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肿瘤特异超级增强子PLAU-SE及其组分的鉴定和功能研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
第1章 绪论第8-17页
    1.1 课题背景及研究的目的和意义第8-9页
    1.2 SE的相关研究第9-12页
        1.2.1 SE的定义第9页
        1.2.2 SE的鉴定第9-10页
        1.2.3 SE的结构第10-11页
        1.2.4 SE及其组分的功能第11页
        1.2.5 SE与疾病发生第11-12页
    1.3 CRISPR-CAS9基因定向编辑技术第12-14页
        1.3.1 CRISPR-Cas9技术简介第12-13页
        1.3.2 CRISPR-Cas9技术的应用范围第13-14页
    1.4 染色质免疫共沉淀(CHIP)第14-15页
        1.4.1 染色质免疫共沉淀技术原理及应用简介第14-15页
    1.5 本文主要研究内容及技术路线第15-17页
        1.5.1 本文主要研究内容第15-16页
        1.5.2 技术路线第16-17页
第2章 实验材料与方法第17-34页
    2.1 实验材料第17-20页
        2.1.1 实验动物第17页
        2.1.2 实验细胞系、载体与菌株第17页
        2.1.3 实验所用试剂第17-19页
        2.1.4 主要实验仪器第19-20页
        2.1.5 主要相关生物信息数据库及软件第20页
    2.2 实验方法第20-34页
        2.2.1 分子实验部分第20-25页
        2.2.2 肿瘤的样本制备及切片第25-26页
        2.2.3 免疫荧光染色及HE染色第26-27页
        2.2.4 切片原位杂交第27-29页
        2.2.5 染色质免疫共沉淀(chIP)第29-30页
        2.2.6 细胞的常规培养,传代和冻存第30页
        2.2.7 细胞转染第30-31页
        2.2.8 单克隆细胞系的建立及筛选第31页
        2.2.9 细胞生物学特性检测第31-33页
        2.2.10 体内成瘤实验部分第33-34页
第3章 PLAU-SE对PLAU基因的调控研究第34-44页
    3.1 引言第34-35页
    3.2 针对PLAU-SE全长的CRISPR-CAS9载体构建第35-37页
    3.3 脂质体介导的瞬时转染及范围内基因变化检测第37-38页
    3.4 免疫荧光染色确定SE对PLAU基因在蛋白水平的调控第38-39页
    3.5 PLAU-SE的组分鉴别和功能分析第39-40页
    3.6 转录因子结合位点及低氧应答元件的位置预测第40-41页
    3.7 RT-PCR检测低氧对PLAU基因的影响第41-42页
    3.8 CHIP检测低氧及顺铂处理前后PLAU-SE的组蛋白修饰变化第42-43页
    3.9 本章小结第43-44页
第4章 PLAU-SE敲除对HELA细胞生物学特性的影响第44-52页
    4.1 引言第44-45页
    4.2 MTT法检测PLAU-SE对细胞增殖能力的影响第45页
    4.3 平板成克隆实验检测PLAU-SE敲除对细胞成克隆能力的影响第45-47页
    4.4 划痕愈合实验检测PLAU-SE敲除对细胞迁移能力的影响第47-48页
    4.5 黏附实验检测PLAU-SE敲除对细胞-胞外基质黏附能力的影响第48页
    4.6 TRANSWELL实验检测PLAU-SE敲除对细胞侵袭能力的影响第48-49页
    4.7 IC50实验检测PLAU-SE敲除对细胞抗顺铂能力的影响第49-50页
    4.8 ANNEXINV-PI双染色法测定PLAU-SE敲除对细胞凋亡的影响第50-51页
    4.9 本章小结第51-52页
第5章 PLAU-SE敲除在荷瘤模型内的影响第52-61页
    5.1 引言第52-53页
    5.2 荷瘤鼠模型构建第53页
    5.3 肿瘤块分析第53-55页
    5.4 HE染色观察肿瘤块细胞形态第55-56页
    5.5 原位杂交染色检测PLAU基因在肿瘤组织中的表达第56-58页
    5.6 免疫荧光染色检测PLAU蛋白在肿瘤组织中的表达第58-59页
    5.7 本章讨论及总结第59-61页
结论第61-63页
参考文献第63-70页
致谢第70页

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