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猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定、变异与重组及致病性研究

致谢第4-10页
英文缩写词表第10-11页
摘要第11-14页
文献综述第14-26页
    第一章 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)简介第14-21页
        1.1 PRRS的发现历史第14页
            1.1.1 PRRS在国外的出现与确认第14页
            1.1.2 PRRS传入中国第14页
        1.2 PRRS的流行及其危害第14-19页
            1.2.1 全球PRRS流行的时空顺序和范围第14-15页
            1.2.2 我国PRRS流行的三次高峰期及其原因第15-16页
            1.2.3 PRRS临床致病性差异第16-17页
            1.2.4 对不同类型猪群的影响第17页
            1.2.5 免疫抑制第17-19页
        1.3 PRRS的防控现状第19-21页
            1.3.1 欧美主要发达国家PRRS的防控第19-20页
            1.3.2 中国PRRS的防控第20-21页
    第二章 PRRS病毒(PRRSV)病原学研究进展第21-26页
        2.1 病毒分类地位第21页
            2.1.1 早期分类第21页
            2.1.2 最新分类第21页
        2.2 病毒基本特征第21-23页
            2.2.1 形态特征第21-22页
            2.2.2 基因组特征及化学组成第22页
            2.2.3 培养特性第22-23页
        2.3 毒株变异第23-24页
            2.3.1 毒株序列及致病性变异第23页
            2.3.2 病毒重组第23-24页
        2.4 病原学研究领域仍待解决的问题第24-26页
试验研究第26-75页
    第三章 PRRSV1、PRRSV2毒株单一和双重RT-PCR检测方法的建立第26-39页
        引言第26页
        3.1 材料与方法第26-30页
            3.1.1 菌株、载体及主要试剂第26-27页
            3.1.2 病毒株、阳性cDNA和临床病料第27页
            3.1.3 引物设计与合成第27页
            3.1.4 临床样品处理第27页
            3.1.5 病毒核酸提取第27-28页
                3.1.5.1 病毒RNA提取及反转录第27-28页
                3.1.5.2 病毒DNA提取第28页
            3.1.6 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR反应参数的优化第28-30页
                3.1.6.1 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR退火温度优化第28-29页
                3.1.6.2 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR引物浓度优化第29页
                3.1.6.3 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR循环数优化第29页
                3.1.6.4 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR特异性实验第29页
                3.1.6.5 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR基因敏感性实验第29页
                3.1.6.6 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR重复性实验第29页
                3.1.6.7 PRRSV2Nsp2基因鉴别RT-PCR方法的临床应用第29-30页
            3.1.7 PRRSV1和PRRSV2ORF5基因双重RT-PCR反应参数的优化第30页
                3.1.7.1 RRSV1和PRRSV2ORF5基因单一RT-PCR退火温度优化第30页
                3.1.7.2 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR扩增第30页
                3.1.7.3 RRSV1和PRRSV2双重PCR特异性分析第30页
                3.1.7.4 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR敏感性试验第30页
                3.1.7.5 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR稳定性试验第30页
                3.1.7.6 PRRSV1和PRRSV2单一和双重RT-PCR的检测结果吻合性比较第30页
        3.2 结果第30-37页
            3.2.1 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR最佳反应参数第30-34页
                3.2.1.1 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR最佳退火温度第30-31页
                3.2.1.2 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR最佳引物浓度和循环数第31-32页
                3.2.1.3 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR特异性检测第32-33页
                3.2.1.4 Nsp2鉴别RT-PCRcDNA最小检出量分别为2.20×10-1ng~3.10×10-1ng第33页
                3.2.1.5 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR重复性较好第33-34页
                3.2.1.6 PRRSV2Nsp2鉴别RT-PCR临床样品检测第34页
            3.2.2 RRSV1和PRRSV2ORF5基因单一RT-PCR扩增出预期目的片段第34-35页
            3.2.3 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR最佳反反应参数第35页
            3.2.4 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR具有良好特异性第35-36页
            3.2.5 双重RT-PCR最小检出量分别为3.39×10-2ng和3.67×10-2ng第36页
            3.2.6 RRSV1和PRRSV2双重RT-PCR具有良好稳定性第36-37页
            3.2.7 双重RT-PCR的检测结果良好第37页
        3.3 分析与讨论第37-39页
    第四章 PRRSV2不同类型毒株的分离鉴定及重组、变异分析第39-50页
        引言第39页
