摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
前言 | 第9-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-29页 |
1.扁桃种质资源 | 第11-14页 |
1.1 扁桃种质资源 | 第11-12页 |
1.2 扁桃及其李属植物种质资源研究进展 | 第12-14页 |
2.EST-SSR技术 | 第14-20页 |
2.1 EST技术概述 | 第14-16页 |
2.2 SSR概述 | 第16-17页 |
2.3 EST-SSR技术 | 第17-20页 |
2.3.1 EST-SSR技术的优越性 | 第18页 |
2.3.2 EST-SSR与genomic-SSR的比较 | 第18-19页 |
2.3.3 EST-SSR研究进展 | 第19-20页 |
3.SSR进化模式 | 第20-29页 |
3.1 SSR的突变机制 | 第20-25页 |
3.1.1 SSR进化的背景知识 | 第20-22页 |
3.1.2 SSR突变的机制 | 第22-24页 |
3.1.3 突变过程的影响因素 | 第24-25页 |
3.2 SSR突变模型 | 第25-29页 |
3.2.1 逐步突变模型(SMM; Stepwise Mutation Model) | 第26-28页 |
3.2.2 两相模型(TPM; Two-phase model) | 第28页 |
3.2.3 无限等位模型(IAM; Infinite Alleles Model) | 第28页 |
3.2.4 平衡模型(点突变与重复长度之间的平衡) | 第28-29页 |
第二章 扁桃表达序列标签(EST)分析 | 第29-34页 |
2.1 材料与方法 | 第29-30页 |
2.1.1 EST序列来源 | 第29页 |
2.1.2 EST序列的片段重叠群(Contig)分析 | 第29页 |
2.1.3 EST-trimmer预处理数据 | 第29页 |
2.1.4 EST序列中SSR筛选 | 第29-30页 |
2.1.5 EST-SSR引物设计 | 第30页 |
2.2 结果与分析 | 第30-32页 |
2.2.1 EST-SSR分布情况 | 第30-32页 |
2.3 讨论 | 第32-34页 |
2.3.1 EST-SSR频率和分布 | 第32-34页 |
第三章 扁桃及李属物种SSR进化模式分析 | 第34-70页 |
3.1 实验材料 | 第34-36页 |
3.2 实验方法 | 第36-48页 |
3.2.1 基因组DNA的提取 | 第36-37页 |
3.2.2 PCR扩增及电泳检测 | 第37-41页 |
3.2.2.1 引物选择 | 第37页 |
3.2.2.2 PCR扩增 | 第37-39页 |
3.2.2.3 PCR产物变性聚丙烯酰胺电泳检测 | 第39-41页 |
3.2.3 SSR序列分析 | 第41-48页 |
3.2.3.1 目的片断的回收和扩增 | 第41-42页 |
3.2.3.2 目的片断的克隆 | 第42-45页 |
3.2.3.3 序列测定 | 第45-48页 |
3.2.3.4 测序结果整理分析 | 第48页 |
3.3 结果与分析 | 第48-67页 |
3.3.1 SSR聚丙烯酰氨凝胶电泳分析 | 第48-53页 |
3.3.2 回收片断PCR | 第53页 |
3.3.3 质粒检测 | 第53-54页 |
3.3.4 序列分析 | 第54-67页 |
3.4 讨论 | 第67-70页 |
3.4.1 扁桃及李属植物SSR的进化模式 | 第67-68页 |
3.4.2 SSR等位的大小非同源性相似(Size homoplasy) | 第68页 |
3.4.3 新SSR类型的发生 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-83页 |
致谢 | 第83-84页 |