| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-30页 |
| ·miRNAs的发现 | 第13-14页 |
| ·miRNAs的特点 | 第14-15页 |
| ·植物miRNAs合成与作用机制 | 第15-17页 |
| ·miRNAs的研究方法 | 第17-22页 |
| ·miRNAs的克隆与鉴定 | 第17-19页 |
| ·miRNAs的功能研究方法 | 第19-22页 |
| ·miRNAs在植物中的调控作用 | 第22-25页 |
| ·miRNAs调控植物生长发育与形态建成 | 第22-24页 |
| ·miRNAs调控植物对环境的适应性 | 第24-25页 |
| ·miRNAs在植物特异信号传递中的作用 | 第25页 |
| ·miRNAs与甲基化 | 第25-26页 |
| ·miRNAs与植物的进化 | 第26-28页 |
| ·本研究的意义及立项依据 | 第28-30页 |
| 第二章 小RNA的高通量测序及生物信息学分析 | 第30-44页 |
| ·材料与方法 | 第30-33页 |
| ·倍性水稻材料鉴定及遗传背景分析 | 第30-31页 |
| ·小RNA高通量测序 | 第31-32页 |
| ·候选miRNAs的预测 | 第32页 |
| ·miRNAs靶基因的预测 | 第32-33页 |
| ·结果与分析 | 第33-42页 |
| ·材料的倍性鉴定及遗传背景分析 | 第33-34页 |
| ·总RNA的提取及Solexa高通量测序 | 第34页 |
| ·小RNA高通量测序数据基本生物信息学分析 | 第34-37页 |
| ·新的miRNAs的预测 | 第37-40页 |
| ·候选miRNAs靶基因的预测 | 第40-42页 |
| ·讨论 | 第42页 |
| ·结论 | 第42-44页 |
| 第三章 miRNAs及其靶基因的鉴定与表达分析 | 第44-66页 |
| ·材料与方法 | 第44-52页 |
| ·候选miRNAs的验证 | 第44-47页 |
| ·miRNAs靶基因的研究 | 第47-52页 |
| ·结果与分析 | 第52-62页 |
| ·候选miRNAs的验证 | 第52-53页 |
| ·miRNAs的表达量检测 | 第53-57页 |
| ·miRNAs介导的靶基因裂解位点分析 | 第57-60页 |
| ·miRNAs与对应靶基因定量表达的相关性分析 | 第60-62页 |
| ·讨论 | 第62-65页 |
| ·miRNAs的鉴定 | 第62-63页 |
| ·miRNAs的表达 | 第63-64页 |
| ·miRNAs介导靶基因切割位点多态性探讨 | 第64-65页 |
| ·结论 | 第65-66页 |
| 第四章 miRNAs过表达载体的构建及转化 | 第66-77页 |
| ·材料与方法 | 第66-71页 |
| ·miRNAs过表达载体的构建 | 第66-68页 |
| ·水稻转基因操作 | 第68-71页 |
| ·结果与分析 | 第71-76页 |
| ·miRNA前体及侧翼序列的获得 | 第71-74页 |
| ·miRNAs过表达载体的构建及确认 | 第74-75页 |
| ·农杆菌介导pHB载体的转化 | 第75-76页 |
| ·讨论 | 第76页 |
| ·结论 | 第76-77页 |
| 第五章 甲基化差异位点分离及其与miRNAs相关性探讨 | 第77-88页 |
| ·材料和方法 | 第77-78页 |
| ·材料 | 第77页 |
| ·方法 | 第77-78页 |
| ·结果与分析 | 第78-84页 |
| ·单倍体与其对应二倍体、恢复系杂交后代植株的获得与倍性鉴定 | 第78-79页 |
| ·单倍体相关甲基化差异位点分析 | 第79-84页 |
| ·讨论 | 第84-87页 |
| ·DNA甲基化与miRNAs的相关性 | 第84-85页 |
| ·DNA甲基化与杂种优势 | 第85-86页 |
| ·DNA甲基化差异片段功能探讨 | 第86-87页 |
| ·结论 | 第87-88页 |
| 本研究的创新点及后续研究设想 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 附录 | 第99-105页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第105页 |