| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 目录 | 第7-11页 |
| 第一章 药物与生物大分子相互作用概述 | 第11-41页 |
| ·引言 | 第11-12页 |
| ·喹诺酮药物研究进展 | 第12-20页 |
| ·喹诺酮药物的发展阶段 | 第12页 |
| ·喹诺酮药物的结构特点 | 第12-13页 |
| ·喹诺酮药物的作用机制 | 第13-17页 |
| ·喹诺酮药物产生耐药性的作用机制 | 第17-19页 |
| ·喹诺酮抗菌剂的总结与展望 | 第19-20页 |
| ·药物小分子与蛋白质相互作用的研究进展 | 第20-26页 |
| ·药物与蛋白质相互作用研究的实验方法 | 第20-22页 |
| ·药物与蛋白质相互作用研究的计算模拟方法 | 第22-26页 |
| ·药物小分子与DNA 相互作用的研究进展 | 第26-33页 |
| ·DNA 结构特征 | 第26-27页 |
| ·DNA 大分子与靶向药物小分子的相互作用 | 第27-32页 |
| ·DNA 大分子与靶向分子作用的结合模式 | 第32-33页 |
| ·生物大分子与小分子相互作用的理论基础 | 第33-37页 |
| ·生物大分子和小分子配体作用的多重结合平衡 | 第33-34页 |
| ·生物大分子和小分子配体相互作用的结合模型 | 第34-37页 |
| ·小结 | 第37页 |
| 参考文献 | 第37-41页 |
| 第二章 锂离子与芳香体系相互作用的量子化学研究 | 第41-66页 |
| ·生物体系中阳离子-Π作用概述 | 第41-50页 |
| ·分子识别中的阳离子-π作用 | 第41-43页 |
| ·阳离子-π作用的实验与理论计算研究 | 第43-49页 |
| ·阳离子－π作用应用 | 第49-50页 |
| ·引言 | 第50-51页 |
| ·研究方法 | 第51-53页 |
| ·初始构型 | 第51页 |
| ·计算方法 | 第51-53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-62页 |
| ·阳离子-π复合物的几何构型 | 第53-56页 |
| ·阳离子-π复合物的结合能 | 第56-58页 |
| ·阳离子-π复合物的电荷转移 | 第58页 |
| ·静电势 | 第58-62页 |
| ·小结 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-66页 |
| 第三章 喹诺酮抗菌素与人血清白蛋白结合模式的研究 | 第66-88页 |
| ·引言 | 第66-69页 |
| ·药物与蛋白质相互作用的理论基础 | 第69-70页 |
| ·实验和计算方法 | 第70-77页 |
| ·实验部分 | 第70-71页 |
| ·计算部分 | 第71-77页 |
| ·结果与讨论 | 第77-84页 |
| ·荧光法测定结合常数和结合位点数 | 第77-80页 |
| ·微量热法测定蛋白与药物结合过程的焓变 | 第80-81页 |
| ·分子模建PFLX 与HSA 的结合 | 第81-84页 |
| ·小结 | 第84页 |
| 参考文献 | 第84-88页 |
| 第四章 喹诺酮抗菌素与 DNA 结合的分子动力学模拟研 | 第88-107页 |
| ·引言 | 第88-92页 |
| ·生物大分子的动力学模拟 | 第92-98页 |
| ·分子动力学模拟理论基础 | 第93-95页 |
| ·分子动力学模拟应用 | 第95-96页 |
| ·动力学模拟软件 | 第96-98页 |
| ·研究方法 | 第98-99页 |
| ·模型及力场参数 | 第98页 |
| ·分子动力学 | 第98-99页 |
| ·结果及讨论 | 第99-103页 |
| ·复合物结构分析 | 第99-102页 |
| ·诺氟沙星结合位点分析 | 第102-103页 |
| ·小结 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-107页 |
| 第五章 分子动力学结合自由能计算研究 DNA 与药物分子的相互作用 | 第107-133页 |
| ·引言 | 第107-118页 |
| ·DNA 及其复合物的动力学模拟 | 第108-112页 |
| ·结合自由能计算 | 第112-115页 |
| ·MM/PBSA 方法的原理 | 第112-114页 |
| ·MM/PBSA 方法的应用 | 第114-115页 |
| ·DNA 与芳香二脒分子相互作用的简介 | 第115-118页 |
| ·计算方法 | 第118-120页 |
| ·DNA 与药物结合复合物的构建 | 第118页 |
| ·分子动力学模拟 | 第118-119页 |
| ·MM_PBSA 结合自由能计算 | 第119-120页 |
| ·计算模拟结果 | 第120-125页 |
| ·分子动力学模拟DNA-D875 复合物 | 第120-122页 |
| ·分子动力学模拟DNA-D8293 复合物 | 第122-123页 |
| ·分子动力学模拟DNA-D8351 复合物 | 第123-124页 |
| ·分子动力学模拟DNA-D8818 复合物 | 第124-125页 |
| ·结果讨论 | 第125-129页 |
| ·复合物的结构分析 | 第125-126页 |
| ·复合物DNA 小沟分析 | 第126-127页 |
| ·结合自由能预测分析 | 第127-129页 |
| ·小结 | 第129页 |
| 参考文献 | 第129-133页 |
| 第六章 总结与展望 | 第133-136页 |
| 附录 | 第136-137页 |
| 致谢 | 第137页 |