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鹅掌楸转录组研究及抗寒基因发掘

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
第一章 绪论第18-33页
    1.1 研究目的与意义第18-19页
    1.2 国内外研究进展第19-30页
        1.2.1 树种概况和研究进展第19-21页
        1.2.2 植物抗寒性研究进展第21-26页
        1.2.3 转录组学综述第26-29页
        1.2.4 单核苷酸多态性检测第29-30页
    1.3 鹅掌楸研究亟待解决的问题第30-31页
    1.4 研究目标及主要内容第31-32页
        1.4.1 研究目标第31页
        1.4.2 研究的主要内容第31-32页
    1.5 研究技术路线第32-33页
第二章 不同种源鹅掌楸抗寒性综合评价第33-50页
    2.1 试验材料第33-34页
    2.2 试验方法第34-41页
        2.2.1 丙二醛含量的测定第34-35页
        2.2.2 可溶性蛋白质含量的测定第35-36页
        2.2.3 可溶性糖含量的测定第36-37页
        2.2.4 SOD活性的测定第37-39页
        2.2.5 脯氨酸含量的测定第39-40页
        2.2.6 相对电导率第40-41页
        2.2.7 含水量测定第41页
        2.2.8 抗寒性综合评价方法第41页
    2.3 结果与讨论第41-47页
        2.3.1 抗寒性生理指标的季节变化第41-42页
        2.3.2 种源间抗寒生理指标的差异第42-45页
        2.3.3 不同种源抗寒性综合评价第45-47页
    2.4 小结第47-48页
    2.5 讨论第48-50页
        2.5.1 种源间产生抗寒性差异的可能原因第48页
        2.5.2 生理指标对抗寒性差异的影响第48-50页
第三章 鹅掌楸枝条顶芽转录组文库构建及测序第50-67页
    3.1 试验材料第50-51页
    3.2 方法第51-54页
        3.2.1 RNA提取及样品检测第51-52页
        3.2.2 转录组测序第52-53页
        3.2.3 转录组测序结果分析第53页
        3.2.4 Unigene表达差异分析第53-54页
    3.3 结果与分析第54-66页
        3.3.1 RNA提取第54页
        3.3.2 转录组组装及结果评估第54-57页
        3.3.3 转录组基因功能注释第57-66页
    3.4 小结第66-67页
第四章 数字基因表达谱技术研究鹅掌楸差异表达基因第67-92页
    4.1 试验材料第67页
    4.2 方法第67-68页
        4.2.1 文库构建第67页
        4.2.2 测序第67-68页
        4.2.3 生物信息学分析第68页
    4.3 结果与分析第68-90页
        4.3.1 测序质量第68-69页
        4.3.2 差异表达基因分析第69-73页
        4.3.3 差异表达基因GO富集分析第73-76页
        4.3.4 差异表达基因KEGG富集分析第76-84页
        4.3.5 抗寒相关差异基因筛选第84-90页
    4.4 小结第90页
    4.5 讨论第90-92页
第五章 低温响应基因的表达分析第92-99页
    5.1 试验材料第92-93页
    5.2 试验方法第93-95页
        5.2.1 样品RNA质量检测第93-94页
        5.2.2 样品c DNA合成第94页
        5.2.3 引物设计第94页
        5.2.4 目的基因的荧光定量PCR检测第94-95页
        5.2.5 试验数据处理第95页
    5.3 结果与分析第95-98页
        5.3.1 荧光定量试验质量分析第95-96页
        5.3.2 荧光定量试验结果与转录组测序的相关性第96-98页
    5.4 小结第98-99页
第六章 结论与讨论第99-104页
    6.1 结论第99-101页
        6.1.1 建立抗寒性生理指标评价体系,鉴定出抗寒种源第99页
        6.1.2 建立了鹅掌楸枝条顶芽转录组文库第99-100页
        6.1.3 运用数字表达谱技术筛选出抗寒相关的差异表达基因第100-101页
        6.1.4 通过荧光定量试验验证抗寒基因第101页
    6.2 讨论第101-104页
        6.2.1 本研究的科学价值第101-102页
        6.2.2 试验材料的取材第102-103页
        6.2.3 后期研究思路第103-104页
参考文献第104-112页
附录第112-129页
在读期间的学术研究第129-130页
致谢第130页

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