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髓细胞瘤相关A和K亚群禽白血病病毒分离株的生物学特性

摘要第5-8页
Abstract第8-10页
第1章 绪论第16-32页
    1.1 禽白血病研究进展第16-30页
        1.1.1 禽白血病及病原研究的历史回顾第16-18页
        1.1.2 禽白血病病原学第18-25页
        1.1.3 禽白血病流行病学第25页
        1.1.4 禽白血病危害及临床病理学第25-27页
        1.1.5 禽白血病致病机制第27-28页
        1.1.6 禽白血病检测与防控第28-29页
        1.1.7 我国鸡群禽白血病研究历史与现状第29-30页
    1.2 本研究的目的和意义第30-32页
第2章 病毒分离鉴定及分离株分子生物学特征研究第32-80页
    2.1 材料与方法第32-46页
        2.1.1 病料及来源第32-33页
        2.1.2 细胞及主要试剂第33-34页
        2.1.3 主要仪器设备第34页
        2.1.4 临床检测第34-38页
        2.1.5 病毒分离鉴定第38-39页
        2.1.6 病毒分离株的体外培养特性第39-41页
        2.1.7 前病毒全基因克隆与测序第41-43页
        2.1.8 前病毒基因序列拼接与分析第43-44页
        2.1.9 ALV-A/J/KMulti-PCR检测方法的建立第44-45页
        2.1.10 具有ALV-J3′LTR的A、K亚群重组ALVMulti-PCR检测方法的建立第45-46页
    2.2 结果与分析第46-76页
        2.2.1 病鸡临床症状及病理变化第46-47页
        2.2.2 ELISA和PCR结果第47-50页
        2.2.3 地方品种鸡病例中ALV-env的定序第50-51页
        2.2.4 病毒分离与鉴定第51页
        2.2.5 分离病毒的体外培养特性第51-55页
        2.2.6 病毒分离株全基因克隆与测序结果第55页
        2.2.7 病毒分离株基因特性分析第55-72页
        2.2.8 ALV-A/J/KMulti-PCR建立第72-74页
        2.2.9 具有ALV-JLTR的A、K亚群禽白血病病毒检测方法的建立第74-76页
    2.3 小结与讨论第76-80页
第3章 致髓细胞瘤型ALV-A、ALV-K分离株反向遗传体系的建立及拯救病毒的致病性研究第80-100页
    3.1 材料与方法第80-86页
        3.1.1 试剂与材料第80-81页
        3.1.2 主要仪器设备第81页
        3.1.3 病毒基因酶切位点分析与感染性克隆构建策略第81-82页
        3.1.4 感染性克隆构建第82-84页
        3.1.5 细胞转染与病毒拯救第84页
        3.1.6 拯救病毒的检测与鉴定第84-85页
        3.1.7 拯救病毒的体外培养特性第85页
        3.1.8 拯救病毒的致病性研究第85-86页
        3.1.9 感染鸡组织带毒检测第86页
    3.2 结果与分析第86-98页
        3.2.1 PCR扩增结果第86页
        3.2.2 感染性克隆质粒构建与鉴定第86-88页
        3.2.3 细胞转染与拯救病毒的鉴定第88-89页
        3.2.4 拯救病毒的体外培养特性第89-90页
        3.2.5 鸡只带毒与排毒监测第90-91页
        3.2.6 鸡只病变监测第91-94页
        3.2.7 感染鸡组织带毒检测第94-98页
    3.3 小结与讨论第98-100页
第4章 致髓细胞瘤性型ALV-A感染鸡的肝脏组织转录组学分析第100-120页
    4.1 材料和方法第100-104页
        4.1.1 主要试剂第100页
        4.1.2 肝脏组织第100-101页
        4.1.3 仪器设备第101页
        4.1.4 RNA提取与质控第101页
        4.1.5 文库构建与测序第101页
        4.1.6 数据处理与分析第101-102页
        4.1.7 差异表达验证第102-104页
    4.2 结果与分析第104-118页
        4.2.1 RNA提取及质量第104页
        4.2.2 数据产出及质量第104-105页
        4.2.3 CleanReads与参考基因组比对第105页
        4.2.4 转录本预测第105页
        4.2.5 差异剪切基因检测第105-107页
        4.2.6 基因表达量分析第107-108页
        4.2.7 样本间基因表达量相关分析第108页
        4.2.8 差异表达基因分析第108-110页
        4.2.9 差异表达验证第110-111页
        4.2.10 差异表达基因GO分析第111-114页
        4.2.11 差异表达基因pathway分析第114-117页
        4.2.12 差异表达基因TF编码能力预测第117-118页
    4.3 小结与讨论第118-120页
第5章 结论第120-121页
致谢第121-122页
参考文献第122-131页
附录第131-136页
个人简介第136-137页

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