| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第13-19页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-15页 |
| 1.2 本文的研究内容和主要工作 | 第15-17页 |
| 1.2.1 本文的研究内容 | 第15-16页 |
| 1.2.2 本文特色主要工作 | 第16-17页 |
| 1.3 本文章节安排 | 第17-19页 |
| 第二章 基于多数据源的癌症网络合成与分析研究 | 第19-37页 |
| 2.1 引言 | 第19-24页 |
| 2.1.1 研究背景 | 第19-23页 |
| 2.1.2 本章工作介绍 | 第23-24页 |
| 2.2 多源数据获取和集成 | 第24-26页 |
| 2.2.1 差异pathway和基因表达数据获取 | 第24-26页 |
| 2.2.2 基因疾病关系数据和基因子网络获取 | 第26页 |
| 2.3 系统构架和功能实现 | 第26-33页 |
| 2.3.1 系统整体构架 | 第27页 |
| 2.3.2 Pathway模块 | 第27-28页 |
| 2.3.3 基因子网络模块 | 第28-29页 |
| 2.3.4 网络分析模块 | 第29-30页 |
| 2.3.5 网络可视化模块 | 第30-31页 |
| 2.3.6 系统功能 | 第31-33页 |
| 2.4 应用分析 | 第33-34页 |
| 2.4.1 应用实例 | 第33-34页 |
| 2.4.2 结果分析 | 第34页 |
| 2.5 本章小结 | 第34-37页 |
| 第三章 基于癌症网络的癌症内部分子功能研究 | 第37-57页 |
| 3.1 引言 | 第37-38页 |
| 3.1.1 研究背景 | 第37-38页 |
| 3.1.2 研究内容 | 第38页 |
| 3.2 数据获取和预处理 | 第38-44页 |
| 3.2.1 基因表达数据获取和处理 | 第38-40页 |
| 3.2.2 Pathway数据获取和处理 | 第40页 |
| 3.2.3 基因疾病关系数据(GDAs)获取和处理 | 第40-42页 |
| 3.2.4 癌症网络构建 | 第42-44页 |
| 3.3 基于癌症网络的胰腺癌生物分子功能研究 | 第44-51页 |
| 3.3.1 胰腺癌网络获取 | 第45-46页 |
| 3.3.2 结果分析与讨论 | 第46-51页 |
| 3.4 基于癌症网络的癌症共性网络生物分子功能研究 | 第51-56页 |
| 3.4.1 癌症共性网络获取和分析 | 第51-54页 |
| 3.4.2 结果分析与讨论 | 第54-56页 |
| 3.5 本章小结 | 第56-57页 |
| 第四章 基于TCGA多维组学数据的癌症共性和异质性研究 | 第57-71页 |
| 4.1 引言 | 第57-61页 |
| 4.1.1 研究背景 | 第57-60页 |
| 4.1.2 相关工作介绍 | 第60-61页 |
| 4.2 基于DNA差异甲基化数据的癌症共性和异质性研究 | 第61-69页 |
| 4.2.1 数据获取和处理 | 第62-63页 |
| 4.2.2 结果分析和讨论 | 第63-69页 |
| 4.3 本章小结 | 第69-71页 |
| 第五章 结论 | 第71-75页 |
| 5.1 工作总结 | 第71-72页 |
| 5.2 后续工作展望 | 第72-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第83页 |
