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扁桃及其它李属物种微卫星序列(SSR)突变机制和进化模式分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
前言第9-11页
第一章 文献综述第11-29页
 1.扁桃种质资源第11-14页
  1.1 扁桃种质资源第11-12页
  1.2 扁桃及其李属植物种质资源研究进展第12-14页
 2.EST-SSR技术第14-20页
  2.1 EST技术概述第14-16页
  2.2 SSR概述第16-17页
  2.3 EST-SSR技术第17-20页
   2.3.1 EST-SSR技术的优越性第18页
   2.3.2 EST-SSR与genomic-SSR的比较第18-19页
   2.3.3 EST-SSR研究进展第19-20页
 3.SSR进化模式第20-29页
  3.1 SSR的突变机制第20-25页
   3.1.1 SSR进化的背景知识第20-22页
   3.1.2 SSR突变的机制第22-24页
   3.1.3 突变过程的影响因素第24-25页
  3.2 SSR突变模型第25-29页
   3.2.1 逐步突变模型(SMM; Stepwise Mutation Model)第26-28页
   3.2.2 两相模型(TPM; Two-phase model)第28页
   3.2.3 无限等位模型(IAM; Infinite Alleles Model)第28页
   3.2.4 平衡模型(点突变与重复长度之间的平衡)第28-29页
第二章 扁桃表达序列标签(EST)分析第29-34页
 2.1 材料与方法第29-30页
  2.1.1 EST序列来源第29页
  2.1.2 EST序列的片段重叠群(Contig)分析第29页
  2.1.3 EST-trimmer预处理数据第29页
  2.1.4 EST序列中SSR筛选第29-30页
  2.1.5 EST-SSR引物设计第30页
 2.2 结果与分析第30-32页
  2.2.1 EST-SSR分布情况第30-32页
 2.3 讨论第32-34页
  2.3.1 EST-SSR频率和分布第32-34页
第三章 扁桃及李属物种SSR进化模式分析第34-70页
 3.1 实验材料第34-36页
 3.2 实验方法第36-48页
  3.2.1 基因组DNA的提取第36-37页
  3.2.2 PCR扩增及电泳检测第37-41页
   3.2.2.1 引物选择第37页
   3.2.2.2 PCR扩增第37-39页
   3.2.2.3 PCR产物变性聚丙烯酰胺电泳检测第39-41页
  3.2.3 SSR序列分析第41-48页
   3.2.3.1 目的片断的回收和扩增第41-42页
   3.2.3.2 目的片断的克隆第42-45页
   3.2.3.3 序列测定第45-48页
   3.2.3.4 测序结果整理分析第48页
 3.3 结果与分析第48-67页
  3.3.1 SSR聚丙烯酰氨凝胶电泳分析第48-53页
  3.3.2 回收片断PCR第53页
  3.3.3 质粒检测第53-54页
  3.3.4 序列分析第54-67页
 3.4 讨论第67-70页
  3.4.1 扁桃及李属植物SSR的进化模式第67-68页
  3.4.2 SSR等位的大小非同源性相似(Size homoplasy)第68页
  3.4.3 新SSR类型的发生第68-70页
参考文献第70-83页
致谢第83-84页

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