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宽皮柑橘种质资源的多样性研究及重要农艺性状的全基因组关联分析

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第1章 文献综述第11-21页
    前言第11页
    1.1 我国柑橘的生产现状及存在的问题第11-12页
    1.2 柑橘育种发展简史第12-14页
        1.2.1 常规杂交育种第12页
        1.2.2 芽变和实生选种第12-13页
        1.2.3 诱变育种第13页
        1.2.4 生物技术育种第13-14页
        1.2.5 分子技术育种第14页
    1.3 柑橘重要农艺性状的遗传特点第14-15页
    1.4 宽皮柑橘种质资源遗传多样性研究进展第15-16页
    1.5 基于GBS技术检测全基因组SNPs第16-17页
    1.6 全基因组关联分析的研究概况第17-19页
        1.6.1 群体材料选择第18页
        1.6.2 群体结构及分析模型第18页
        1.6.3 连锁不平衡第18-19页
        1.6.4 表型鉴定第19页
    1.7 研究目的和意义第19-21页
第2章 基于形态学标记的240份宽皮柑橘种质资源遗传多样性分析及综合评价第21-33页
    2.1 材料与方法第21-22页
        2.1.1 试验材料第21页
        2.1.2 数据收集第21-22页
        2.1.3 数据分析第22页
    2.2 结果与分析第22-31页
        2.2.1 宽皮柑橘表型性状遗传多样性第22-25页
        2.2.2 基于240份宽皮柑橘表型数据的聚类分析第25-26页
        2.2.3 宽皮柑橘表型性状的综合评价第26-31页
    2.3 讨论第31-33页
        2.3.1 宽皮柑橘的表型多样性分析第31页
        2.3.2 基于表型性状对宽皮柑橘的综合评价第31-33页
第3章 基于GBS技术开发的SNP标记的宽皮柑橘种质资源遗传多样性和群体结构分析第33-43页
    3.1 材料与方法第33-36页
        3.1.1 试验材料第33页
        3.1.2 基因组DNA的提取第33页
        3.1.3 酶切建库第33-34页
        3.1.4 测序数据统计与质量分析第34-35页
        3.1.5 实验建库评估第35页
        3.1.6 SNP标记的鉴定第35页
        3.1.7 群体进化树及主成分分析第35-36页
    3.2 结果与分析第36-41页
        3.2.1 酶切效率第36页
        3.2.2 测序数据统计与质量评估第36-37页
        3.2.3 SNP的检测第37-39页
        3.2.4 群体结构分析第39-41页
    3.3 讨论第41-43页
第4章 基于SNP标记的宽皮柑橘种质资源主要性状的全基因组关联分析第43-63页
    4.1 材料与方法第43-44页
        4.1.1 试验材料第43页
        4.1.2 方法第43-44页
    4.2 结果与分析第44-58页
        4.2.1 果实大小相关性状的全基因组关联分析第44-45页
        4.2.2 果皮性状的全基因组关联分析第45-48页
        4.2.3 果实品质相关性状的全基因组关联分析第48-50页
        4.2.4 种子胚型性状的全基因组关联分析第50-52页
        4.2.5 花药颜色性状的全基因组关联分析第52-55页
        4.2.6 囊瓣数性状的全基因组关联分析第55-56页
        4.2.7 果形指数性状的全基因组关联分析第56-58页
    4.3 讨论第58-63页
第5章 结论与展望第63-65页
    5.1 结论第63-64页
        5.1.1 基于形态学标记的240份宽皮柑橘种质资源遗传多样性分析及综合评价第63页
        5.1.2 基于GBS技术开发的SNP标记的宽皮柑橘种质资源遗传多样性和群体结构分析第63页
        5.1.3 基于SNP标记的宽皮柑橘种质资源主要性状的全基因组关联分析第63-64页
    5.2 展望第64-65页
参考文献第65-77页
附录1 文中缩写第77-78页
附录2 研究材料信息第78-89页
致谢第89-91页
在校期间发表论文及参研课题第91页

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