| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-27页 |
| 1 稻瘟病菌致病性与水稻抗病性研究进展 | 第13-21页 |
| ·稻瘟病致病性研究进展 | 第14-17页 |
| ·稻瘟病致病性或生理小种和遗传宗谱 | 第17-19页 |
| ·无毒基因、致病性相关基因和基因组 | 第19-21页 |
| 2 水稻抗稻瘟病基因的研究进展 | 第21-26页 |
| ·抗稻瘟病基因的遗传和鉴定 | 第21页 |
| ·抗稻瘟病基因的定位和遗传图谱 | 第21-24页 |
| ·抗稻瘟病基因的克隆及其结构功能 | 第24-25页 |
| ·抗稻瘟病基因分子标记引物 | 第25-26页 |
| 3.本研究意义 | 第26-27页 |
| 第二章 水稻全基因组编码抗病基因同源序列分析 | 第27-44页 |
| 1 材料和方法 | 第28-29页 |
| ·数据库搜索和序列获得 | 第28页 |
| ·蛋白质序列结构重新预测和DNA序列内转座子元件预测 | 第28-29页 |
| ·序列同源树和系统发生树构建 | 第29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-41页 |
| ·水稻基因组中抗病基因同源序列数目 | 第29-30页 |
| ·R基因蛋白质序列结构重新预测与归类 | 第30-31页 |
| ·同源树的构建 | 第31-35页 |
| ·R基因蛋白质保守结构域分析 | 第35-38页 |
| ·N端结构域 | 第36页 |
| ·保守结构域 | 第36-38页 |
| ·C端结构域 | 第38页 |
| ·抗病基因同源序列基因组DNA序列转座元件分析 | 第38-39页 |
| ·转座元件在抗病基因同源序列中存在模式和抗病基因同源序列进化 | 第39-41页 |
| 3 讨论 | 第41-44页 |
| ·抗病基因同源序列在水稻基因组中的丰度 | 第41页 |
| ·水稻R基因蛋白质保守结构域 | 第41-42页 |
| ·抗病基因同源序列的进化与转座元件 | 第42-44页 |
| 第三章 水稻品种稻瘟病抗性和抗病基因同源序列多态性分析 | 第44-54页 |
| 1 材料与方法 | 第45-48页 |
| ·供试材料 | 第45-46页 |
| ·稻瘟病菌株的来源与培养 | 第46-47页 |
| ·稻瘟病生理小种和水稻遗传材料抗病性鉴定 | 第47页 |
| ·水稻基因组DNA提取与扩增 | 第47-48页 |
| ·数据处理 | 第48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-52页 |
| ·水稻品种抗稻瘟病表型 | 第48-49页 |
| ·品种(系)RGA多态性 | 第49页 |
| ·基于抗感单孢稻瘟病菌表型聚类分析 | 第49-50页 |
| ·基于RGA相似性对品种(系)进行聚类 | 第50页 |
| ·水稻抗稻瘟病性和抗病基因同源序列多态性比较 | 第50-52页 |
| 3 讨论 | 第52-53页 |
| ·单孢菌株接种鉴定 | 第52页 |
| ·抗稻瘟病表型与抗病基因同源序列多态性 | 第52-53页 |
| 4 结论 | 第53-54页 |
| 第四章 一个水稻NBS同源序列的分离和生物信息学分析 | 第54-63页 |
| 1 材料与方法 | 第54-55页 |
| ·实验材料 | 第54页 |
| ·方法 | 第54-55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-61页 |
| ·RGA-PCR扩增及克隆 | 第55-56页 |
| ·序列分析和染色体定位 | 第56-57页 |
| ·ORF预测和同源性聚类分析 | 第57-61页 |
| ·同源建模和三维结构预测 | 第61页 |
| 3 讨论 | 第61-62页 |
| 4 小结 | 第62-63页 |
| 第五章 两个水稻抗病候选基因的克隆和生物信息学分析 | 第63-70页 |
| 1 材料和方法 | 第63-64页 |
| ·材料 | 第63页 |
| ·RGA引物设计和PCR扩增 | 第63-64页 |
| ·目的基因片断的克隆与鉴定 | 第64页 |
| ·目的序列的生物信息学分析 | 第64页 |
| 2 结果与分析 | 第64-69页 |
| ·目的基因片断的扩增与鉴定 | 第65页 |
| ·目的基因片断测序和生物信息学分析 | 第65-69页 |
| 3 讨论 | 第69-70页 |
| 第六章 结论与对育种的几点认识 | 第70-76页 |
| 1 水稻抗稻瘟病基因的遗传与进化 | 第70-72页 |
| ·抗稻瘟病基因的遗传与克隆 | 第70-71页 |
| ·抗病基因的进化 | 第71页 |
| ·抗病基因的克隆 | 第71-72页 |
| 2 水稻抗病育种几点识 | 第72-76页 |
| ·杂交育种 | 第72-75页 |
| ·其他方式育种 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 在读期间撰写和发表的论文 | 第93-94页 |
| 附件一:参加工作期间选育成型的恢复材料和保持材料 | 第94-97页 |
| 附件二:2006年秋季抗稻瘟病鉴定结果 | 第97-98页 |
| 附件三:2007年秋季抗稻瘟病鉴定 | 第98-99页 |
| 附件四:FY_2、FY_3序列的开放阅读框 | 第99-103页 |
| 附件五:抗病基因同源DNA序列中的转座元件 | 第103-104页 |
