摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
第一章 前言 | 第12-27页 |
1.1 水稻细菌性条斑病的研究进展 | 第12页 |
1.2 植物病原菌的主要致病因子 | 第12-15页 |
1.2.1 Ⅲ型效应物 | 第13-14页 |
1.2.2 脂多糖 | 第14页 |
1.2.3 胞外酶 | 第14-15页 |
1.2.4 胞外多糖 | 第15页 |
1.3 双组份调控系统的研究 | 第15-23页 |
1.3.1 双组份调控系统 | 第15-16页 |
1.3.2 双组份调控系统在自然界的分布 | 第16-17页 |
1.3.3 TCSs中HK的特性 | 第17-18页 |
1.3.4 双组分系统两种典型类型 | 第18-21页 |
1.3.5 双组分调控系统的作用 | 第21-22页 |
1.3.6 双组分系统的复杂性 | 第22-23页 |
1.4 PhoR/PhoB双组份调控系统 | 第23-24页 |
1.5 双组份调控系统中PhoR的结构域和磷酸酶活性 | 第24-26页 |
1.6 本研究的目的、内容和意义 | 第26-27页 |
1.6.1 本研究的目的 | 第26页 |
1.6.2 本研究的内容 | 第26页 |
1.6.3 本研究的意义 | 第26-27页 |
第二章 材料与方法 | 第27-44页 |
2.1 材料 | 第27-33页 |
2.1.1 供试菌株和质粒 | 第27-28页 |
2.1.2 植株材料 | 第28页 |
2.1.3 引物 | 第28-29页 |
2.1.4 抗生素 | 第29-30页 |
2.1.5 培养基 | 第30-31页 |
2.1.6 菌种的培养方法、保存和活化 | 第31-32页 |
2.1.7 常用的缓冲液、溶液 | 第32页 |
2.1.8 实验耗材 | 第32-33页 |
2.2 DNA分子学常规操作 | 第33-36页 |
2.2.1 DNA的提取 | 第33页 |
2.2.2 质粒DNA提取 | 第33-34页 |
2.2.3 DNA的连接 | 第34-35页 |
2.2.4 DNA的酶切 | 第35页 |
2.2.5 DNA的纯化 | 第35页 |
2.2.6 DNA的染色和电泳 | 第35-36页 |
2.2.7 DNA的测序 | 第36页 |
2.3 常规聚合酶链式反应 | 第36-37页 |
2.3.1 引物设计 | 第36页 |
2.3.2 PCR模板的制备 | 第36-37页 |
2.3.3 PCR反应体系和条件 | 第37页 |
2.4 细菌的转化和三亲本接合试验操作 | 第37-40页 |
2.4.1 化学转化感受态细胞的制备 | 第37-38页 |
2.4.2 化学转化反应 | 第38页 |
2.4.3 三亲本接合 | 第38-39页 |
2.4.4 菌株的构建 | 第39-40页 |
2.5 植株试验 | 第40-41页 |
2.5.1 致病性检测试验 | 第40页 |
2.5.2 过敏反应 | 第40-41页 |
2.6 表型检测试验 | 第41-42页 |
2.6.1 胞外蛋白酶检测 | 第41页 |
2.6.2 胞外多糖检测 | 第41-42页 |
2.6.3 细菌游动性检测 | 第42页 |
2.7 生物膜检测 | 第42页 |
2.8 丰富培养基中生长曲线测定 | 第42-43页 |
2.9 生物信息学分析方法 | 第43-44页 |
第三章 结果与分析 | 第44-85页 |
3.1 Xoc GX01菌株中所注释的感受子基因 | 第44-47页 |
3.1.1 候选基因编码蛋白的结构域研究 | 第45-47页 |
3.2 Xoc GX01双组份基因中感受蛋白基因的突变体的构建 | 第47-56页 |
3.2.1 整合突变体的构建 | 第47-48页 |
3.2.2 引物设计和PCR扩增目的片段 | 第48-49页 |
3.2.3 pK18mob重组质粒的构建 | 第49-51页 |
3.2.4 三亲接合子获得整合突变体 | 第51-52页 |
3.2.5 候选感受子基因生化表型检测 | 第52-56页 |
3.3 突变体功能互补菌株的构建 | 第56-77页 |
3.3.1 XOC1980突变体的互补菌株的构建 | 第57-61页 |
3.3.2 XOC1980互补菌株的表型分析 | 第61-67页 |
3.3.3 XOC1020突变体互补菌株的构建 | 第67-71页 |
3.3.4 XOC1020互补菌株的表型分析 | 第71-77页 |
3.4 XOC1980、XOC1020的生物信息学分析 | 第77-85页 |
3.4.1 XOC1980、XOC1020的结构域分析 | 第77-78页 |
3.4.2 XOC1980、XOC1020的氨基酸序列分析 | 第78页 |
3.4.3 XOC1980、XOC1020的蛋白质序列分析 | 第78-82页 |
3.4.4 XOC1980、XOC1020在黄单胞菌属中的进化树分析 | 第82-85页 |
第四章 结论与讨论 | 第85-90页 |
4.1. Xoc GX01中感受子基因的表型 | 第85-88页 |
4.1.1 与胞外蛋白酶相关的感受子基因 | 第85-86页 |
4.1.2 与胞外多糖相关的感受子基因 | 第86页 |
4.1.3 与游动性相关的感受子基因 | 第86-87页 |
4.1.4 与致病力相关的感受子基因 | 第87页 |
4.1.5 与致病因子和致病力相关的感受子基因注释的双组份系统分析 | 第87-88页 |
4.2 XOC1980、XOC1020的生物功能分析 | 第88-90页 |
4.2.1 XOC1980与胞外蛋白酶、胞外多糖、细菌游动性、致病性相关 | 第88页 |
4.2.2 XOC1020与胞外蛋白酶、致病性相关 | 第88页 |
4.2.3 XOC1980、XOC1020与HR不相关 | 第88-89页 |
4.2.4 XOC1980、XOC1020都有生物膜特性 | 第89页 |
4.2.5 YOC1980、YOC1020不影响细胞繁殖 | 第89-90页 |
参考文献 | 第90-98页 |
致谢 | 第98-99页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第99页 |