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木薯主栽品种/品系农艺性状与分子标记的关联分析

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
目录第7-10页
1 前言第10-28页
   ·木薯概况第10-15页
     ·木薯的概述第10页
     ·木薯起源及其栽培区域第10页
     ·木薯主要经济利用价值第10-12页
     ·木薯产业化前景第12-13页
     ·木薯育种现状第13-15页
   ·分子标记的研究发展第15-20页
     ·分子标记辅助育种技术原理及其种类第15-16页
     ·SRAP标记技术研究进展第16-18页
       ·SRAP标记技术原理第16页
       ·SRAP标记技术在植物遗传多样性分析中的应用第16-18页
     ·EST-SSR标记技术研究进展第18-20页
       ·EST-SSR标记技术原理第18-19页
       ·EST-SSR标记技术在植物遗传多样性和品种鉴别上的应用第19页
       ·利用EST-SSR标记技术构建遗传连锁图谱第19-20页
   ·关联分析的发展第20-26页
     ·关联分析的概念第20页
     ·关联分析的基础第20-23页
       ·连锁不平衡的遗传学意义第20-21页
       ·连锁不平衡的度量第21-22页
       ·LD产生的原因及影响LD的因素第22-23页
     ·关联分析的基本策略第23-24页
       ·基于全基因组扫描的关联分析第23-24页
       ·基于候选基因的关联分析第24页
     ·关联分析在植物中的应用第24-26页
       ·QTL作图与关联分析的整合第24-25页
       ·关联分析与功能基因组学相结合第25-26页
   ·本研究的目的和意义第26-27页
   ·本研究的技术路线第27-28页
2 材料与方法第28-38页
   ·试验材料第28页
   ·木薯性状的观察与测量第28页
   ·分子标记引物第28-31页
   ·主要试剂及仪器第31页
   ·木薯基因组总DNA的提取第31页
   ·PCR反应体系及电泳检测第31-33页
     ·SRAP-PCR扩增反应第32页
     ·SRAP-PCR程序第32-33页
     ·EST-SSR反应体系第33页
     ·EST-SSR-PCR程序第33页
   ·非变性聚丙烯凝胶电泳第33-35页
   ·叶绿素提取方法第35页
   ·数据处理第35-38页
     ·数据整理第35页
     ·遗传聚类数据第35-36页
     ·连锁不平衡LD分析第36页
     ·群体结构分析第36页
     ·关联分析第36页
     ·农艺性状优异等位变异的分析方法第36-38页
3 结果与分析第38-53页
   ·DNA的提取与质控第38页
   ·SRAP标记的扩增多态性第38-39页
   ·EST-SSR标记的扩增多态性第39页
   ·品种群体的分子聚类分析第39-42页
     ·基于SRAP上的遗传聚类第39-40页
     ·基于EST-SSR的遗传聚类第40-41页
     ·综合两种标记上的遗传聚类第41-42页
   ·形态学聚类分析第42-48页
   ·亲子相关分析第48页
   ·群体标记的连锁不平衡分析第48-49页
   ·群体结构分析第49-50页
   ·多个农艺性状关联位点及优异等位变异分析第50-53页
     ·与性状相关联的SRAP标记第51页
     ·与性状相关联的EST-SSR标记第51页
     ·农艺性状优异等位变异的分析第51-53页
4 讨论第53-57页
   ·材料的选择第53页
   ·SRAP与EST-SSR的比较第53-54页
   ·SRAP和EST-SSR标记的关联分析第54-55页
   ·木薯的连锁不平衡特点第55页
   ·农艺性状关联等位基因分析第55-57页
5 结论第57-58页
参考文献第58-65页
致谢第65-69页
附表第69页

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