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猪体内玉米miRNAs的检测及其潜在靶基因的预测和鉴定

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 文献综述第12-23页
    1.1 miRNA简介第12-16页
        1.1.1 miRNA的发现第12页
        1.1.2 miRNA的生物合成及动植物miRNA的区别第12-15页
        1.1.3 miRNA的生物学功能第15-16页
    1.2 miRNA的检测方法第16-18页
        1.2.1 Northern blotting第16页
        1.2.2 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第16-17页
        1.2.3 miRNA芯片技术第17页
        1.2.4 高通量测序第17-18页
    1.3 miRNA靶基因的预测和鉴定第18-19页
        1.3.1 miRNA靶基因的预测方法第18-19页
        1.3.2 miRNA靶基因的鉴定方法第19页
    1.4 miRNA跨物种调控的研究概况第19-22页
        1.4.1 miRNA跨物种调节靶基因mRNA的研究第19-20页
        1.4.2 植物miRNA跨物种调控的研究进展第20-21页
        1.4.3 对植物miRNA跨物种调控的质疑第21-22页
    1.5 本试验的研究内容及意义第22-23页
2 试验材料及仪器第23-24页
    2.1 试验材料第23页
        2.1.1 试验动物、玉米及细胞系第23页
        2.1.2 主要试剂第23页
    2.2 主要仪器设备第23-24页
3 试验方法第24-36页
    3.1 下载公共数据分析猪体内植物miRNA第24-26页
        3.1.1 下载公共测序数据第24-25页
        3.1.2 剔除低质量序列第25页
        3.1.3 初步筛选植物miRNA第25页
        3.1.4 进一步筛选植物miRNA第25页
        3.1.5 排除细菌、真菌、古生菌的干扰第25-26页
    3.2 动物饲喂及样品采集第26-27页
        3.2.1 动物饲喂及血液的采集第26页
        3.2.2 血清exosomes的分离第26页
        3.2.3 动物组织的采集第26-27页
    3.3 实时荧光定量PCR第27-30页
        3.3.1 miRNA的选择及引物设计第27页
        3.3.2 RNA的提取第27-28页
        3.3.3 miRNA反转录及荧光定量第28-29页
        3.3.4 荧光定量PCR产物的TA克隆及Sanger测序第29-30页
    3.4 zma-miR164a-5p的靶基因预测及鉴定第30-36页
        3.4.1 zma-miR164a-5p的靶基因预测第30-31页
        3.4.2 Mir-Trap鉴定预测的靶基因第31-33页
        3.4.3 双荧光素酶报告系统验证zma-miR164a-5p与靶基因的靶标关系第33-36页
4 结果与分析第36-46页
    4.1 从NCBI下载的猪测序数据中植物miRNA的分析结果第36-37页
    4.2 猪体内玉米miRNA的检测结果第37-42页
        4.2.1 RNA提取质量的鉴定第37页
        4.2.2 荧光定量结果第37-41页
        4.2.3 TA克隆及Sanger测序验证定量产物第41-42页
    4.3 zma-miR164a-5p的靶基因预测和鉴定结果第42-46页
        4.3.1 zma-miR164a-5p在猪体内潜在靶基因的预测结果第42-43页
        4.3.2 Mir-Trap验证zma-miR164a-5p在猪体内15个潜在的靶基因第43页
        4.3.3 双荧光素酶报告系统验证zma-miR164a-5p在猪体内的潜在靶基因第43-46页
5 讨论第46-50页
    5.1 猪血液中植物miRNA的变化规律第46页
    5.2 猪组织中植物miRNA的变化规律第46页
    5.3 miRNA靶标关系的验证方法第46-47页
    5.4 植物miRNA与动物mRNA的靶标关系验证第47-48页
    5.5 植物miRNA跨物种调控动物mRNA第48-50页
        5.5.1 研究方法的讨论第48-49页
        5.5.2 存在问题及展望第49-50页
6 结论第50-51页
7 参考文献第51-59页
致谢第59-60页
附录第60-62页
攻读学位期间发表的学术论文第62页

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