| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| 引言 | 第12页 |
| 1 三七皂苷及其生物合成途径研究进展, | 第12-18页 |
| 1.1 三七皂苷研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2 三七皂苷生物合成的分子生物学研究 | 第14-18页 |
| 2 microRNA的研究进展 | 第18-24页 |
| 2.1 植物microRNA概况 | 第18-19页 |
| 2.2 植物microRNA的形成及其作用机制 | 第19-20页 |
| 2.3 植物microRNA的功能 | 第20-21页 |
| 2.4 microRNA的检测方法 | 第21-24页 |
| 3 本研究的目的和意义 | 第24页 |
| 参考文献 | 第24-32页 |
| 第二章 广西不同年限三七中皂苷含量的HPLC分析 | 第32-38页 |
| 1 材料和方法 | 第32-33页 |
| 1.1 供试材料 | 第32页 |
| 1.2 主要仪器与试剂 | 第32页 |
| 1.3 方法 | 第32-33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 2.1 线性关系的考察 | 第33-34页 |
| 2.2 标准品检测结果 | 第34-35页 |
| 2.3 样品的含量测定结果 | 第35-36页 |
| 3 讨论 | 第36-37页 |
| 4 小结 | 第37页 |
| 参考文献 | 第37-38页 |
| 第三章 三七转录组和表达谱的高通量测序及生物信息学分析 | 第38-81页 |
| 1 材料与方法 | 第39-46页 |
| 1.1 供试材料 | 第39页 |
| 1.2 主要仪器与试剂 | 第39-40页 |
| 1.3 实验方法 | 第40-46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-74页 |
| 2.1 RNA纯度、收率及完整性 | 第46-49页 |
| 2.2 转录组测序 | 第49-63页 |
| 2.2.1 原始测序数据产量 | 第49-50页 |
| 2.2.2 组装结果 | 第50-53页 |
| 2.2.3 Unigene功能注释 | 第53-55页 |
| 2.2.4 Unigene的GO分类 | 第55-58页 |
| 2.2.5 Unigene代谢通路分析 | 第58-61页 |
| 2.2.6 Unigene的编码蛋白框(CDS)预测 | 第61-63页 |
| 2.3 表达谱测序 | 第63-74页 |
| 3 讨论 | 第74-77页 |
| 3.1 RNA提取 | 第74-75页 |
| 3.2 高通量测序技术在基因挖掘中的作用 | 第75-76页 |
| 3.3 三七皂苷生物合成途径相关酶的挖掘 | 第76页 |
| 3.4 转录组和表达谱的结合为基因克隆提供了新的思路 | 第76-77页 |
| 4 小结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-81页 |
| 第四章 三七皂苷合成关键酶基因的克隆及序列分析 | 第81-107页 |
| 1 材料与方法 | 第81-82页 |
| 1.1 材料 | 第81页 |
| 1.2 主要试剂 | 第81页 |
| 1.3 RNA提取 | 第81页 |
| 1.4 cDNA的合成 | 第81页 |
| 1.5 基因的扩增及测序 | 第81-82页 |
| 1.6 基因编码蛋白的生物信息学分析 | 第82页 |
| 2 结果与分析 | 第82-105页 |
| 2.1 基因的克隆 | 第82-88页 |
| 2.2 基因编码蛋白特性分析 | 第88-105页 |
| 3 讨论 | 第105-106页 |
| 3.1 高通量测序技术组装的可信度 | 第105-106页 |
| 3.2 三七皂苷生物合成途径关键酶基因的克隆 | 第106页 |
| 4 小结 | 第106页 |
| 参考文献 | 第106-107页 |
| 第五章 三七microRNA的高通量测序及生物信息学分析 | 第107-147页 |
| 1 材料与方法 | 第107-114页 |
| 1.1 材料 | 第107-108页 |
| 1.2 实验方法 | 第108-114页 |
| 2 结果与分析 | 第114-142页 |
| 2.1 数据质量及长度分布 | 第114-115页 |
| 2.2 样品间小RNA公共及特有序列分析 | 第115-117页 |
| 2.3 已知miRNA的碱基偏好性及其表达谱 | 第117-122页 |
| 2.4 Genbank比对 | 第122-123页 |
| 2.5 Rfam比对 | 第123-124页 |
| 2.6 sRNA分类注释 | 第124-127页 |
| 2.7 候选miRNA的碱基偏好性及其表达谱信息 | 第127-131页 |
| 2.8 已知miRNA差异分析 | 第131-133页 |
| 2.9 已知miRNA靶基因位点预测 | 第133页 |
| 2.10 已知miRNA的GO富集分析 | 第133页 |
| 2.11 新miRNA差异分析 | 第133-134页 |
| 2.12 新miRNA表达模式聚类分析 | 第134页 |
| 2.13 新miRNA靶基因预测 | 第134-135页 |
| 2.14 新miRNA GO富集分析 | 第135页 |
| 2.15 KEGG通路分析 | 第135-138页 |
| 2.16 qRT-PCR检测 | 第138-142页 |
| 3 讨论 | 第142-144页 |
| 3.1 高通量测序挖掘miRNA的可靠性 | 第142-143页 |
| 3.2 建立不同生长年限三七根的小RNA文库 | 第143页 |
| 3.3 三七已知miRNA和新miRNA分析 | 第143页 |
| 3.4 三七皂苷含量相关的miRNA挖掘 | 第143-144页 |
| 3.5 三七中植物-病菌互作的miRNA挖掘 | 第144页 |
| 4 小结 | 第144-146页 |
| 4.1 测序质量及长度 | 第145页 |
| 4.2 小RNA表达谱及差异表达 | 第145页 |
| 4.3 三七皂苷生物合成途径基因及病菌相关miRNA的挖掘 | 第145-146页 |
| 参考文献 | 第146-147页 |
| 第六章 结论与展望 | 第147-148页 |
| 1 结论 | 第147页 |
| 2 展望 | 第147-148页 |
| 附录 | 第148-184页 |
| 致谢 | 第184-185页 |
| 个人简历 | 第185-187页 |
