| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 缩略词索引 | 第7-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-16页 |
| ·药理学简介 | 第11页 |
| ·SNP位点与抗药性关系简介 | 第11-12页 |
| ·药物基因组学简介 | 第12-13页 |
| ·计算机辅助药物设计简介 | 第13-14页 |
| ·本论文的研究出发点和研究内容 | 第14-16页 |
| ·本论文的研究出发点 | 第14-15页 |
| ·本论文的研究内容 | 第15-16页 |
| 第二章 成功靶标的SNP映射及距离分析 | 第16-24页 |
| ·引言 | 第16页 |
| ·生物信息数据库 | 第16-17页 |
| ·TTD数据库 | 第16页 |
| ·PDB数据库 | 第16页 |
| ·NCBI数据库 | 第16-17页 |
| ·HapMap数据库 | 第17页 |
| ·Uniprot数据库 | 第17页 |
| ·技术流程 | 第17-19页 |
| ·数据准备 | 第17-18页 |
| ·数据筛选及处理 | 第18-19页 |
| ·结果 | 第19-22页 |
| ·结论 | 第22-24页 |
| 第三章 由SNP位点引起的药物抗性研究 | 第24-38页 |
| ·计算概要 | 第24-28页 |
| ·量化计算 | 第24-25页 |
| ·动力学模拟 | 第25-27页 |
| ·MM/GBSA自由能计算 | 第27页 |
| ·氨基酸残基分解 | 第27-28页 |
| ·氨基酸振动相关性分析和主成分分析 | 第28页 |
| ·EML4-ALK的C1156 Y突变对Crizotinib抗性机理的计算研究 | 第28-38页 |
| ·材料准备——晶体结构选取及修复 | 第30页 |
| ·结果与讨论 | 第30-37页 |
| ·结论 | 第37-38页 |
| 第四章 三个潜在抗性靶标及抗性机理研究 | 第38-60页 |
| ·Cytochrome P450 3A4的L373F突变 | 第38-44页 |
| ·材料准备——晶体结构选取及药物分子的对接 | 第39页 |
| ·结果与讨论 | 第39-44页 |
| ·抗性机理总结及用药建议 | 第44页 |
| ·Plasminogen的H133Q突变 | 第44-53页 |
| ·材料准备——晶体结构选取及药物分子的对接 | 第45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-52页 |
| ·抗性机理总结及用药建议 | 第52-53页 |
| ·Peroxisome Proliferator Activated Receptor Alpha的A268V突变 | 第53-58页 |
| ·材料准备——晶体结构选取及药物分子的对接 | 第54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-58页 |
| ·抗性机理总结及用药建议 | 第58页 |
| ·小结 | 第58-60页 |
| 第五章 论文总结 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 附录 | 第68-70页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第70-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
