| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 淡水湖泊沉积物微生物群落研究意义及现状 | 第10页 |
| 1.2 淡水湖泊古菌群落研究和氮循环相关微生物类型 | 第10-12页 |
| 1.2.1 淡水湖泊古菌群落研究 | 第10-11页 |
| 1.2.2 氮循环过程及其相关的微生物类群 | 第11-12页 |
| 1.3 微生物分子生态学研究方法 | 第12-14页 |
| 1.3.1 微生物群落多样性分子生态学方法 | 第12-13页 |
| 1.3.2 微生物群落功能的分子生态学方法 | 第13-14页 |
| 1.4 本研究的选题依据、研究内容及技术路线 | 第14-17页 |
| 1.4.1 选题依据、样地概况及研究现状 | 第14-15页 |
| 1.4.2 本研究内容、目的及意义 | 第15-16页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第16-17页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第17-27页 |
| 2.1 研究区域及样地布设 | 第17-18页 |
| 2.2 沉积物采集及预处理 | 第18页 |
| 2.3 试剂及仪器 | 第18-20页 |
| 2.4 理化参数测定方法 | 第20页 |
| 2.5 重金属含量的测定 | 第20页 |
| 2.6 微生物宏基因组总DNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.7 古菌 16 rDNA基因PCR扩增 | 第21页 |
| 2.8 氨氧化细菌amoA基因PCR扩增 | 第21页 |
| 2.9 反硝化细菌nosZ基因PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.10 通PCR产物纯化 | 第22页 |
| 2.11 受态细胞的制备 | 第22页 |
| 2.12 隆文库构建 | 第22-23页 |
| 2.13 菌16SrDNA基因的多样性和系统发育树分析 | 第23-24页 |
| 2.14 氧化细菌amoA基因的多样性和系统发育数分析 | 第24页 |
| 2.15 硝化细菌nosZ基因的多样性和系统发育数分析 | 第24页 |
| 2.16 氧化细菌amoA基因荧光定量PCR（q PCR） | 第24-25页 |
| 2.17 硝化细菌nosZ基因荧光定量PCR（q PCR） | 第25-26页 |
| 2.18 计学分析 | 第26页 |
| 2.19 列登录号 | 第26-27页 |
| 第3章 鄱阳湖表层沉积物表层沉积物古菌群落物种的组成 | 第27-40页 |
| 3.1 古菌16SrDNA基因多样性分析 | 第27页 |
| 3.2 古菌16SrDNA基因丰度分析 | 第27-28页 |
| 3.3 多样性指数分析 | 第28-29页 |
| 3.4 鄱阳湖表层沉积物古菌群落组成 | 第29-33页 |
| 3.5 影响鄱阳湖表层沉积物古菌群落组成的因素 | 第33-35页 |
| 3.6 古菌的系统发育分析 | 第35-37页 |
| 3.7 讨论 | 第37-38页 |
| 3.8 小结 | 第38-40页 |
| 第4章 鄱阳湖表层沉积物氨氧化细菌（AOB）群落空间分布与丰度 | 第40-52页 |
| 4.1 氨氧化细菌群落的分布与多样性 | 第40页 |
| 4.2 氨氧化细菌amoA基因丰度分析 | 第40-41页 |
| 4.3 多样性指数分析 | 第41页 |
| 4.4 沉积物氨氧化细菌序列系统发育分析 | 第41-46页 |
| 4.5 沉积物氨氧化细菌的群落结构差异 | 第46-48页 |
| 4.6 沉积物氨氧化细菌群落多样性以及丰度与沉积物理化指标之间的相关性分析 | 第48-49页 |
| 4.7 沉积物氨氧化细菌群落结构与环境的相关性 | 第49-50页 |
| 4.8 小结 | 第50-52页 |
| 第5章 鄱阳湖表层沉积物反硝化细菌细菌群落空间分布与丰度 | 第52-63页 |
| 5.1 反硝化细菌群落的分布与多样性 | 第52页 |
| 5.2 反硝化细菌nosZ基因文库丰度分析 | 第52-53页 |
| 5.3 多样性指数分析 | 第53页 |
| 5.4 沉积物nosZ序列系统发育分析 | 第53-58页 |
| 5.5 鄱阳湖表层沉积物反硝化细菌的群落结构差异 | 第58-59页 |
| 5.6 沉积物反硝化细菌群落多样性以及丰度与沉积物理化指标之间的相关性分析 | 第59-60页 |
| 5.7 沉积物反硝化细菌群落结构与环境的相关性 | 第60-61页 |
| 5.8 小结 | 第61-63页 |
| 第6章 结论与展望 | 第63-66页 |
| 6.1 结论 | 第63-64页 |
| 6.1.1 古菌群落组成及影响因素 | 第63页 |
| 6.1.2 氨氧化细菌群落和反硝化细菌的群落组成和多样性分析 | 第63-64页 |
| 6.1.3 氨氧化细菌和反硝化细菌定量分析 | 第64页 |
| 6.2 展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第74-75页 |
| 项目支持 | 第75页 |
