摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 前言 | 第11-21页 |
1.1 极端环境微生物 | 第11页 |
1.1.1 极端环境和极端环境微生物 | 第11页 |
1.1.2 极端环境微生物的研究概况 | 第11页 |
1.2 嗜盐微生物及研究现状 | 第11-13页 |
1.2.1 嗜盐微生物 | 第11-12页 |
1.2.2 嗜盐微生物多样性研究进展 | 第12-13页 |
1.3 免培养技术及高通量测序技术 | 第13-15页 |
1.3.1 免培养技术及其研究进展 | 第13-14页 |
1.3.2 高通量测序在微生物多样性研究中的应用 | 第14-15页 |
1.4 宏基因组学的研究 | 第15-16页 |
1.4.1 宏基因组及宏基因组学 | 第15页 |
1.4.2 宏基因组文库筛选 | 第15-16页 |
1.4.3 嗜盐微生物宏基因组学技术的研究进展 | 第16页 |
1.5 嗜盐微生物适应盐逆境机制研究 | 第16-18页 |
1.5.1 胞内Na+排除机制 | 第17页 |
1.5.2 胞内K+累积机制 | 第17页 |
1.5.3 胞内小分子相容性物质累积机制 | 第17页 |
1.5.4 嗜盐酶稳定机制 | 第17-18页 |
1.6 陕北花马盐湖特点及其微生物研究现状 | 第18页 |
1.6.1 陕北花马盐湖特点 | 第18页 |
1.6.2 陕北花马盐湖微生物研究进展 | 第18页 |
1.7 研究目的及意义 | 第18-21页 |
第2章 陕北花马盐湖原核微生物群落的多样性研究 | 第21-35页 |
2.1 材料与仪器设备 | 第21-22页 |
2.1.1 实验材料 | 第21页 |
2.1.2 试剂 | 第21页 |
2.1.3 仪器设备 | 第21-22页 |
2.2 方法 | 第22-24页 |
2.2.1 陕北花马盐湖土壤沉积物基因组DNA的提取 | 第22-23页 |
2.2.2 16S rDNA高变区测序流程 | 第23-24页 |
2.2.3 标准信息分析 | 第24页 |
2.2.4 高级信息分析 | 第24页 |
2.3 结果与分析 | 第24-32页 |
2.3.1 陕北花马盐湖土壤沉积物基因组DNA提取 | 第24-25页 |
2.3.2 16S rDNA高变区测序分析 | 第25-26页 |
2.3.3 陕北花马盐湖土壤沉积物样品免培养原核微生物群落分布格局 | 第26-27页 |
2.3.4 陕北花马盐湖土壤沉积物样品微原核生物物种分布图 | 第27-30页 |
2.3.5 陕北花马盐湖土壤沉积物样品微生物物种分类展示图 | 第30-31页 |
2.3.6 陕北花马盐湖土壤沉积物样品原核微生物物种分类进化树 | 第31-32页 |
2.4 小结与讨论 | 第32-35页 |
第3章 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库的构建、耐盐基因簇的筛选及功能分析 | 第35-63页 |
3.1 材料与仪器设备 | 第35-37页 |
3.1.1 实验材料 | 第35页 |
3.1.2 菌株和载体 | 第35页 |
3.1.3 试剂 | 第35-36页 |
3.1.4 仪器设备 | 第36-37页 |
3.2 方法 | 第37-42页 |
3.2.1 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库的构建 | 第37-39页 |
3.2.2 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库耐盐克隆的筛选 | 第39页 |
3.2.3 耐盐克隆质粒DNA的提取 | 第39-40页 |
3.2.4 耐盐克隆质粒DNA宏基因组测序分析 | 第40页 |
3.2.5 耐盐克隆EZ-Tn5转座突变文库的构建 | 第40-41页 |
3.2.6 转座文库耐盐突变克隆的筛选 | 第41页 |
3.2.7 耐盐突变克隆的基因测序 | 第41-42页 |
3.2.8 耐盐克隆与转座突变克隆离子生长试验 | 第42页 |
3.3 结果与分析 | 第42-60页 |
3.3.1 陕北花马盐湖土壤微生物宏基因组DNA的提取 | 第42页 |
3.3.2 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库构建 | 第42页 |
3.3.3 Fosmid文库耐盐克隆的筛选 | 第42-44页 |
3.3.4 耐盐克隆质粒DNA的提取 | 第44页 |
3.3.5 克隆 2E4质粒DNA宏基因组测序分析 | 第44-56页 |
3.3.6 耐盐克隆 2E4转座突变文库的构建 | 第56页 |
3.3.7 转座克隆文库耐盐突变菌株的筛选 | 第56页 |
3.3.8 耐盐突变克隆的DNA测序 | 第56-57页 |
3.3.9 耐盐克隆 2E4与转座突变克隆 3E7离子生长试验 | 第57-60页 |
3.4 小结与讨论 | 第60-63页 |
结论 | 第63-65页 |
参考文献 | 第65-73页 |
攻读硕士学位期间的成果 | 第73-75页 |
致谢 | 第75页 |