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四种蝗虫线粒体基因组的测定及比较和谱系基因组学分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一部分 概述第10-24页
    1.1 线粒体及线粒体基因组第10-11页
        1.1.1 线粒体第10页
        1.1.2 线粒体基因组第10-11页
    1.2 线粒体基因组研究策略及方法第11-13页
    1.3 比较基因组学第13-14页
    1.4 谱系基因组学第14-20页
        1.4.1 昆虫线粒体基因组系统发生第14-15页
        1.4.2 系统发生分析第15-19页
        1.4.3 系统发生分析方法第19-20页
    1.5 蝗亚目系统学存在的问题和本研究的目的第20-24页
        1.5.1 蝗亚目系统学存在的问题第20页
        1.5.2 本研究的目的第20-21页
        1.5.3 研究物种介绍第21-24页
第二部分 线粒体基因组测定与分析第24-66页
    2.1 实验材料与方法第24-31页
        2.1.1 实验材料第24页
        2.1.2 实验方法第24-29页
        2.1.3 序列的拼接与注释第29-31页
        2.1.4 DNA序列组成分析第31页
    2.2 注释结果第31-56页
        2.2.1 线粒体基因组组成与结构第31-37页
        2.2.2 线粒体基因组核苷酸组成特点第37-38页
        2.2.3 蛋白质编码基因第38-40页
        2.2.4 tRNA基因第40-41页
        2.2.5 rRNA基因第41-53页
        2.2.6 D-Loop区第53-56页
    2.3 线粒体比较基因组分析第56-66页
        2.3.1 线粒体基因组大小第56页
        2.3.2 线粒体基因组基因重排第56-59页
        2.3.3 线粒体基因组的间隔区和重叠区第59-60页
        2.3.4 线粒体基因组基因长度的变化第60页
        2.3.5 线粒体基因组碱基组成第60-62页
        2.3.6 线粒体基因组密码子组成第62-63页
        2.3.7 线粒体基因组氨基酸组成第63-64页
        2.3.8 线粒体基因组tRNA基因与rRNA基因第64-65页
        2.3.9 线粒体基因组D-Loop区比较第65-66页
第三部分 线粒体谱系基因组学分析第66-102页
    3.1 数据来源第66页
    3.2 分析方法第66-73页
    3.3 结果及分析第73-102页
        3.3.1 序列组成分析第73-75页
        3.3.2 遗传距离分析第75-77页
        3.3.3 序列异质性分析第77-79页
        3.3.4 碱基替换饱和性分析第79-80页
        3.3.5 系统发生分析第80-102页
第四部分 总结第102-104页
参考文献第104-120页
附录第120-128页
致谢第128-130页
攻读学位期间的研究成果第130页

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