| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-28页 |
| 1.1 硫化氢简介 | 第13-16页 |
| 1.1.1 硫化氢的危害 | 第13-14页 |
| 1.1.2 硫化氢的来源 | 第14-16页 |
| 1.1.2.1 自然界来源 | 第14-15页 |
| 1.1.2.2 人类活动来源 | 第15-16页 |
| 1.2 脱硫技术的发展 | 第16页 |
| 1.3 脱氮硫杆菌简介 | 第16-20页 |
| 1.3.1 脱氮硫杆菌的生理特征 | 第16-17页 |
| 1.3.2 脱氮硫杆菌氧化H2S的反应 | 第17页 |
| 1.3.3 脱氮硫杆菌的应用 | 第17-18页 |
| 1.3.4 脱氮硫杆菌硫代谢途径 | 第18-20页 |
| 1.4 SQR蛋白 | 第20-21页 |
| 1.5 本研究所涉及的技术手段 | 第21-26页 |
| 1.5.1 同源建模 | 第21-22页 |
| 1.5.2 分子模拟 | 第22-25页 |
| 1.5.2.1 分子力学 | 第23页 |
| 1.5.2.2 分子动力学 | 第23-25页 |
| 1.5.3 蛋白模型的评价 | 第25-26页 |
| 1.6 本课题的研究意义和内容 | 第26-28页 |
| 第二章 脱氮硫杆菌SQR蛋白的亚细胞定位研究 | 第28-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第28页 |
| 2.1.1 在线预测程序 | 第28页 |
| 2.1.2 SQR蛋白氨基酸序列 | 第28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-29页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第29-35页 |
| 2.3.1 SQR的疏水性分析 | 第29-31页 |
| 2.3.2 SQR跨膜区预测分析 | 第31-32页 |
| 2.3.3 SQR信号肽预测 | 第32-34页 |
| 2.3.4 SQR细胞位置分析 | 第34-35页 |
| 2.4 本章小结 | 第35-36页 |
| 第三章 SQR蛋白的同源建模和模型评价 | 第36-46页 |
| 3.1 实验材料 | 第36页 |
| 3.2 实验方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 SQR蛋白的同源建模 | 第36-38页 |
| 3.2.1.1 模板序列的搜索 | 第36-37页 |
| 3.2.1.2 目标序列与模板序列的多重比对 | 第37-38页 |
| 3.2.1.3 SQR蛋白模型的评价 | 第38页 |
| 3.2.2 分子力学及分子动力学优化 | 第38-39页 |
| 3.2.3 蛋白模型的二次评价 | 第39页 |
| 3.2.4 SQR蛋白模型与配体的拟合 | 第39页 |
| 3.2.5 相互作用分析 | 第39-40页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第40-45页 |
| 3.3.1 目标序列与模板序列的比对结果 | 第40页 |
| 3.3.2 SQR蛋白模型的评价 | 第40-41页 |
| 3.3.3 分子动力学优化 | 第41-43页 |
| 3.3.4 SQR蛋白模型的二次评价 | 第43-44页 |
| 3.3.5 SQR蛋白模型的结构分析 | 第44-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 突变体模型的构建及相互作用分析 | 第46-54页 |
| 4.1 实验材料 | 第46页 |
| 4.2 实验方法 | 第46-47页 |
| 4.2.1 突变体模型的构建 | 第46页 |
| 4.2.2 突变体模型的优化 | 第46-47页 |
| 4.2.3 突变体模型的评价 | 第47页 |
| 4.2.4 SQR蛋白及突变体模型与模板的拟合 | 第47页 |
| 4.2.5 相互作用分析 | 第47页 |
| 4.3 结果与分析 | 第47-53页 |
| 4.3.1 模型的优化与评价 | 第47-48页 |
| 4.3.2 氢键与疏水相互作用分析 | 第48-52页 |
| 4.3.3 静电势分析 | 第52-53页 |
| 4.4 本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 SQR蛋白及突变体的异源表达 | 第54-69页 |
| 5.1 实验材料 | 第54-56页 |
| 5.1.1 化学试剂、酶和试剂盒 | 第54页 |
| 5.1.2 菌株和质粒 | 第54-55页 |
| 5.1.3 培养基 | 第55页 |
| 5.1.4 抗生素与诱导表达剂 | 第55页 |
| 5.1.5 常用溶液 | 第55-56页 |
| 5.2 实验方法 | 第56-63页 |
| 5.2.1 SQR基因定点突变 | 第56-59页 |
| 5.2.1.1 SQR定点突变引物设计 | 第56-57页 |
| 5.2.1.2 定点突变PCR | 第57页 |
| 5.2.1.3 突变质粒的筛选与验证 | 第57-58页 |
| 5.2.1.4 突变质粒的提取与鉴定 | 第58-59页 |
| 5.2.2 SQR蛋白及突变体的小量表达 | 第59-60页 |
| 5.2.2.1 SQR蛋白及突变体的小量表达 | 第59页 |
| 5.2.2.2 SDS-PAGE分析 | 第59-60页 |
| 5.2.3 SQR蛋白及突变体的大量表达与纯化 | 第60-62页 |
| 5.2.3.1 SQR蛋白及突变体的大量表达 | 第60页 |
| 5.2.3.2 SQR蛋白及突变体的纯化 | 第60-61页 |
| 5.2.3.3 SQR蛋白及突变体的透析及浓缩 | 第61页 |
| 5.2.3.4 SDS-PAGE分析及蛋白浓度测定 | 第61-62页 |
| 5.2.4 酶活性的测定 | 第62-63页 |
| 5.2.4.1 pH对活性的影响 | 第62-63页 |
| 5.2.4.2 温度对活性的影响 | 第63页 |
| 5.3 结果与分析 | 第63-67页 |
| 5.3.1 SQR突变体载体的构建 | 第63-64页 |
| 5.3.2 SQR蛋白及突变体的表达 | 第64页 |
| 5.3.3 SQR的纯化 | 第64-66页 |
| 5.3.4 SQR及突变体的酶活性测定 | 第66-67页 |
| 5.4 本章小结 | 第67-69页 |
| 结论与展望 | 第69-71页 |
| 1 结论 | 第69-70页 |
| 2 展望 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 附件 | 第79页 |