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蜡状芽胞杆菌群中新型细菌素资源的挖掘

摘要第8-12页
Abstract第12-15页
缩略语表第16-17页
1 前言第17-39页
    1.1 细菌素第17-33页
        1.1.1 细菌素的简介及分类第17-19页
        1.1.2 羊毛硫细菌素第19-24页
        1.1.3 Sactipeptide类细菌素第24-27页
        1.1.4 细菌素的作用方式第27-30页
            1.1.4.1 作用细胞被膜的机制第27-30页
            1.1.4.2 抑制细菌体内代谢过程的机制第30页
        1.1.5 细菌素的应用第30-33页
            1.1.5.1 细菌素在食品行业的应用第31-32页
            1.1.5.2 细菌素在医药行业的应用第32-33页
        1.1.6 基于基因组学预测、挖掘新型细菌素的研究第33页
    1.2 蜡状芽胞杆菌种群第33-38页
        1.2.1 蜡状芽胞杆菌种群的组成第33-34页
        1.2.2 蜡状芽胞杆菌种群中细菌素的研究概况第34-38页
    1.3 研究目的与意义第38-39页
2 材料和方法第39-52页
    2.1 实验材料第39-43页
        2.1.1 菌株、质粒和引物第39-41页
        2.1.2 使用抗生素第41-42页
        2.1.3 培养基第42页
        2.1.4 试剂和仪器第42-43页
    2.2 实验方法第43-52页
        2.2.1 DNA常规操作第43-44页
            2.2.1.1 苏云金芽胞杆菌总DNA的制备第43-44页
            2.2.1.2 DNA的体外重组操作第44页
            2.2.1.3 苏云金芽胞杆菌感受态细胞的制备及电转化第44页
        2.2.2 RNA的提取及反转录PCR第44-46页
            2.2.2.1 Trizol提取苏云金芽胞杆菌总RNA第44-45页
            2.2.2.2 RNA的消化第45页
            2.2.2.3 反转录PCR(Reverse transcription PCR,RT-PCR)第45-46页
        2.2.3 细菌素合成基因簇的预测及羊毛硫细菌素合成基因簇的分类第46页
        2.2.4 细菌素合成基因簇中启动子与终止子的预测第46-47页
        2.2.5 抑菌活性测定第47页
            2.2.5.1 琼脂扩散法第47页
            2.2.5.2 微量稀释法测定最低抑菌活性浓度第47页
        2.2.6 抑菌活性物质的纯化、鉴定第47-49页
            2.2.6.1 抑菌物质产生时期的验证第47-48页
            2.2.6.2 抑菌物质粗提液制备第48页
            2.2.6.3 HPLC分析第48-49页
            2.2.6.4 质谱分析第49页
        2.2.7 抑菌物质理化性质测定第49-50页
            2.2.7.1 蛋白酶对活性的影响第49页
            2.2.7.2 温度对活性的影响第49-50页
            2.2.7.3 pH对活性的影响第50页
        2.2.8 细菌素抑制芽胞萌发的测定第50页
        2.2.9 菌落总数(CFU/mL)的测定方法第50页
        2.2.10 产耐酸碱、高温的细菌素的菌株筛选第50-51页
        2.2.11 插入突变体库的构建第51页
        2.2.12 抗Thuricin 67突变体的筛选方法第51-52页
3 结果与分析第52-91页
    3.1 蜡状芽胞杆菌种群中细菌素合成基因簇的预测及分类第52-53页
    3.2 羊毛硫细菌素的研究第53-85页
        3.2.1 羊毛硫细菌素Thuricin 4A-4及Thuricin 4A-4D的功能验证第55-65页
            3.2.1.1 羊毛硫细菌素Thuricin 4A合成基因簇的生物信息学分析第55-57页
            3.2.1.2 羊毛硫细菌素Thuricin 4A合成基因簇的转录验证第57-58页
            3.2.1.3 羊毛硫细菌素Thuricin 4A合成基因簇的异源表达第58-59页
            3.2.1.4 Thuricin 4A-4及Thuricin 4A-4D的纯化及鉴定第59-61页
            3.2.1.5 Thuricin 4A-4及Thuricin 4A-4D的理化性质测定第61-62页
            3.2.1.6 Thuricin 4A-4及Thuricin 4A-4D抑菌活性的测定第62-63页
            3.2.1.7 thiI基因的功能验证第63-65页
        3.2.2 羊毛硫细菌素Ticin的功能验证第65-74页
            3.2.2.1 筛选分泌耐高温及酸碱抑菌活性物质的B.cereus group菌株第65-66页
            3.2.2.2 B.thuringiensis BMB3201基因组测序及细菌素合成基因簇的分析第66页
            3.2.2.3 抑菌活性物质的纯化、鉴定第66-70页
            3.2.2.6 Ticin A1,Ticin A3及Ticin A4抑菌活性的测定第70-72页
            3.2.2.7 抑菌物质的稳定性测定第72-74页
            3.2.2.8 抑菌物质的作用模式第74页
        3.2.3 双组份羊毛硫细菌素Thusin的功能验证第74-85页
            3.2.3.1 双组份羊毛硫细菌素Thusin合成基因簇的生物信息学分析第74-76页
            3.2.3.2 Thusin的纯化、鉴定第76-80页
            3.2.3.3 Thsα与Thsβ最佳作用比例的验证第80-81页
            3.2.3.4 抑菌活性的测定第81-83页
            3.2.3.5 抑菌物质稳定性的测定第83-84页
            3.2.3.6 Thusin抑制芽胞萌发的测定第84-85页
    3.3 Sactipeptide类细菌素的研究第85-91页
        3.3.1 Thuricin 67合成基因簇的生物信息学分析第85-86页
        3.3.2 Thuricin 67合成基因簇的克隆及异源表达第86页
        3.3.3 活性物质的纯化、鉴定第86-88页
        3.3.4 Thuricin 67抑菌活性的鉴定第88-90页
        3.3.5 Thuricin 67作用靶标的鉴定第90-91页
4 结论与讨论第91-97页
参考文献第97-107页
致谢第107-109页
已发表和待发表文献第109-110页
附表第110-116页

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