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水稻细菌性条斑病菌与致病相关的双组份感受子基因的鉴定

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 前言第12-27页
    1.1 水稻细菌性条斑病的研究进展第12页
    1.2 植物病原菌的主要致病因子第12-15页
        1.2.1 Ⅲ型效应物第13-14页
        1.2.2 脂多糖第14页
        1.2.3 胞外酶第14-15页
        1.2.4 胞外多糖第15页
    1.3 双组份调控系统的研究第15-23页
        1.3.1 双组份调控系统第15-16页
        1.3.2 双组份调控系统在自然界的分布第16-17页
        1.3.3 TCSs中HK的特性第17-18页
        1.3.4 双组分系统两种典型类型第18-21页
        1.3.5 双组分调控系统的作用第21-22页
        1.3.6 双组分系统的复杂性第22-23页
    1.4 PhoR/PhoB双组份调控系统第23-24页
    1.5 双组份调控系统中PhoR的结构域和磷酸酶活性第24-26页
    1.6 本研究的目的、内容和意义第26-27页
        1.6.1 本研究的目的第26页
        1.6.2 本研究的内容第26页
        1.6.3 本研究的意义第26-27页
第二章 材料与方法第27-44页
    2.1 材料第27-33页
        2.1.1 供试菌株和质粒第27-28页
        2.1.2 植株材料第28页
        2.1.3 引物第28-29页
        2.1.4 抗生素第29-30页
        2.1.5 培养基第30-31页
        2.1.6 菌种的培养方法、保存和活化第31-32页
        2.1.7 常用的缓冲液、溶液第32页
        2.1.8 实验耗材第32-33页
    2.2 DNA分子学常规操作第33-36页
        2.2.1 DNA的提取第33页
        2.2.2 质粒DNA提取第33-34页
        2.2.3 DNA的连接第34-35页
        2.2.4 DNA的酶切第35页
        2.2.5 DNA的纯化第35页
        2.2.6 DNA的染色和电泳第35-36页
        2.2.7 DNA的测序第36页
    2.3 常规聚合酶链式反应第36-37页
        2.3.1 引物设计第36页
        2.3.2 PCR模板的制备第36-37页
        2.3.3 PCR反应体系和条件第37页
    2.4 细菌的转化和三亲本接合试验操作第37-40页
        2.4.1 化学转化感受态细胞的制备第37-38页
        2.4.2 化学转化反应第38页
        2.4.3 三亲本接合第38-39页
        2.4.4 菌株的构建第39-40页
    2.5 植株试验第40-41页
        2.5.1 致病性检测试验第40页
        2.5.2 过敏反应第40-41页
    2.6 表型检测试验第41-42页
        2.6.1 胞外蛋白酶检测第41页
        2.6.2 胞外多糖检测第41-42页
        2.6.3 细菌游动性检测第42页
    2.7 生物膜检测第42页
    2.8 丰富培养基中生长曲线测定第42-43页
    2.9 生物信息学分析方法第43-44页
第三章 结果与分析第44-85页
    3.1 Xoc GX01菌株中所注释的感受子基因第44-47页
        3.1.1 候选基因编码蛋白的结构域研究第45-47页
    3.2 Xoc GX01双组份基因中感受蛋白基因的突变体的构建第47-56页
        3.2.1 整合突变体的构建第47-48页
        3.2.2 引物设计和PCR扩增目的片段第48-49页
        3.2.3 pK18mob重组质粒的构建第49-51页
        3.2.4 三亲接合子获得整合突变体第51-52页
        3.2.5 候选感受子基因生化表型检测第52-56页
    3.3 突变体功能互补菌株的构建第56-77页
        3.3.1 XOC1980突变体的互补菌株的构建第57-61页
        3.3.2 XOC1980互补菌株的表型分析第61-67页
        3.3.3 XOC1020突变体互补菌株的构建第67-71页
        3.3.4 XOC1020互补菌株的表型分析第71-77页
    3.4 XOC1980、XOC1020的生物信息学分析第77-85页
        3.4.1 XOC1980、XOC1020的结构域分析第77-78页
        3.4.2 XOC1980、XOC1020的氨基酸序列分析第78页
        3.4.3 XOC1980、XOC1020的蛋白质序列分析第78-82页
        3.4.4 XOC1980、XOC1020在黄单胞菌属中的进化树分析第82-85页
第四章 结论与讨论第85-90页
    4.1. Xoc GX01中感受子基因的表型第85-88页
        4.1.1 与胞外蛋白酶相关的感受子基因第85-86页
        4.1.2 与胞外多糖相关的感受子基因第86页
        4.1.3 与游动性相关的感受子基因第86-87页
        4.1.4 与致病力相关的感受子基因第87页
        4.1.5 与致病因子和致病力相关的感受子基因注释的双组份系统分析第87-88页
    4.2 XOC1980、XOC1020的生物功能分析第88-90页
        4.2.1 XOC1980与胞外蛋白酶、胞外多糖、细菌游动性、致病性相关第88页
        4.2.2 XOC1020与胞外蛋白酶、致病性相关第88页
        4.2.3 XOC1980、XOC1020与HR不相关第88-89页
        4.2.4 XOC1980、XOC1020都有生物膜特性第89页
        4.2.5 YOC1980、YOC1020不影响细胞繁殖第89-90页
参考文献第90-98页
致谢第98-99页
攻读学位期间发表的论文第99页

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