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新型分泌蛋白Leg1a和Leg1b在斑马鱼肝脏发育中的功能研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略词表第9-16页
第一章 前言第16-41页
   ·斑马鱼及其发育过程 #I第16-24页
     ·斑马鱼的特征及模式生物地位的建立第16-17页
     ·斑马鱼的发育第17-24页
   ·肝脏的结构功能及发育第24-35页
     ·肝脏的形态和结构第25-27页
     ·肝脏的生理功能第27-28页
     ·肝脏发育过程第28-30页
     ·肝脏发育过程中的相关调控基因第30-35页
   ·分泌蛋白第35-39页
     ·分泌蛋白第36-37页
     ·分泌蛋白的修饰第37-39页
   ·本课题研究目的和意义第39-41页
第二章 材料和方法第41-64页
   ·斑马鱼第41页
     ·斑马鱼谱系及饲养第41页
     ·收集受精卵第41页
     ·未受精卵的收集第41页
   ·大肠杆菌菌株第41页
   ·基因组DNA的提取及使用第41-44页
     ·基因克隆第42-43页
       ·聚合酶链反应(PCR)第42页
       ·PCR产物/DNA片段纯化第42页
       ·质粒DNA的提取第42页
       ·DNA连接入质粒载体第42-43页
       ·用热激法转化DH5α大肠杆菌制备感受态细胞第43页
     ·DNA测序第43页
     ·基因定点突变第43-44页
     ·斑马鱼基因组DNA提取第44页
       ·从成年斑马鱼中提取基因组DNA第44页
       ·从鱼卵或者鱼鳞中提取基因组DNA第44页
   ·RNA相关技术及方法第44-47页
     ·从鱼卵中或者成鱼组织中提取总RNA第44-45页
     ·除去RNA中的基因组DNA第45页
     ·5'-RACE and 3'-RACE第45页
     ·RT-PCR (Reverse Transcription PCR)第45-46页
     ·mRNA的体外合成第46页
     ·Northern Blot分析第46-47页
       ·探针制备第46页
       ·RNA样品的准备第46-47页
       ·RNA胶电泳第47页
       ·Northern杂交第47页
   ·抗体免疫荧光第47-48页
     ·抗体免疫荧光的实验流程第47-48页
     ·p-Histone H3 Immunostaining and TUNEL Assay第48页
   ·蛋白质在大肠杆菌中表达第48-49页
     ·制备热击转化的BL21感受态细胞第48页
     ·蛋白表达第48-49页
     ·蛋白纯化第49页
     ·GST融合蛋白的纯化第49页
     ·GST融合蛋白的透析及浓缩第49页
   ·抗体的制备第49-51页
     ·抗原的准备第49-50页
     ·抗体的效价及特异性检测第50页
     ·抗体纯化第50-51页
       ·抗体粗纯化第50页
       ·抗原抗体吸附纯化第50-51页
   ·Western Blot第51-52页
     ·蛋白样品的准备第51页
     ·SDS-PAGE凝胶电泳和转膜第51-52页
     ·目标蛋白的信号检测第52页
   ·显微注射第52-53页
     ·准备显微注射的材料第52页
     ·附件,针头和支持盘的准备第52-53页
   ·显微注射Microinjection第53页
   ·斑马鱼胚胎的冰冻切片Cryosectioning第53页
   ·整胚原位杂交第53-55页
     ·准备地高辛标记的RNA探针第53-54页
     ·整胚原位杂交第54-55页
   ·显微镜下观察和成像第55页
   ·细胞培养和转染第55-56页
     ·细胞培养第55页
     ·细胞转染第55-56页
   ·斑马鱼的组织取血及解剖第56页
     ·斑马鱼的组织取血第56页
     ·斑马鱼的组织解剖第56页
   ·免疫共沉淀第56-57页
   ·油红(Oil Red O)染色第57页
   ·化学试剂及培养基配方第57-59页
   ·引物及实验程序列表第59-64页
第三章 斑马鱼基因组中leg1存在leg1a和leg1b两个拷贝第64-73页
   ·引言第64页
   ·leg1基因的定位第64-65页
   ·leg1a和leg1b基因的结构分析及全长基因克隆第65-69页
   ·leg1a和leg1b起始密码子ATG上游序列分析第69-72页
   ·小结第72-73页
第四章 leg1基因及其蛋白序列在不同物种中的保守性分析第73-76页
   ·Leg1蛋白的结构域及其在脊椎动物中的进化关系第73-74页
   ·leg1的直向同源基因hleg1与mleg1的特征第74-75页
   ·小结第75-76页
第五章 leg1基因的表达谱第76-85页
   ·leg1基因在斑马鱼胚胎不同时期的表达第76-82页
     ·leg1基因RNA水平的表达分析第76-78页
     ·Leg1a和Leg1b蛋白水平的分析第78-81页
       ·Leg1抗体的制备第78-80页
       ·胚胎期Leg1蛋白的表达分析第80-81页
     ·胚胎期leg1a和leg1b的表达比例分析第81-82页
   ·leg1基因在成年斑马鱼不同组织中的表达分析第82-83页
     ·leg1在成鱼不同组织中的RNA表达特征第82页
     ·成鱼肝脏中leg1a和leg1b的表达比例分析第82-83页
     ·成鱼中Leg1蛋白表达特征第83页
   ·小结第83-85页
第六章 Leg1是一个新型的分泌蛋白第85-91页
   ·Leg1蛋白的信号肽预测第85页
   ·Leg1是一个肝脏合成的分泌蛋白第85-87页
   ·Leg1在分泌过程中的修饰和加工第87-89页
     ·Leg1蛋白糖基化位点的预测第88页
     ·Leg1蛋白二硫键位点的预测第88-89页
   ·小结第89-91页
第七章 Leg1蛋白在斑马鱼胚胎发育中的功能分析第91-106页
   ·morpholino的设计与检测第91-93页
   ·Leg1蛋白是斑马鱼胚胎肝脏发育的必需因子第93-98页
     ·Leg1抗体能够同时检测Leg1a和Leg1b蛋白第93页
     ·Leg1a和Leg1b蛋白都是斑马鱼胚胎肝脏发育的必需因子第93-96页
     ·Leg1a和Leg1b在斑马鱼胚胎肝脏发育中功能部分重叠第96-98页
     ·Leg1功能的敲低抑制肝的生长发育而非肝芽的起始第98页
   ·Leg1也是肠和外分泌胰腺延伸扩张的必需因子第98-100页
   ·具有功能的Leg1必须是一个分泌型的Leg1第100-101页
   ·leg1基因敲低抑制了肝脏细胞的增殖而致使肝脏变小第101-104页
   ·小结第104-106页
第八章 leg1基因突变体的筛选第106-112页
   ·基因突变第106页
   ·TILING筛选第106-109页
   ·leg1突变体的获得第109-111页
   ·小结第111-112页
第九章 结论与讨论第112-121页
   ·结论第112页
   ·讨论第112-121页
致谢第121-123页
参考文献第123-131页

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