| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 文献综述 | 第12-21页 |
| 1.1 肺的基本结构和功能 | 第12页 |
| 1.2 动物体肺脏组织的发育 | 第12-14页 |
| 1.2.1 肺的发育对动物体的影响 | 第12-13页 |
| 1.2.2 哺乳动物肺的发育过程 | 第13-14页 |
| 1.3 出生前后两个阶段动物体肺脏的变化及特征 | 第14-16页 |
| 1.4 猪在医学研究中的运用 | 第16-17页 |
| 1.5 转录组测序(RNA-seq) | 第17-21页 |
| 1.5.1 RNA-seq概述 | 第17-18页 |
| 1.5.2 RNA-seq技术平台 | 第18页 |
| 1.5.3 RNA-seq的基本原理 | 第18-19页 |
| 1.5.4 RNA-seq的应用 | 第19-21页 |
| 2 研究目的及意义 | 第21页 |
| 3 材料与方法 | 第21-38页 |
| 3.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第21页 |
| 3.1.2 实验样品采集 | 第21-22页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第22页 |
| 3.1.4 主要试剂 | 第22-23页 |
| 3.2 实验方法 | 第23-38页 |
| 3.2.1 石蜡切片的制作和HE染色 | 第23页 |
| 3.2.2 总RNA的抽提 | 第23-24页 |
| 3.2.3 总RNA质检 | 第24-25页 |
| 3.2.4 RNA-seq测序 | 第25-31页 |
| 3.2.5 RNA-seq测序数据的分析 | 第31-35页 |
| 3.2.6 RNA-seq数据的可靠性验证 | 第35-38页 |
| 4 结果分析 | 第38-87页 |
| 4.1 出生前后仔猪肺脏组织形态学的变化 | 第38-39页 |
| 4.2 出生前后仔猪肺脏组织转录组测序文库的构建 | 第39-42页 |
| 4.2.1 总RNA甲醛变性琼脂糖凝胶检测结果 | 第39-40页 |
| 4.2.2 总RNA毛细管电泳结果 | 第40-41页 |
| 4.2.3 cDNA文库目的片段检测 | 第41-42页 |
| 4.2.4 cDNA目的片段文库PCR扩增后的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第42页 |
| 4.3 测序数据概述和数据质量评估 | 第42-46页 |
| 4.3.1 测序数据概述 | 第42-43页 |
| 4.3.2 测序数据质量评估 | 第43-46页 |
| 4.4 出生前后仔猪肺脏转录组表达模式的特征比较 | 第46-48页 |
| 4.5 出生前后仔猪肺脏mRNA和lncRNA的差异特征分析 | 第48-49页 |
| 4.6 编码基因(mRNA)的分析 | 第49-69页 |
| 4.6.1 mRNA的表达模式分析 | 第49-51页 |
| 4.6.2 肺组织中差异表达mRNA的鉴定 | 第51-52页 |
| 4.6.3 差异表达mRNA的聚类分析 | 第52-53页 |
| 4.6.4 出生前后差异mRNA的功能分析 | 第53-69页 |
| 4.7 长链非编码RNA(lncRNA)的分析 | 第69-87页 |
| 4.7.1 lncRNA的表达模式分析 | 第69-71页 |
| 4.7.2 lncRNA的分类及分布特征 | 第71-74页 |
| 4.7.3 肺组织中差异表达lncRNA的鉴定 | 第74-75页 |
| 4.7.4 差异表达lncRNA的聚类分析 | 第75-76页 |
| 4.7.5 lncRNA的功能预测 | 第76-87页 |
| 5 讨论 | 第87-98页 |
| 5.1 出生前后仔猪肺脏组织形态学的变化 | 第87页 |
| 5.2 出生前后仔猪肺脏组织转录组的特征 | 第87-88页 |
| 5.3 出生前后仔猪肺脏组织中差异mRNA的功能 | 第88-96页 |
| 5.3.1 细胞增殖相关 | 第89-91页 |
| 5.3.2 免疫相关 | 第91-94页 |
| 5.3.3 低氧相关 | 第94-95页 |
| 5.3.4 能量代谢相关 | 第95-96页 |
| 5.4 出生前后仔猪肺脏组织中差异lnCRNA的功能注释 | 第96-98页 |
| 6 结论 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-108页 |
| 附表1 | 第108-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
