摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第1章 引言 | 第10-19页 |
1.1 中国鲎免疫生物学研究概述 | 第10-11页 |
1.1.1 中国鲎概述 | 第10页 |
1.1.2 中国鲎免疫系统简介 | 第10-11页 |
1.2 副溶血弧菌研究概述 | 第11-12页 |
1.2.1 副溶血弧菌的生物学特性 | 第11页 |
1.2.2 副溶血弧菌对水产动物的危害 | 第11-12页 |
1.3 miRNA | 第12-16页 |
1.3.1 miRNA简介 | 第12-14页 |
1.3.2 miRNA免疫调控研究进展 | 第14-16页 |
1.4 miRNA研究方法 | 第16-17页 |
1.4.1 miRNA传统研究方法 | 第16页 |
1.4.2 高通量测序技术 | 第16-17页 |
1.5 miRNA靶基因的研究 | 第17页 |
1.6 本文的研究内容和意义 | 第17-19页 |
第2章 中国鲎感染副溶血弧菌后血液中miRNA的表达变化分析 | 第19-37页 |
2.1 材料与方法 | 第19-23页 |
2.1.1 材料 | 第19-20页 |
2.1.2 方法 | 第20-23页 |
2.2 结果分析 | 第23-35页 |
2.2.1 测序RNA样品的质检 | 第23-24页 |
2.2.2 microRNA测序数据分析 | 第24-32页 |
2.2.3 差异miRNA靶基因的GO功能分析 | 第32-34页 |
2.2.4 高表达miRNA的靶基因预测及功能分析 | 第34-35页 |
2.3 讨论 | 第35-37页 |
2.3.1 miRNA的高通量测序 | 第35页 |
2.3.2 保守miRNA的分析 | 第35-36页 |
2.3.3 isc-miR-10_R-1功能预测 | 第36页 |
2.3.4 dan-miR-125_R+2_功能预测 | 第36-37页 |
第3章 副溶血弧菌感染中国鲎前后血液中差异miRNA的表达验证 | 第37-47页 |
3.1 材料和方法 | 第37-42页 |
3.1.1 实验动物及菌株 | 第37页 |
3.1.2 主要仪器及试剂 | 第37-38页 |
3.1.3 实验方法 | 第38-42页 |
3.2 结果与分析 | 第42-45页 |
3.2.1 miRNA的PCR鉴定 | 第42页 |
3.2.2 荧光定量表达结果 | 第42-45页 |
3.3 讨论 | 第45-47页 |
第4章 中国鲎(Tachypleus tridentatus)miRNA的生物信息学预测及家族鉴定 | 第47-59页 |
4.1 材料与方法 | 第47页 |
4.2 中国鲎miRNA的预测 | 第47-48页 |
4.3 miRNA家族归类及保守性分析 | 第48页 |
4.4 miRNA前体序列系统进化分析 | 第48-49页 |
4.5 结果与分析 | 第49-56页 |
4.5.1 中国鲎miRNA的预测结果 | 第49-54页 |
4.5.2 miRNA家族归类及保守性分析 | 第54-56页 |
4.5.3 中国鲎miR-10前体序列系统发育分析 | 第56页 |
4.6 讨论 | 第56-59页 |
4.6.1 miRNA的电子挖掘 | 第56-57页 |
4.6.2 miRNA的保守性分析 | 第57页 |
4.6.3 miRNA的多样性 | 第57页 |
4.6.4 miRNA的功能 | 第57-59页 |
第5章 中国鲎miRNA的功能预测 | 第59-67页 |
5.1 数据与方法 | 第59-61页 |
5.1.1 数据 | 第59页 |
5.1.2 靶基因预测算法 | 第59-61页 |
5.1.3 靶基因功能归类分析 | 第61页 |
5.2 结果与分析 | 第61-65页 |
5.2.1 miRNA的靶基因预测结果 | 第61页 |
5.2.2 miRNA靶基因功能分类 | 第61-65页 |
5.3 讨论 | 第65-67页 |
第6章 结论与展望 | 第67-69页 |
结论 | 第67-68页 |
展望 | 第68-69页 |
致谢 | 第69-70页 |
参考文献 | 第70-77页 |
附录 | 第77-96页 |
在学期间科研成果情况 | 第96页 |