| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第15-37页 |
| 1.1 海洋病毒简介 | 第15-19页 |
| 1.1.1 海洋病毒的分类 | 第15-17页 |
| 1.1.2 海洋病毒的生命循环周期 | 第17-19页 |
| 1.2 海洋溶原性噬菌体的研究进展 | 第19-30页 |
| 1.2.1 溶原性侵染的意义 | 第21-24页 |
| 1.2.2 溶原性噬菌体的整合机制 | 第24-28页 |
| 1.2.3 海洋溶原性噬菌体与宿主细菌的相互作用 | 第28-30页 |
| 1.3 海洋细菌Citromicrobium bathyomarinum及其前噬菌体 | 第30-35页 |
| 1.3.1 C.bathyomarinum的生态分布和多样性 | 第30-31页 |
| 1.3.2 C.bathyomarinum的生态功能 | 第31-32页 |
| 1.3.3 C.bathyomarinum的基因组研究进展 | 第32-34页 |
| 1.3.4 C.bathyomarinum基因组中前噬菌体的研究进展 | 第34-35页 |
| 1.4 本论文的研究方向和意义 | 第35-37页 |
| 第二章 海洋细菌Citromicrobium bathyomarinum的基因组分析 | 第37-55页 |
| 2.1 前言 | 第37-38页 |
| 2.2 材料和方法 | 第38-41页 |
| 2.2.1 实验菌株的获得和培养 | 第38页 |
| 2.2.2 细菌全基因组的提取和测序 | 第38-39页 |
| 2.2.3 数据分析 | 第39-40页 |
| 2.2.4 C.bathyomarinum基因组中前噬菌体序列的识别 | 第40-41页 |
| 2.3 结果和讨论 | 第41-54页 |
| 2.3.1 C.bathyomarinum细菌的地理来源和分离环境 | 第41-44页 |
| 2.3.2 C.bathyomarinum细菌16S rRNA基因序列系统发育分析 | 第44-46页 |
| 2.3.3 C.bathyomarinum溶原性细菌的比例和分布 | 第46-47页 |
| 2.3.4 C.bathyomarinum细菌全基因组相似性和系统发育分析 | 第47-54页 |
| 2.4 本章总结与研究展望 | 第54-55页 |
| 第三章 C.bathyomarinum前噬菌体多样性研究 | 第55-83页 |
| 3.1 前言 | 第55-56页 |
| 3.2 材料和方法 | 第56-59页 |
| 3.2.1 前噬菌体的诱导、纯化和电镜观测 | 第56-57页 |
| 3.2.2 前噬菌体的DNA提取和测序 | 第57页 |
| 3.2.3 前噬菌体的序列分析 | 第57-58页 |
| 3.2.4 前噬菌体的整合位点识别及切除特性判断 | 第58-59页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第59-82页 |
| 3.3.1 前噬菌体类型的划分 | 第59-60页 |
| 3.3.2 前噬菌体的形态 | 第60-62页 |
| 3.3.3 前噬菌体的基因多样性 | 第62-75页 |
| 3.3.4 前噬菌体的整合和切除特性 | 第75-82页 |
| 3.4 本章总结与研究展望 | 第82-83页 |
| 第四章 C.bathyomarinum前噬菌体的生理生态特性及其与宿主细菌相互作用研究 | 第83-99页 |
| 4.1 前言 | 第83页 |
| 4.2 材料和方法 | 第83-87页 |
| 4.2.1 前噬菌体的诱导 | 第83-84页 |
| 4.2.2 溶原性噬菌体的交叉侵染 | 第84页 |
| 4.2.3 突变株的构建 | 第84-86页 |
| 4.2.4 引物设计和菌落PCR扩增 | 第86-87页 |
| 4.2.5 突变株和野生株的比较 | 第87页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第87-98页 |
| 4.3.1 C.bathyomarinum溶原性噬菌体的宿主范围 | 第87-91页 |
| 4.3.2 突变株的筛选结果和生理验证 | 第91-92页 |
| 4.3.3 野生株及其整合突变株的序列差异以及生理差异 | 第92-98页 |
| 4.4 本章总结与研究展望 | 第98-99页 |
| 第五章 本论文的主要结论、创新点和不足 | 第99-102页 |
| 5.1 本研究的主要结论 | 第99-100页 |
| 5.2 本研究的创新点 | 第100页 |
| 5.3 本论文的不足之处 | 第100-101页 |
| 5.4 展望 | 第101-102页 |
| 参考文献 | 第102-110页 |
| 硕士期间的学术论文 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
