| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第一章 前言 | 第16-31页 |
| 1 核盘菌的危害与防治 | 第16-22页 |
| 1.1 核盘菌的危害与致病机理 | 第16-18页 |
| 1.2 菌核病防治 | 第18-22页 |
| 1.2.1 化学防治 | 第18-19页 |
| 1.2.2 农业防治措施 | 第19-20页 |
| 1.2.3 生物防治 | 第20-22页 |
| 2 真菌病毒 | 第22-28页 |
| 2.1 真菌病毒分类概况 | 第22-25页 |
| 2.2 真菌病毒的传播 | 第25-26页 |
| 2.3 真菌病毒与寄主的互作 | 第26-27页 |
| 2.4 第二代测序技术与真菌病毒的研究 | 第27-28页 |
| 3 核盘菌病毒 | 第28-29页 |
| 4 真菌病毒在植病生防中的应用 | 第29-30页 |
| 5 本研究的意义 | 第30-31页 |
| 第二章 核盘菌弱毒菌株AH16中含真菌病毒鉴定 | 第31-57页 |
| 1 材料 | 第31页 |
| 2 方法 | 第31-38页 |
| 2.1 菌株的生物学特性测定 | 第31-32页 |
| 2.2 核酸提取及纯化 | 第32-34页 |
| 2.3 病毒序列的克隆与分析 | 第34-36页 |
| 2.4 病毒粒子的提取和观察 | 第36-37页 |
| 2.5 核盘菌原生质体制备和再生 | 第37页 |
| 2.6 病毒水平传播及病毒粒子转染核盘菌原生质体 | 第37-38页 |
| 2.7 病毒结构蛋白肽指纹图谱分析 | 第38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-54页 |
| 3.1 核盘菌菌株AH16的dsRNA片段 | 第38-39页 |
| 3.2 S-dsRNA片段的分析 | 第39-41页 |
| 3.2.1 S-dsRNA全长c DNA序列 | 第39页 |
| 3.2.2 Ss MV4/AH16系统进化分析 | 第39-41页 |
| 3.3 L-dsRNA片段序列分析 | 第41-46页 |
| 3.3.1 L-dsRNA全长c DNA序列 | 第41页 |
| 3.3.2 两条序列的结构特征 | 第41-43页 |
| 3.3.3 SsBRV2系统进化分析 | 第43-46页 |
| 3.4 SsBRV2的病毒粒子 | 第46-48页 |
| 3.4.1 病毒粒子形态 | 第46-47页 |
| 3.4.2 从病毒粒子中提取到dsRNA | 第47-48页 |
| 3.5 通过原生质体再生技术不能获得AH16的脱毒再生后代 | 第48页 |
| 3.6 SsBRV2的生物学特性 | 第48-53页 |
| 3.6.1 SsBRV2的水平传播受到寄主营养体不亲和性限制 | 第49页 |
| 3.6.2 SsBRV2通过病毒粒子可以转染Ep-1PNA367R | 第49-50页 |
| 3.6.3 感染SsBRV2的Ep-1PNA367RVT致病力减弱 | 第50-51页 |
| 3.6.4 Ep-1PNA367RVT生长缓慢，丧失产菌核能力 | 第51-53页 |
| 3.7 SsBRV2病毒粒子蛋白肽指纹图谱分析 | 第53-54页 |
| 4 结论与讨论 | 第54-57页 |
| 4.1 dsRNA病毒和ss RNA线粒体病毒同时感染核盘菌 | 第54-55页 |
| 4.2 SsBRV2属于待定科Botybirnaviridae新成员 | 第55页 |
| 4.3 核盘菌线粒体病毒Ss MV4/AH16与Ss MV1/HC025的比较 | 第55-56页 |
| 4.4 SsBRV2可单独导致核盘菌致病力发生衰退 | 第56-57页 |
| 第三章 真菌病毒SsBRV2与Ss BRV1影响核盘菌基因表达的比较分析 | 第57-93页 |
| 1 材料 | 第57-58页 |
| 2 方法 | 第58-59页 |
| 2.1 核盘菌生物学特性测定 | 第58页 |
| 2.2 病毒的水平传播 | 第58页 |
| 2.3 转录组测序 | 第58-59页 |
| 2.3.1 转录组测序总RNA的准备 | 第58页 |
| 2.3.2 建库测序 | 第58页 |
| 2.3.3 数据分析 | 第58-59页 |
| 3 结果与分析 | 第59-90页 |
| 3.1 Ep-1PNA367BRV2和Ep-1PNA367BRV1菌株所携带病毒的确认 | 第59-61页 |
| 3.2 菌株Ep-1PNA367BRV2、Ep-1PNA367BRV1和Ep-1PNA367致病力及菌落形态比较 | 第61-63页 |
| 3.3 核盘菌Ep-1PNA367、Ep-1PNA367BRV2和Ep-1PNA367BRV1转录组测序数据分析 | 第63-65页 |
| 3.3.1 原始数据处理 | 第63-64页 |
| 3.3.2 差异基因筛选 | 第64-65页 |
| 3.4 GO注释分析 | 第65-70页 |
| 3.4.1 Ep-1PNA367BRV2与Ep-1PNA367差异基因的GO注释分析 | 第66-68页 |
| 3.4.2 Ep-1PNA367BRV1与Ep-1PNA367之间GO分析 | 第68-70页 |
| 3.5 KEGG Pathway分析 | 第70-73页 |
| 3.5.1 Ep-1PNA367BRV2与Ep-1PNA367之间KEGG分析 | 第70-72页 |
| 3.5.2 Ep-1PNA367BRV1与Ep-1PNA367之间KEGG分析 | 第72-73页 |
| 3.6 转录组中特定差异表达基因分析 | 第73-90页 |
| 3.6.1 Ep-1PNA367BRV2和Ep-1PNA367BRV1与Ep-1PNA367之间相比，变化趋势相同的差异表达基因Go和KEGG分析 | 第74-75页 |
| 3.6.2 同与Ep-1PNA367相比，Ep-1PNA367BRV2中与Ep-1PNA367BRV1比较特异性变化基因Go和KEGG分析 | 第75-90页 |
| 4 结论与讨论 | 第90-93页 |
| 全文结论和展望 | 第93-95页 |
| 1.结论 | 第93-94页 |
| 1.1 证明核盘菌AH16菌株同时感染了两种真菌病毒，阐明了它们的基因组信息 | 第93页 |
| 1.2 明确了真菌病毒SsBRV2/AH16的分类地位 | 第93页 |
| 1.3 明确了真菌病毒SsBRV2是导致核盘菌弱毒的一个决定因子 | 第93页 |
| 1.4 阐明了真菌病毒SsBRV2和Ss BRV1对于核盘菌基因表达的影响，为认识其导致核盘菌致病力衰退提供了有益线索 | 第93-94页 |
| 2.展望 | 第94-95页 |
| 2.1 真菌病毒之间相互作用机制研究 | 第94页 |
| 2.2 重点基因深入研究 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-112页 |
| 附表1 本研究用到的引物 | 第112-113页 |
| 附表2 肽指纹图谱鉴定纯化的SsBRV2病毒粒子的蛋白 | 第113-124页 |
| 附表3 Ep-1PNA367BRV2和Ep-1PNA367BRV1变化趋势相同的差异表达基因 | 第124-133页 |
| 附表4 dsRNA片段序列克隆 | 第133-163页 |
| 附录1 培养基和试剂 | 第163-165页 |
| 附录2 发表文章情况 | 第165-166页 |
| 致谢 | 第166-168页 |
