质组中的RR型信号序列 | 第102-105页 |
表6-1 人肝脏分泌蛋白质组和人血浆蛋白质组中同时出现的蛋白质及其编码基因 | 第105-116页 |
综述:蛋白质亚细胞定位预测方法 | 第116-123页 |
致谢 | 第123-127页 |
在读期间发表的论文、摘要列表 | 第127-128页 |