| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第16-24页 |
| 1.1 黄瓜花叶病毒 | 第16-18页 |
| 1.1.1 CMV的基因组特征 | 第16-18页 |
| 1.1.2 CMV株系划分 | 第18页 |
| 1.2 烟草黄瓜花叶病毒病 | 第18-20页 |
| 1.2.1 烟草CMV的危害 | 第18-19页 |
| 1.2.2 烟草CMV的防治 | 第19页 |
| 1.2.3 烟草抗CMV种质资源 | 第19页 |
| 1.2.4 烟草CMV抗源抗性遗传分析 | 第19-20页 |
| 1.2.5 CMV抗性基因研究进展 | 第20页 |
| 1.2.6 CMV侵染对烟草细胞超微结构的影响 | 第20页 |
| 1.3 转录组测序 | 第20-22页 |
| 1.3.1 转录组测序的步骤 | 第21页 |
| 1.3.2 转录组测序的应用 | 第21-22页 |
| 1.4 本研究的目的意义、主要内容及技术路线 | 第22-24页 |
| 1.4.1 研究的目的及意义 | 第22页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第22页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第22-24页 |
| 第二章 CMV毒源全基因组序列分析及亚组鉴定 | 第24-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-27页 |
| 2.1.1 CMV来源及保存 | 第24页 |
| 2.1.2 菌株及主要化学试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第24页 |
| 2.1.4 毒源叶片总RNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.1.5 RNA反转录及目的片段的扩增 | 第25-26页 |
| 2.1.6 目的片段回收 | 第26页 |
| 2.1.7 连接 | 第26页 |
| 2.1.8 转化 | 第26-27页 |
| 2.1.9 序列拼接及分析 | 第27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-30页 |
| 2.2.1 RNA提取结果 | 第27-28页 |
| 2.2.2 目的片段的扩增和克隆 | 第28页 |
| 2.2.3 序列拼接及同源比较 | 第28-29页 |
| 2.2.4 RNA35＇NTR结构比较 | 第29页 |
| 2.2.5 CP核酸序列系统进化分析 | 第29-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 烟草CMV抗源抗性遗传分析 | 第32-39页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32-33页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第32页 |
| 3.1.2 育苗 | 第32页 |
| 3.1.3 毒源准备 | 第32-33页 |
| 3.1.4 CMV接种 | 第33页 |
| 3.1.5 病情鉴定 | 第33页 |
| 3.1.6 数据分析 | 第33页 |
| 3.2 结果与分析 | 第33-38页 |
| 3.2.1 亲本及F1、F2发病情况统计 | 第33-34页 |
| 3.2.2 三个抗源对CMV抗性的主基因+多基因遗传分析 | 第34-37页 |
| 3.2.3 遗传参数估计 | 第37-38页 |
| 3.3 讨论 | 第38-39页 |
| 第四章 CMV侵染烟草不同抗性种质的细胞学观察 | 第39-48页 |
| 4.1 材料与方法 | 第39-40页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第39页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第39-40页 |
| 4.2 结果与分析 | 第40-46页 |
| 4.2.1 材料抗病性鉴定结果 | 第40-41页 |
| 4.2.2 发病过程表型观察结果 | 第41-42页 |
| 4.2.3 CMV侵染8天细胞超微结构的观察结果 | 第42-44页 |
| 4.2.4 CMV侵染15天细胞超微结构的观察结果 | 第44-46页 |
| 4.3 讨论 | 第46-48页 |
| 第五章 CMV侵染烟草不同抗性种质的转录组分析 | 第48-67页 |
| 5.1 材料与方法 | 第48-51页 |
| 5.1.1 试验材料与病毒接种 | 第48页 |
| 5.1.2 RNA提取及质量检测 | 第48-49页 |
| 5.1.3 RNA文库构建及测序 | 第49页 |
| 5.1.4 测序数据的过滤及质控 | 第49页 |
| 5.1.5 比对与统计 | 第49页 |
| 5.1.6 基因表达定量分析 | 第49页 |
| 5.1.7 差异表达基因的筛选 | 第49页 |
| 5.1.8 差异表达基因的GO分析 | 第49-50页 |
| 5.1.9 差异表达基因的KEGG分析 | 第50页 |
| 5.1.10 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第50-51页 |
| 5.2 结果与分析 | 第51-63页 |
| 5.2.1 总RNA质量及浓度的检测 | 第51-52页 |
| 5.2.2 测序数据产量及比对统计 | 第52页 |
| 5.2.3 差异表达基因筛选 | 第52-53页 |
| 5.2.4 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第53-54页 |
| 5.2.5 差异表达基因的GO分析 | 第54-63页 |
| 5.2.6 差异表达基因的KEGG分析 | 第63页 |
| 5.3 讨论 | 第63-67页 |
| 5.3.1 关于RNA-seq | 第63-64页 |
| 5.3.2 关于差异基因 | 第64页 |
| 5.3.3 脱落酸和茉莉酸信号传导通路 | 第64-65页 |
| 5.3.4 WRKY转录因子 | 第65页 |
| 5.3.5 过氧化物酶体通路 | 第65-67页 |
| 第六章 全文结论 | 第67-69页 |
| 6.1 全文结论 | 第67页 |
| 6.2 创新点 | 第67-68页 |
| 6.3 工作展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 附录 | 第77-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简历 | 第92页 |