基于基因关联网络的表型相关性分析算法的研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| 1.1 课题研究背景 | 第8-9页 |
| 1.2 研究的目的和意义 | 第9页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第9-13页 |
| 1.3.1 基于文本研究的现状 | 第9-10页 |
| 1.3.2 基于本体研究的现状 | 第10-11页 |
| 1.3.3 基于网络研究的现状 | 第11-13页 |
| 1.4 本文的主要研究内容与组织结构 | 第13-17页 |
| 1.4.1 本文主要研究内容 | 第13-15页 |
| 1.4.2 本文的组织结构 | 第15-17页 |
| 第2章 相关技术知识介绍 | 第17-25页 |
| 2.1 基因关联网络的构建 | 第17-19页 |
| 2.2 表型数据的分析 | 第19-21页 |
| 2.3 本体节点相似度的计算方法 | 第21-24页 |
| 2.4 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 表型模块的识别 | 第25-43页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 本体基因数据的整合和网络构建 | 第25-30页 |
| 3.2.1 基因相互作用组的整合 | 第25-28页 |
| 3.2.2 基因数据集的规格化映射 | 第28-30页 |
| 3.3 表型模块的定位和分析 | 第30-42页 |
| 3.3.1 表型-基因数据的分析 | 第30-31页 |
| 3.3.2 临界概率和最小网络覆盖的分析 | 第31-38页 |
| 3.3.3 表型模块的识别 | 第38-42页 |
| 3.4 本章小结 | 第42-43页 |
| 第4章 表型相关性分析算法的研究 | 第43-49页 |
| 4.1 引言 | 第43页 |
| 4.2 表型模块的基因重叠 | 第43-44页 |
| 4.3 基于网络的表型相关性分析算法 | 第44-48页 |
| 4.3.1 基于基因网络的分离度算法 | 第44-46页 |
| 4.3.2 基于基因邻居频率的算法 | 第46-48页 |
| 4.4 本章小结 | 第48-49页 |
| 第5章 实验结果与分析 | 第49-59页 |
| 5.1 引言 | 第49页 |
| 5.2 验证算法的预测程度 | 第49-56页 |
| 5.2.1 基因本体数据的验证实验 | 第51-53页 |
| 5.2.2 症状相似数据的验证实验 | 第53-54页 |
| 5.2.3 基因共表达数据的验证实验 | 第54-56页 |
| 5.3.实验分析和实验结论 | 第56-58页 |
| 5.4 本章小结 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第66-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
