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北京鸭免疫球蛋白轻链基因胚系结构及多样性产生机制研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
英文缩略词表第11-13页
第一章 文献综述第13-35页
    1.1 免疫球蛋白的基本结构及类型第13-15页
        1.1.1 免疫球蛋白基本结构第13页
        1.1.2 免疫球蛋白可变区和恒定区第13-15页
        1.1.3 免疫球蛋白重链和轻链类型第15页
    1.2 免疫球蛋白主要生物学功能第15-16页
        1.2.1 特异性识别并结合抗原第15-16页
        1.2.2 调理作用第16页
        1.2.3 抗体依赖性细胞毒作用第16页
        1.2.4 激活补体第16页
    1.3 免疫球蛋白多样性产生机制第16-28页
        1.3.1 免疫球蛋白基因座的基本结构第17页
        1.3.2 V(D)J重组第17-21页
        1.3.3 体细胞超突变第21-23页
        1.3.4 基因转换第23-26页
        1.3.5 类别转换重组第26-28页
        1.3.6 鸟类和哺乳动物免疫球蛋白多样性产生机制比较第28页
    1.4 有颌类脊椎动物免疫球蛋白轻链基因的进化第28-33页
        1.4.1 软骨鱼免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第29-30页
        1.4.2 硬骨鱼免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第30页
        1.4.3 两栖类免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第30-32页
        1.4.4 爬行类免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第32页
        1.4.5 鸟类免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第32-33页
        1.4.6 哺乳类免疫球蛋白轻链基因结构与类型特点第33页
    1.5 本研究的目的和意义第33-35页
第二章 材料和方法第35-52页
    2.1 技术路线第35-36页
    2.2 实验材料第36-38页
        2.2.1 实验样品第36页
        2.2.2 质粒与菌株第36页
        2.2.3 北京鸭基因组BAC文库第36页
        2.2.4 分子生物学实验所用常规试剂和酶第36页
        2.2.5 抗体第36页
        2.2.6 实验所用试剂盒第36-37页
        2.2.7 主要试剂配制第37-38页
        2.2.8 实验所需引物第38页
        2.2.9 分析工具软件及网址第38页
    2.3 主要实验仪器设备第38-39页
    2.4 实验方法第39-52页
        2.4.1 基因组DNA提取第39-40页
        2.4.2 组织RNA提取(试剂盒)第40页
        2.4.3 反转录(M-MLV)第40-41页
        2.4.4 5'RACE实验方法第41页
        2.4.5 3'RACE实验方法第41页
        2.4.6 常规PCR体系及条件第41页
        2.4.7 高保真PCR第41-42页
        2.4.8 克隆转化第42-44页
        2.4.9 质粒DNA提取第44页
        2.4.10 定量PCR实验方法第44-45页
        2.4.11 Southern blotting实验方法(地高辛标记杂交方法)第45-47页
        2.4.12 Western blotting实验方法第47-49页
        2.4.13 北京鸭基因组BAC文库筛选第49页
        2.4.14 BAC DNA的提取第49-50页
        2.4.15 脉冲电泳和电洗脱法回收BAC第50-51页
        2.4.16 SW102电转感受态细胞的制备及电转BAC第51页
        2.4.17 转基因小鼠制备第51-52页
第三章 实验结果与分析第52-99页
    引言第52页
    3.1 北京鸭免疫球蛋白轻链基因BAC克隆的筛选与分析鉴定第52-57页
        3.1.1 北京鸭基因组BAC文库的筛选第52-55页
        3.1.2 北京鸭IgL基因阳性BAC克隆长度及生物信息学分析第55-57页
    3.2 北京鸭免疫球蛋白轻链基因完整胚系结构第57-63页
        3.2.1 Southern blotting确定北京鸭IgL恒定区基因为单拷贝第57页
        3.2.2 RACE确定北京鸭IgL恒定区和J区基因为单拷贝第57-59页
        3.2.3 BAC全长测序确定北京鸭IgL基因完整胚系结构第59-60页
        3.2.4 北京鸭IgL基因分家族及功能V_λ基因序列比对第60-63页
    3.3 北京鸭免疫球蛋白轻链V_λ基因进化分析第63-65页
    3.4 北京鸭免疫球蛋白轻链基因VJ重组分析第65-75页
        3.4.1 北京鸭9个功能V_λ基因都能参与VJ重组第65-68页
        3.4.2 北京鸭9个功能V_λ基因使用频率分析第68-69页
        3.4.3 北京鸭VJ重组过程中有少量N核苷酸和P核苷酸添加第69-71页
        3.4.4 北京鸭CDRL3区域长度及氨基酸使用分析第71-75页
    3.5 北京鸭免疫球蛋白轻链基因转换分析第75-78页
    3.6 北京鸭免疫球蛋白轻链基因体细胞超突变分析第78-80页
    3.7 转基因BAC载体的构建第80-83页
        3.7.1 转基因BAC克隆的选择第80-81页
        3.7.2 转基因BAC克隆修饰策略第81-83页
    3.8 转基因BAC载体的提取、分离、回收和纯化第83-85页
    3.9 转基因小鼠的制备及鉴定第85-90页
        3.9.1 转基因小鼠的制备第85页
        3.9.2 基因组水平鉴定阳性转基因小鼠第85-90页
    3.10 转基因小鼠中免疫球蛋白轻链基因表达分析第90-97页
        3.10.1 转基因小鼠中外源北京鸭IgL基因VJ重组鉴定第90页
        3.10.2 转基因小鼠中免疫球蛋白轻链基因cDNA水平表达分析第90-96页
        3.10.3 转基因小鼠中免疫球蛋白轻链基因蛋白水平表达分析第96-97页
    3.11 转基因小鼠中外源鸭免疫球蛋白轻链基因转换分析第97-99页
第四章 讨论与展望第99-102页
第五章 结论第102-103页
参考文献第103-115页
致谢第115-116页
附录第116-121页
个人简历第121页

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