        4.1 材料与方法第39-42页
            4.1.1 病料采集与处理第39页
            4.1.2 细胞、菌株、载体、毒株及抗体第39-40页
            4.1.3 主要试剂第40页
            4.1.4 试验动物第40页
            4.1.5 引物设计与合成第40页
                4.1.5.1 ORF5基因扩增引物第40页
                4.1.5.2 Nsp2基因鉴别引物第40页
                4.1.5.3 全基因序列扩增引物第40页
                4.1.5.4 其他引物第40页
            4.1.6 病毒分离第40页
            4.1.7 分离物的RT-PCR鉴定第40-41页
            4.1.8 分离物外源病毒的检测第41页
            4.1.9 间接免疫荧光(IFA)鉴定第41页
            4.1.10 分离毒株生长曲线测定第41页
            4.1.11 目的基因克隆与测序第41-42页
            4.1.12 全基因组序列分析第42页
            4.1.13 全基因组重组特征分析第42页
            4.1.14 分离物对断奶仔猪的致病性第42页
        4.2 结果第42-48页
            4.2.1 成功获得20株流行毒株第42页
            4.2.2 RT-PCR检测结果呈PRRSV阳性第42页
            4.2.3 间接免疫荧光试验(IFA)检测PRRSV呈阳性第42-44页
            4.2.4 三株分离毒株增殖特征存在差异第44页
            4.2.5 分离毒株核苷酸相似性存在差异第44-45页
                4.2.5.1 Nsp2基因核苷酸相似性分析第44页
                4.2.5.2 ORF5基因核苷酸相似性分析第44-45页
                4.2.5.3 三株流行毒株全基因序列与NADC30株遗传进化距离较近第45页
                4.2.5.4 三株PRRSV2分离毒均存在重组,且重组模式不一致第45页
            4.2.6 两个分离物的致病性有明显差异第45-48页
                4.2.6.1 不同毒株攻毒后猪只体温变化及平均日增重差异第45-47页
                4.2.6.2 肺脏剖检及组织学病理变化明显第47-48页
                4.2.6.3 人工感染猪病毒血症及脏器病毒载量与采样时间有关第48页
        4.3 分析与讨论第48-50页
    第五章 PRRSV1毒株的分离鉴定、全序列分析及分子流行病学调查第50-60页
        引言第50页
        5.1 材料与方法第50-52页
            5.1.1 病料采集与处理第50页
            5.1.2 细胞、菌株、载体、PRRSV1阳性cDNA第50页
            5.1.3 主要试剂第50页
            5.1.4 引物设计与合成第50-51页
            5.1.5 RT-PCR检测第51页
            5.1.6 病毒分离第51-52页
            5.1.7 基因克隆与测序第52页
            5.1.8 分离毒株基因组序列分析第52页
        5.2 结果第52-56页
            5.2.1 临床样品RT-PCR扩增出预期片段第52页
            5.2.2 成功分离出一株PRRSV1流行毒株第52-54页
            5.2.3 分离毒株基因序列与PRRSV1相似性性较高第54-56页
                5.2.3.1 6株分离株ORF5基因序列比对结果均为PRRSV1第54页
                5.2.3.2 分离毒株HENZMD-10全基因序列比对与PRRSV1毒株相似性较高第54页
                5.2.3.3 PRRSV1分离株HENZMD-10非结构基因、结构基因存在变异第54-56页
                5.2.3.4 PRRSV1分离株HENZMD-10全基因遗传进化分析第56页
        5.3 分析与讨论第56-60页
    第六章 不同毒株PRRSV的体外交叉中和试验第60-66页
        引言第60页
        6.1 材料与方法第60-63页
            6.1.1 主要试剂材料及实验动物第60页
            6.1.2 毒株、细胞第60-61页
            6.1.3 病毒增殖、纯化第61页
            6.1.4 增殖病毒毒价测定第61页
            6.1.5 病毒纯化及免疫用抗原制备第61页
            6.1.6 免疫接种及制备兔抗PRRSV高免血清第61页
            6.1.7 兔抗PRRSV高免血清中和效价测定第61-62页
            6.1.8 不同毒株体外交叉中和试验测定第62-63页
        6.2 结果第63-65页
            6.2.1 接毒细胞出现明显细胞病变第63页
            6.2.2 TCID50结果第63页
            6.2.3 兔抗高免血清中和效价分别为1:50、1:17、1:58第63-64页
            6.2.4 交叉中和试验显示JXA1-R高免血清对不同毒株的保护力最高第64-65页
        6.3 分析与讨论第65-66页
    第七章 PRRSV和GETV双重RT-PCR检测方法的建立与应用第66-75页
        引言第66-67页
        7.1 材料与方法第67-69页
            7.1.1 病毒株及临床病料第67页
            7.1.2 试剂、载体第67页
            7.1.3 引物设计与合成第67页
            7.1.4 病料处理第67-68页
            7.1.5 病毒核酸提取第68页
                7.1.5.1 病毒RNA提取及反转录第68页
                7.1.5.2 病毒DNA提取第68页
            7.1.6 单一PCR扩增及基因序列验证第68页
            7.1.7 双重PCR扩增第68-69页
            7.1.8 双重RT-PCR特异性实验第69页
            7.1.9 双重RT-PCR敏感性实验第69页
            7.1.10 双重RT-PCR重复性试验第69页
            7.1.11 双重RT-PCR方法的临床应用及与单一RT-PCR方法的吻合性比较第69页
        7.2 结果第69-73页
            7.2.1 PRRSV和GETV单一RT-PCR成功扩增出预期片段第69-70页
            7.2.2 双重RT-PCR最佳反应体系及条件第70-71页
            7.2.3 双重RT-PCR具有特异性第71页
            7.2.4 双重RT-PCR最小检出量分别为2.48×10-4~2.50×10-5ng第71-72页
            7.2.5 双重RT-PCR具有良好可重复性第72页
            7.2.6 临床样品的检测应用第72-73页
        7.3 分析与讨论第73-75页
全文总结第75-76页
参考文献第76-93页
ABSTRACT第93-97页
附:作者读研期间发表的论文及其他成果第98-99页

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