| 摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| 1.1 海洋微型生物及其储碳过程与机制 | 第14-18页 |
| 1.1.1 海洋微型生物的概念 | 第14页 |
| 1.1.2 海洋碳循环 | 第14-15页 |
| 1.1.3 海洋固碳、储碳中微型生物的重要作用 | 第15-18页 |
| 1.2 海洋异养细菌及其生态作用 | 第18-20页 |
| 1.3 细菌生产力 | 第20-21页 |
| 1.4 细菌生长率 | 第21-28页 |
| 1.4.1 细菌生长率的概念及研究意义 | 第21-22页 |
| 1.4.2 传统测定细菌生长率的方法 | 第22-26页 |
| 1.4.3 细菌生长率与16S rRNA: rDNA的关系 | 第26-28页 |
| 1.5 本研究设计背景及研究意义 | 第28-30页 |
| 第二章 典型海洋异养细菌类群的生长率 | 第30-58页 |
| 2.1 前言 | 第30-34页 |
| 2.1.1 海洋玫瑰杆菌类群及其在海洋碳循环中的作用 | 第30-33页 |
| 2.1.2 研究区域 | 第33-34页 |
| 2.2 材料与方法 | 第34-44页 |
| 2.2.1 实验航次与样品采集 | 第34-36页 |
| 2.2.2 菌株的分离、纯化和鉴定 | 第36-38页 |
| 2.2.3 分批培养 | 第38页 |
| 2.2.4 细菌生长曲线的测定和细菌比生长速率的计算 | 第38-39页 |
| 2.2.5 核酸提取 | 第39-41页 |
| 2.2.6 样本16S rRNA: rDNA的测定 | 第41-44页 |
| 2.2.7 数据处理 | 第44页 |
| 2.3 实验结果 | 第44-54页 |
| 2.3.1 纯培养条件下的16S rRNA: rDNA | 第44-46页 |
| 2.3.2 纯培养条件下的rRNA: rDNA与生长率的关系 | 第46-48页 |
| 2.3.3 海区中玫瑰杆菌类群生长率 | 第48-52页 |
| 2.3.4 本研究与文献数据的16S rRNA: rDNA 比较 | 第52-54页 |
| 2.4 讨论 | 第54-58页 |
| 第三章 一株分离自东北印度洋新属的鉴定 | 第58-80页 |
| 3.1 前言 | 第58页 |
| 3.2 材料与方法 | 第58-65页 |
| 3.2.1 菌株分离 | 第58-59页 |
| 3.2.2 鉴定方法 | 第59-65页 |
| 3.2.2.1 菌落及细胞形态 | 第59-60页 |
| 3.2.2.2 实验菌株形态特征鉴定 | 第60页 |
| 3.2.2.3 菌株生理生化特性鉴定 | 第60-63页 |
| 3.2.2.4 呼吸醌测定(Tindall,1990a;1990b) | 第63页 |
| 3.2.2.5 菌株DNA提取、基因组DNA的G+C mol%测定 | 第63-64页 |
| 3.2.2.6 菌体脂肪酸含量分析 | 第64页 |
| 3.2.2.7 细菌极性脂的测定(Bligh et al.,1980;Tindall et al.,2007) | 第64-65页 |
| 3.2.2.8 16S rRNA基因和系统发育分析 | 第65页 |
| 3.3 实验结果与讨论 | 第65-79页 |
| 3.3.1 菌落及菌体形态 | 第65-66页 |
| 3.3.2 最适生长条件 | 第66-69页 |
| 3.3.3 菌株APIZYM、API20E、API 20NE以及Biolog微生物鉴定系统结果分析 | 第69页 |
| 3.3.4 菌株与Rhodospirillaceae科内模式菌株表型差异特征分析 | 第69-73页 |
| 3.3.5 JL30074~T的化学特性鉴定 | 第73-77页 |
| 3.3.5.1 脂肪酸分析 | 第73-75页 |
| 3.3.5.2 极性脂 | 第75页 |
| 3.3.5.3 呼吸醌 | 第75-76页 |
| 3.3.5.4 细胞基因组DNA的G+C m01% | 第76页 |
| 3.3.5.5 16S rRNA基因序列分析 | 第76-77页 |
| 3.3.6 鉴定总结 | 第77-79页 |
| 3.3.6.1 对比分析总结 | 第77-78页 |
| 3.3.6.2 新种描述 | 第78-79页 |
| 3.4 本章小结 | 第79-80页 |
| 第四章 本论文的主要结论、创新点、不足与展望 | 第80-82页 |
| 4.1 本研究的主要结论 | 第80页 |
| 4.2 创新点 | 第80页 |
| 4.3 不足之处 | 第80-81页 |
| 4.4 研究展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
