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Ⅱ型EPSP合酶的功能域鉴定及大肠杆菌在草甘膦冲击下的基因表达谱分析

摘要第1-7页
Abstract第7-16页
第一章 文献综述第16-42页
   ·EPSP 合酶国内外研究现状第16-21页
     ·莽草酸途径研究第16-17页
     ·EPSP 合酶研究史第17-18页
     ·EPSP 合酶催化机制第18页
     ·EPSP 合酶类型第18页
     ·EPSP 合酶保守功能域的研究第18-20页
     ·EPSP 合酶结构研究第20-21页
   ·广谱灭生性除草剂草甘膦第21-30页
     ·草甘膦第21-22页
     ·除草剂草甘膦的作用机理第22页
     ·草甘膦抗性获得方式第22-28页
     ·草甘膦降解途径研究第28-30页
     ·非靶位点抗性机制研究第30页
   ·EPSP 合酶用于新抗菌素靶标研究第30-31页
     ·丙酮酸转移酶家族第30-31页
     ·EPSP 合酶抑制剂研究进展第31页
   ·转基因植物发展现状第31-35页
     ·国外转基因植物现状第31-33页
     ·国内转基因植物现状第33-35页
   ·基因芯片技术及其应用第35-40页
     ·生物芯片技术简介第35-36页
     ·基因芯片技术及分类第36页
     ·基因芯片在微生物学的应用第36-39页
     ·基因芯片在抗除草剂草甘膦作物方面的应用第39-40页
   ·立题依据和技术路线第40-42页
     ·立题依据第40-41页
     ·技术路线第41-42页
第二章 II 型EPSP 合酶中新保守功能域RPMXR 与酶活和抗性的分析第42-67页
   ·材料第42-46页
     ·菌株和质粒第42-43页
     ·酶,试剂和试剂盒第43-44页
     ·培养基第44页
     ·主要仪器第44页
     ·抗生素第44-45页
     ·常用溶液配制第45-46页
   ·方法第46-54页
     ·基因组DNA、质粒DNA 的提取第46-47页
     ·PCR 扩增和纯化第47-49页
     ·DNA 酶切与连接反应第49-50页
     ·感受态细胞的制备与热激转化第50页
     ·氨基酸多序列比对第50-51页
     ·定点突变第51页
     ·功能互补实验及草甘膦抗性实验第51页
     ·融合蛋白的表达与纯化第51页
     ·变性蛋白SDS-PAGE 电泳第51-52页
     ·总蛋白的测定第52页
     ·EPSP 合酶动力学分析第52-53页
     ·3D 结构模拟第53-54页
   ·结果第54-65页
     ·EPSP 合酶多序列比对第54-56页
     ·EPSP 合酶基因的克隆及载体构建第56-57页
     ·保守位点氨基酸突变第57-58页
     ·非保守位点X 氨基酸替换第58-59页
     ·功能互补与草甘膦抗性第59页
     ·蛋白表达与纯化第59-60页
     ·酶底物动力学参数测定第60-64页
     ·RPMXR 功能域的3D 结构分析第64-65页
   ·讨论第65-67页
第三章 A1501 EPSP 合酶异源表达对大肠杆菌基因表达谱的影响第67-87页
   ·材料第67-70页
     ·菌株与质粒第67页
     ·培养基、耗材及主要生化试剂第67-69页
     ·主要仪器第69-70页
   ·方法第70-72页
     ·菌体制备与收集第70页
     ·细菌总RNA 的提取第70-71页
     ·定量和检测总RNA第71页
     ·cDNA 的合成和纯化第71页
     ·cDNA 的片段化第71-72页
     ·cDNA 的末端标记第72页
     ·配制杂交液第72页
     ·芯片杂交第72页
     ·洗脱芯片第72页
     ·扫描芯片第72页
   ·芯片数据分析相关网站、软件及依据第72-74页
     ·网站和软件第72-73页
     ·差异表达基因的判定第73页
     ·COG 的定义与建立第73-74页
   ·游离氨基酸测定第74页
     ·菌体培养与收集第74页
     ·游离氨基酸样品制备第74页
   ·BioLog 平板分析细菌代谢底物实验第74-75页
   ·结果第75-84页
     ·菌体RNA 提取及纯化第75页
     ·反转录、片段化和探针标记第75页
     ·芯片杂交第75-76页
     ·上调基因和下调基因的功能及分类第76-81页
     ·游离氨基酸测定第81-82页
     ·BioLog 细菌代谢底物分析第82-83页
     ·丝氨酸相关基因的表达受到抑制第83页
     ·对I 型菌毛相关基因表达的影响第83-84页
   ·讨论第84-87页
第四章 草甘膦冲击对大肠杆菌基因表达谱的影响第87-101页
   ·材料第87页
     ·菌株与质粒第87页
     ·培养基、耗材及主要生化试剂第87页
     ·主要仪器第87页
   ·方法第87-88页
     ·菌体制备与收集第87页
     ·总RNA 提取第87-88页
     ·定量和检测总RNA第88页
     ·cDNA 的合成与纯化第88页
     ·cDNA 的片段化第88页
     ·cDNA 的末端标记第88页
     ·配置杂交液第88页
     ·芯片杂交第88页
     ·洗脱芯片第88页
     ·扫描芯片第88页
     ·草甘膦冲击下的生长曲线测定第88页
   ·结果第88-99页
     ·菌体RNA 提取及纯化第88-89页
     ·反转录、片段化和探针标记第89页
     ·芯片杂交第89页
     ·上调基因和下调基因的功能及分类第89-93页
     ·M9 限制性培养基生长曲线第93-94页
     ·草甘膦冲击对莽草酸相关途径基因的影响第94-95页
     ·草甘膦冲击对支链氨基酸合成的影响第95页
     ·草甘膦冲击对亮氨酸ABC 转运蛋白的影响第95-96页
     ·草甘膦冲击对磺酸盐利用的影响第96-97页
     ·草甘膦冲击对I 型菌毛的影响第97-98页
     ·草甘膦冲击对噬菌体冲击蛋白的影响第98-99页
   ·讨论第99-101页
结论第101-102页
参考文献第102-113页
致谢第113-114页
作者简介第114-115页

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