| 提要 | 第1-7页 |
| 第1章 绪论 | 第7-12页 |
| ·课题背景 | 第7-11页 |
| ·RNA 介绍 | 第7-9页 |
| ·生物信息学介绍 | 第9-10页 |
| ·生物信息学的RNA 研究 | 第10-11页 |
| ·论文结构安排 | 第11-12页 |
| 第2章 RNA 二级结构的相关定义 | 第12-17页 |
| ·RNA 二级结构 | 第12-13页 |
| ·RNA 二级结构的基本单元 | 第13-14页 |
| ·RNA 二级结构的图形表示 | 第14-15页 |
| ·假结结构 | 第15-17页 |
| 第3章 RNA 二级结构预测的研究现状 | 第17-35页 |
| ·比较序列分析方法 | 第17-22页 |
| ·共变模型 | 第18-21页 |
| ·随机上下文无关语法模型 | 第21-22页 |
| ·动态规划算法 | 第22-27页 |
| ·Nussinov 的碱基最大配对方法 | 第23-25页 |
| ·Zuker 的最小自由能方法 | 第25-27页 |
| ·组合优化算法 | 第27-31页 |
| ·螺旋区堆积法 | 第27-28页 |
| ·最大权重匹配算法 | 第28-31页 |
| ·启发式算法 | 第31-35页 |
| ·遗传算法 | 第31-32页 |
| ·模拟退火算法遗传算法 | 第32-34页 |
| ·神经网络算法 | 第34-35页 |
| 第4章 可预测假结的RNA 二级结构最优茎区组合方法 | 第35-46页 |
| ·算法的总体描述 | 第35页 |
| ·前后缀匹配算法求取最大茎区的方法 | 第35-39页 |
| ·后缀树 | 第35-37页 |
| ·前后缀匹配算法的相关定义 | 第37-38页 |
| ·前后缀匹配算法的具体过程以及流程图 | 第38-39页 |
| ·计算相容矩阵 | 第39-40页 |
| ·相关定义 | 第39-40页 |
| ·算法描述 | 第40页 |
| ·利用迭代矩阵求出最优茎区组合 | 第40-42页 |
| ·相关定义 | 第40页 |
| ·算法描述 | 第40-42页 |
| ·算法可预测的假结结构 | 第42-46页 |
| 第5章 试验的相关数据与对比 | 第46-49页 |
| ·试验概述 | 第46页 |
| ·与PSEUDOBASE 中结构比较 | 第46-47页 |
| ·与PKONTSRG 预测结果比较 | 第47-49页 |
| 第6章 总结与展望 | 第49-51页 |
| ·总结 | 第49-50页 |
| ·展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 摘要 | 第55-58页 |
| Abstract | 第58-60页 |