| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-37页 |
| 第一节 SNP研究概述 | 第13-27页 |
| 1 SNP标记的特点 | 第13-14页 |
| 1.1 数量多分布广,遗传稳定性高 | 第13页 |
| 1.2 功能众多 | 第13-14页 |
| 1.3 便于实现自动化分析 | 第14页 |
| 2 SNP标记检测方法 | 第14-23页 |
| 2.1 高通量测序法 | 第14-18页 |
| 2.2 生物信息学发掘法 | 第18页 |
| 2.3 以构象为基础的SNP检测方法 | 第18-21页 |
| 2.3.1 温度梯度凝胶电泳DGGE | 第19页 |
| 2.3.2 单链构象多态性 | 第19-20页 |
| 2.3.3 变性高效液相色谱 | 第20页 |
| 2.3.4 高分辨率熔解曲线 | 第20-21页 |
| 2.4 基于杂交的检测法 | 第21-22页 |
| 2.4.1 TaqMan探针技术 | 第21-22页 |
| 2.4.2 基因芯片检测 | 第22页 |
| 2.5 基于酶切反应的分型方法 | 第22-23页 |
| 3 SNP标记在水产养殖中的应用 | 第23-27页 |
| 3.1 水产群体遗传学和亲缘关系的鉴定 | 第23-24页 |
| 3.2 构建遗传连锁图谱 | 第24-26页 |
| 3.3 连锁不平衡、关联分析和功能学验证 | 第26-27页 |
| 3.4 在刺参生物学研究中的进展 | 第27页 |
| 第二节 刺参研究概况 | 第27-36页 |
| 1 刺参生物学概况 | 第28-33页 |
| 1.1 刺参的地理分布、生态习性及其营养价值 | 第28-30页 |
| 1.1.1 刺参的地理分布 | 第28页 |
| 1.1.2 刺参的生态习性 | 第28-30页 |
| 1.1.3 刺参的营养价值 | 第30页 |
| 1.2 刺参的发育和繁殖 | 第30-33页 |
| 1.2.1 刺参的发育 | 第30-31页 |
| 1.2.2 刺参的繁殖 | 第31-33页 |
| 2 刺参国内外研究现状 | 第33-36页 |
| 2.1 染色体的研究 | 第33-34页 |
| 2.2 遗传多样性的研究 | 第34-35页 |
| 2.3 转录组学研究 | 第35页 |
| 2.4 遗传连锁图谱的构建 | 第35-36页 |
| 第三节 本研究的目的和意义 | 第36-37页 |
| 第二章 刺参SNP标记筛选与特性分析 | 第37-53页 |
| 引言 | 第37-38页 |
| 1 实验材料和方法 | 第38-43页 |
| 1.1 DNA的提取 | 第38页 |
| 1.2 EST-SNP位点的获取 | 第38-40页 |
| 1.3 引物设计、多态性检测和HRM验证 | 第40-43页 |
| 1.3.1 引物设计和多态性检验 | 第40-41页 |
| 1.3.2 HRM验证 | 第41-43页 |
| 1.3.3 位点主要遗传学参数的估算 | 第43页 |
| 2 实验结果 | 第43-51页 |
| 2.1 候选SNP和引物筛选 | 第44-45页 |
| 2.2 SNP位点遗传信息 | 第45-51页 |
| 3 讨论 | 第51-53页 |
| 3.1 SNP位点遗传信息 | 第51页 |
| 3.2 HRM技术的优势 | 第51-53页 |
| 第三章 刺参中国养殖群体和日本野生群体遗传多样性比较 | 第53-67页 |
| 引言 | 第53-54页 |
| 1 材料与方法 | 第54-57页 |
| 1.1 样品采集 | 第54-55页 |
| 1.2 DNA提取和SNP分析 | 第55-57页 |
| 1.2.1 DNA提取 | 第55页 |
| 1.2.2 SNP分析 | 第55-56页 |
| 1.2.3 数据分析 | 第56-57页 |
| 2 实验结果 | 第57-64页 |
| 2.1 刺参养殖群体和野生群体遗传多样性 | 第57-62页 |
| 2.2 刺参群体间遗传分化 | 第62-64页 |
| 3 讨论 | 第64-67页 |
| 3.1 刺参群体遗传多样性 | 第64-65页 |
| 3.2 刺参群体间遗传分化 | 第65-67页 |
| 第四章 刺参SNP标记与生长性状的关联分析 | 第67-77页 |
| 引言 | 第67-68页 |
| 1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 1.1 材料 | 第68页 |
| 1.2 实验方法 | 第68-70页 |
| 1.2.1 生长性状测量和DNA提取 | 第68-69页 |
| 1.2.2 PCR反应 | 第69-70页 |
| 1.2.3 数据统计与分析 | 第70页 |
| 2 结果 | 第70-74页 |
| 2.1 多态性信息 | 第70-72页 |
| 2.2 SNP位点与生长性状相关性分析 | 第72-74页 |
| 3 讨论 | 第74-77页 |
| 3.1 刺参家系遗传多样性分析 | 第74-75页 |
| 3.2 SNP标记与经济性状 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 个人简历 | 第92页 |
| 学术成果 | 第92页 |