| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-22页 |
| 1.1 生物数据分析研究 | 第14-16页 |
| 1.2 代谢组学数据分析研究 | 第16-17页 |
| 1.3 支持向量机 | 第17-18页 |
| 1.4 正交偏最小二乘判别分析 | 第18-19页 |
| 1.5 粒子群优化算法 | 第19-20页 |
| 1.6 本论文的研究工作 | 第20-22页 |
| 第2章 基于粒子群算法优化的非线性变量加权支持向量机用于多位点蛋白质定位模式分离研究 | 第22-32页 |
| 2.1 前言 | 第22-23页 |
| 2.2 数据集 | 第23-25页 |
| 2.3 理论 | 第25-27页 |
| 2.3.1 变量加权支持向量机(VW-SVM) | 第25-26页 |
| 2.3.2 粒子群优化算法(PSO) | 第26页 |
| 2.3.3 基于粒子群算法PSO优化的VW-SVM | 第26-27页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第27-31页 |
| 2.4.1 蛋白质在线粒体和溶酶体中分布比例预测 | 第27-30页 |
| 2.4.2 线粒体和溶酶体荧光探针浓度预测 | 第30-31页 |
| 2.5 小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于空间纹理描述子加权的特征表达用于多位点蛋白质定位模式的有效分离 | 第32-48页 |
| 3.1 前言 | 第32-34页 |
| 3.2 材料与方法 | 第34-36页 |
| 3.2.1 数据集 | 第34页 |
| 3.2.2 亚细胞荧光目标特征集(SOF1) | 第34页 |
| 3.2.3 局部二值模式算子(LBPs) | 第34-35页 |
| 3.2.4 局部三值模式算子(LTPs) | 第35-36页 |
| 3.3 理论 | 第36-39页 |
| 3.3.1 变量加权偏最小二乘法(VW-PLS) | 第36-38页 |
| 3.3.2 变量加权支持向量机(VW-SVM) | 第38页 |
| 3.3.3 基于纹理描述子加权的PLS或SVM用于蛋白质亚细胞定位模式分离 | 第38-39页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第39-47页 |
| 3.4.1 蛋白质在线粒体和溶酶体中分布比例预测 | 第39-43页 |
| 3.4.2 线粒体和溶酶体荧光探针浓度预测 | 第43-47页 |
| 3.5 小结 | 第47-48页 |
| 第4章 一种新的核酸序列编码方法用于高性能适配体的识别以及辅助新序列的设计和优化 | 第48-58页 |
| 4.1 前言 | 第48-49页 |
| 4.2 材料和方法 | 第49-53页 |
| 4.2.1 数据集 | 第49-50页 |
| 4.2.2 核酸序列编码方法Apta-LoopEnc | 第50-52页 |
| 4.2.3 基于支持向量机的Apta-LoopEnc用于高亲和力适配体的识别 | 第52-53页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第53-57页 |
| 4.4 小结 | 第57-58页 |
| 第5章 GC-MS尿液代谢组学结合改进的正交偏最小二乘判别分析用于新生儿代谢缺陷的早期诊断 | 第58-80页 |
| 5.1 前言 | 第58-60页 |
| 5.2 理论 | 第60-64页 |
| 5.2.1 正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA) | 第60-61页 |
| 5.2.2 粒子群优化算法(PSO) | 第61-62页 |
| 5.2.3 基于混合粒子群算法的自适应优化配置的正交偏最小二乘判别分析(HPSO-OPLSDA) | 第62-64页 |
| 5.2.4 适应度函数 | 第64页 |
| 5.3 实验 | 第64-69页 |
| 5.3.1 仪器与试剂 | 第64页 |
| 5.3.2 样本收集 | 第64-65页 |
| 5.3.3 样本准备 | 第65页 |
| 5.3.4 GC-MS分析数据采集 | 第65-69页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第69-79页 |
| 5.4.1 尿液样本的GC-MS数据分析 | 第69-70页 |
| 5.4.2 新生儿代谢缺陷病人与正常婴儿的尿液样本分类 | 第70-75页 |
| 5.4.3 与新生儿代谢缺陷疾病有关的代谢标志物筛选 | 第75-79页 |
| 5.5 小结 | 第79-80页 |
| 第6章 基于粒子群算法的正交偏最小二乘判别分析结合GC-MS尿液代谢组学用于早期检测新生儿代谢缺陷 | 第80-90页 |
| 6.1 前言 | 第80-81页 |
| 6.2 基于混合粒子群算法的自适应优化配置的正交偏最小二乘判别分析(HPSO-SWVSO-OPLSDA) | 第81-83页 |
| 6.3 实验 | 第83-84页 |
| 6.4 结果与讨论 | 第84-88页 |
| 6.5 小结 | 第88-90页 |
| 结论 | 第90-92页 |
| 参考文献 | 第92-117页 |
| 附录A 攻读学位期间发表及完成的论文目录 | 第117-118页 |
| 附录B 数据集Ⅰ中适配体序列的各项特征描述 | 第118-134页 |
| 附录C 数据集Ⅱ中适配体序列的各项特征描述 | 第134-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
