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豌豆根瘤菌染色体hxy基因的克隆与功能研究

摘要第1-7页
目录第7-10页
1 前言第10-27页
   ·简介第10-11页
   ·根瘤菌的分类第11-12页
   ·结瘤基因的组织和分类第12-16页
     ·结瘤基因的分类第13-14页
     ·结瘤基因的功能及其与nod box和类黄酮分子的相互作用第14页
     ·nod box的结构特征第14-15页
     ·NodD与诱导物相互作用的细胞定位第15页
     ·NodD与诱导物是否发生直接相互作用第15-16页
     ·诱导物对于NodD与nod box结合的影响第16页
   ·结瘤基因的调控第16-21页
     ·R. leg. 8401(pRL1JI)中结瘤基因的调控第16-18页
     ·B. japonicum中结瘤基因的调控第18-20页
       ·two-component调节第18-19页
       ·负调控系统第19-20页
     ·Rhizobium sp. NGR234中结瘤基因的调控第20-21页
   ·结瘤基因表达的精细调控第21-25页
     ·结瘤基因的负反馈调控第21页
     ·结瘤基因的quorum调控第21-25页
       ·B. japonicum中的quorum调节第22-23页
       ·R. leguminosarum bv. Viciae中的quorum感知调节体系第23-24页
       ·S. meliloti中的quorum感知调控第24-25页
   ·前景与展望第25页
   ·关于本研究第25-27页
2.材料和方法第27-49页
   ·菌株与质粒第27-28页
   ·引物、酶和主要生化试剂第28-30页
     ·引物第28-29页
     ·酶和主要生化试剂第29页
     ·主要仪器第29-30页
   ·基本的实验技术和方法第30-33页
     ·细菌培养第30-31页
     ·质粒DNA的抽提第31-32页
     ·感受态细胞制备和重组质粒的转化第32-33页
       ·感受态细胞的制备第32页
       ·重组质粒的转化第32-33页
     ·从低熔点琼脂糖凝胶中回收DNA第33页
   ·根瘤菌总DNA的抽提第33-35页
     ·根瘤菌总DNA的小量抽提第33-34页
     ·根瘤菌总DNA的大量抽提第34-35页
   ·Southern杂交第35-37页
     ·切口平移法标记hxy基因探针第35-36页
     ·将DNA转移到尼龙膜第36-37页
     ·放射性标记的探针与固定于尼龙膜上的DNA进行杂交第37页
   ·豌豆根瘤菌基因组hxy基因的克隆及序列分析第37-40页
     ·豌豆根瘤菌基因组DNA Sal Ⅰ酶切片段接头与接头引物的设计第37-38页
     ·豌豆根瘤菌基因组hxy基因特异引物设计第38页
     ·GenomeWalking法克隆hxy基因第38-40页
     ·DNA序列分析及同源性比较第40页
   ·根瘤菌RNA的抽提和RT-PCR反应第40-43页
     ·RNA专用仪器的预处理第40页
     ·水饱和酚的配制第40页
     ·根瘤菌RNA的抽提第40-41页
     ·RNA的甲醛变性电泳第41-42页
     ·RT-PCR反应第42-43页
   ·双亲杂交第43-44页
   ·豌豆根瘤菌hxy突变株的构建第44-46页
     ·含插入了卡那霉素抗性片段的hxy基因的重组质粒的构建第44-45页
       ·含卡那霉素抗性基因的DNA片段的制备第44页
       ·含插入了卡那霉素抗性片段的hxy基因的重组质粒的构建第44-45页
     ·豌豆根瘤菌hxy突变株的构建第45页
     ·豌豆根瘤菌hxy基因卡那霉素抗性插入突变菌株的验证第45-46页
       ·PCR方法验证第45-46页
       ·Southern杂交方法验证第46页
   ·豌豆根瘤菌hxy突变株中结瘤基因表达的测定第46-49页
     ·结瘤基因表达报告质粒的构建第46页
     ·根瘤菌电转化感受态细胞的制备第46-47页
     ·利用电转化的方法将报告质粒转移到根瘤菌野生型菌株和hxy突变株中第47页
     ·β-半乳糖苷酶活性的测定第47-49页
       ·试剂配制第47页
       ·β-半乳糖苷酶活性测定第47-49页
3.实验结果第49-63页
   ·豌豆根瘤菌基因组中只含单一种类和单一拷贝的hxy基因第49-50页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因的克隆第50-52页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因的测序及序列分析第52-55页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因序列的同源性比较第55-56页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因RT-PCR结果第56-57页
   ·豌豆根瘤菌hxy突变株的构建第57-59页
   ·豌豆根瘤菌hxy突变株mutDw6的鉴定第59-61页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因突变对结瘤基因表达的影响第61-63页
4.讨论第63-66页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因很可能是一个新基因第63页
   ·在转录水平上hxy基因不影响结瘤基因的表达第63-64页
   ·豌豆根瘤菌hxy基因的功能进一步研究第64-66页
     ·结瘤实验第64-65页
     ·引物延伸实验第65页
     ·构建hxy基因表达质粒第65-66页
参考文献第66-71页
致谢第71页

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