基于线粒体控制区和细胞色素B基因的江豚种群遗传多样性和遗传结构分析
| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 中国水域鲸豚类保护遗传学的研究现状 | 第12-14页 |
| 2 线粒体DNA在哺乳动物研究中的应用 | 第14-18页 |
| 2.1 哺乳动物线粒体DNA的结构及基因组成 | 第14-15页 |
| 2.2 线粒体作为DNA分子标记的优点 | 第15-16页 |
| 2.3 线粒体控制区在哺乳动物遗传学中的应用 | 第16-17页 |
| 2.4 线粒体Cyt b在哺乳动物遗传学中的应用 | 第17-18页 |
| 3 江豚的研究现状 | 第18-21页 |
| 3.1 江豚的分类地位和亚种划分 | 第18-19页 |
| 3.2 江豚的种群数量 | 第19-20页 |
| 3.3 分子生物学在江豚研究中的应用 | 第20-21页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 窄脊江豚东亚亚种线粒体全基因组序列的分析 | 第22-31页 |
| 1 材料与方法 | 第22-24页 |
| 1.1 基因组DNA的提取 | 第22页 |
| 1.2 线粒体全序列的PCR扩增及测序 | 第22-23页 |
| 1.2.1 PCR引物的设计 | 第22-23页 |
| 1.2.2 PCR扩增及序列测定 | 第23页 |
| 1.3 数据处理分析 | 第23-24页 |
| 1.3.1 序列分析 | 第23-24页 |
| 1.3.2 系统进化分析 | 第24页 |
| 2 结果与分析 | 第24-28页 |
| 2.1 PCR和测序结果 | 第24-25页 |
| 2.2 线粒体基因组的基本组成 | 第25页 |
| 2.3 基因间隔区与基因重叠区 | 第25-26页 |
| 2.4 控制区 | 第26页 |
| 2.5 蛋白质编码基因及密码子使用 | 第26-27页 |
| 2.6 基于线粒体基因组全序列的鲸类系统发育关系 | 第27-28页 |
| 3 讨论 | 第28-31页 |
| 第三章 江豚种群的遗传多样性和遗传结构分析 | 第31-52页 |
| 1 材料与方法 | 第32-35页 |
| 1.1 实验材料 | 第32-33页 |
| 1.2 实验方法 | 第33-34页 |
| 1.2.1 窄脊江豚基因组DNA的提取 | 第33页 |
| 1.2.2 线粒体DNA控制区的扩增 | 第33页 |
| 1.2.3 细胞色素B基因的扩增 | 第33-34页 |
| 1.3 线粒体DNA序列数据处理 | 第34-35页 |
| 1.3.1 序列特征与分析 | 第34页 |
| 1.3.2 种群遗传结构分析 | 第34-35页 |
| 1.3.3 种群历史动态分析 | 第35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-46页 |
| 2.1 线粒体DNA控制区序列分析 | 第35-40页 |
| 2.1.1 核苷酸突变位点及单倍型分布 | 第35-36页 |
| 2.1.2 种群遗传多样性 | 第36页 |
| 2.1.3 种群遗传格局 | 第36-38页 |
| 2.1.4 聚类分析 | 第38-40页 |
| 2.2 线粒体DNA Cyt b序列分析 | 第40-44页 |
| 2.2.1 核苷酸突变位点及单倍型分布 | 第40-41页 |
| 2.2.2 种群遗传多样性 | 第41页 |
| 2.2.3 种群遗传格局 | 第41-43页 |
| 2.2.4 聚类分析 | 第43-44页 |
| 2.3 中性检验和种群历史动态 | 第44-46页 |
| 3 讨论 | 第46-52页 |
| 3.1 江豚种群的遗传多样性和遗传结构 | 第46-50页 |
| 3.2 江豚地理分布格局和种群历史动态 | 第50-52页 |
| 全文总结 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-64页 |
| 附件 | 第64-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
