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陕北花马盐湖原核微生物多样性及耐盐逆境研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第1章 前言第11-21页
    1.1 极端环境微生物第11页
        1.1.1 极端环境和极端环境微生物第11页
        1.1.2 极端环境微生物的研究概况第11页
    1.2 嗜盐微生物及研究现状第11-13页
        1.2.1 嗜盐微生物第11-12页
        1.2.2 嗜盐微生物多样性研究进展第12-13页
    1.3 免培养技术及高通量测序技术第13-15页
        1.3.1 免培养技术及其研究进展第13-14页
        1.3.2 高通量测序在微生物多样性研究中的应用第14-15页
    1.4 宏基因组学的研究第15-16页
        1.4.1 宏基因组及宏基因组学第15页
        1.4.2 宏基因组文库筛选第15-16页
        1.4.3 嗜盐微生物宏基因组学技术的研究进展第16页
    1.5 嗜盐微生物适应盐逆境机制研究第16-18页
        1.5.1 胞内Na+排除机制第17页
        1.5.2 胞内K+累积机制第17页
        1.5.3 胞内小分子相容性物质累积机制第17页
        1.5.4 嗜盐酶稳定机制第17-18页
    1.6 陕北花马盐湖特点及其微生物研究现状第18页
        1.6.1 陕北花马盐湖特点第18页
        1.6.2 陕北花马盐湖微生物研究进展第18页
    1.7 研究目的及意义第18-21页
第2章 陕北花马盐湖原核微生物群落的多样性研究第21-35页
    2.1 材料与仪器设备第21-22页
        2.1.1 实验材料第21页
        2.1.2 试剂第21页
        2.1.3 仪器设备第21-22页
    2.2 方法第22-24页
        2.2.1 陕北花马盐湖土壤沉积物基因组DNA的提取第22-23页
        2.2.2 16S rDNA高变区测序流程第23-24页
        2.2.3 标准信息分析第24页
        2.2.4 高级信息分析第24页
    2.3 结果与分析第24-32页
        2.3.1 陕北花马盐湖土壤沉积物基因组DNA提取第24-25页
        2.3.2 16S rDNA高变区测序分析第25-26页
        2.3.3 陕北花马盐湖土壤沉积物样品免培养原核微生物群落分布格局第26-27页
        2.3.4 陕北花马盐湖土壤沉积物样品微原核生物物种分布图第27-30页
        2.3.5 陕北花马盐湖土壤沉积物样品微生物物种分类展示图第30-31页
        2.3.6 陕北花马盐湖土壤沉积物样品原核微生物物种分类进化树第31-32页
    2.4 小结与讨论第32-35页
第3章 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库的构建、耐盐基因簇的筛选及功能分析第35-63页
    3.1 材料与仪器设备第35-37页
        3.1.1 实验材料第35页
        3.1.2 菌株和载体第35页
        3.1.3 试剂第35-36页
        3.1.4 仪器设备第36-37页
    3.2 方法第37-42页
        3.2.1 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库的构建第37-39页
        3.2.2 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库耐盐克隆的筛选第39页
        3.2.3 耐盐克隆质粒DNA的提取第39-40页
        3.2.4 耐盐克隆质粒DNA宏基因组测序分析第40页
        3.2.5 耐盐克隆EZ-Tn5转座突变文库的构建第40-41页
        3.2.6 转座文库耐盐突变克隆的筛选第41页
        3.2.7 耐盐突变克隆的基因测序第41-42页
        3.2.8 耐盐克隆与转座突变克隆离子生长试验第42页
    3.3 结果与分析第42-60页
        3.3.1 陕北花马盐湖土壤微生物宏基因组DNA的提取第42页
        3.3.2 陕北花马盐湖宏基因组Fosmid文库构建第42页
        3.3.3 Fosmid文库耐盐克隆的筛选第42-44页
        3.3.4 耐盐克隆质粒DNA的提取第44页
        3.3.5 克隆 2E4质粒DNA宏基因组测序分析第44-56页
        3.3.6 耐盐克隆 2E4转座突变文库的构建第56页
        3.3.7 转座克隆文库耐盐突变菌株的筛选第56页
        3.3.8 耐盐突变克隆的DNA测序第56-57页
        3.3.9 耐盐克隆 2E4与转座突变克隆 3E7离子生长试验第57-60页
    3.4 小结与讨论第60-63页
结论第63-65页
参考文献第65-73页
攻读硕士学位期间的成果第73-75页
致谢第75页

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