| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词 | 第12-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-46页 |
| 1.1 研究的意义 | 第14-15页 |
| 1.2 农杆菌转化的研究现状 | 第15-35页 |
| 1.2.1 农杆菌 | 第15-16页 |
| 1.2.2 农杆菌的种类 | 第16页 |
| 1.2.3 农杆菌的寄主范围 | 第16-17页 |
| 1.2.4 根癌农杆菌病害 | 第17页 |
| 1.2.5 农杆菌转化 | 第17-21页 |
| 1.2.6 T-DNA的转运和整合过程 | 第21-25页 |
| 1.2.6.1 农杆菌与宿主植物间的识别与附着 | 第22-23页 |
| 1.2.6.2 vir基因的表达和T-DNA进入植物细胞质 | 第23-24页 |
| 1.2.6.3 成熟T-DNA复合体的形成和转运 | 第24页 |
| 1.2.6.4 T-DNA整合到宿主染色体 | 第24-25页 |
| 1.2.6.5 转基因表达 | 第25页 |
| 1.2.7 T-DNA整合模型 | 第25-27页 |
| 1.2.8 Vir蛋白在T-DNA整合中的功能 | 第27-28页 |
| 1.2.9 影响农杆菌转化效率的因子 | 第28-33页 |
| 1.2.10 农杆菌影响植物的免疫反应 | 第33-35页 |
| 1.3 肌醇和肌醇磷酸盐代谢途径研究现状 | 第35-41页 |
| 1.3.1 肌醇的特性 | 第35页 |
| 1.3.2 肌醇在植物中的合成路径 | 第35-36页 |
| 1.3.3 肌醇在植物中的生物学功能 | 第36页 |
| 1.3.4 肌醇在植物中的代谢 | 第36-37页 |
| 1.3.5 肌醇的研究与应用 | 第37-38页 |
| 1.3.6 磷脂酰肌醇磷酸盐的功能 | 第38页 |
| 1.3.7 IP_6的合成 | 第38-39页 |
| 1.3.8 IP_6的功能 | 第39页 |
| 1.3.9 IPK1的功能 | 第39页 |
| 1.3.10 MIPS、IMP、IPK2α/β、PLC等酶类在MI代谢中的功能 | 第39-41页 |
| 1.4 展望 | 第41-42页 |
| 1.5 研究方法与技术路线 | 第42-46页 |
| 1.5.1 研究方法 | 第42页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第42-46页 |
| 第二章 外源肌醇对拟南芥根转化敏感性的影响 | 第46-79页 |
| 2.1 材料 | 第46-48页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第46页 |
| 2.1.2 菌株和质粒 | 第46页 |
| 2.1.3 化学试剂 | 第46页 |
| 2.1.4 仪器 | 第46-47页 |
| 2.1.5 培养基 | 第47-48页 |
| 2.1.6 相关试剂配制 | 第48页 |
| 2.2 方法 | 第48-54页 |
| 2.2.1 植物材料培养 | 第48-49页 |
| 2.2.2 拟南芥根愈伤组织的诱导培养 | 第49页 |
| 2.2.3 拟南芥愈伤组织继代培养 | 第49页 |
| 2.2.4 农杆菌介导的拟南芥根段转化 | 第49-50页 |
| 2.2.5 拟南芥愈伤组织中淀粉、木质素的检测 | 第50-51页 |
| 2.2.6 拟南芥根长统计和形态观测 | 第51页 |
| 2.2.7 Quantitative Real-time PCR检测 | 第51-53页 |
| 2.2.8 高效离子色谱分析(HPIC) | 第53-54页 |
| 2.2.9 统计分析 | 第54页 |
| 2.3 结果与分析 | 第54-75页 |
| 2.3.1 外源肌醇对拟南芥Col-0生物学形态的影响 | 第54-57页 |
| 2.3.2 外源肌醇对拟南芥根愈伤组织生长的影响 | 第57页 |
| 2.3.3 根愈伤组织的组织化学染色 | 第57页 |
| 2.3.4 外源MI影响根受体对农杆菌转化的敏感性 | 第57-60页 |
| 2.3.5 GUS瞬时表达分析 | 第60-61页 |
| 2.3.6 根组织mRNA转录水平 | 第61-72页 |
| 2.3.7 外源MI调节植物P_i和IP_6的含量 | 第72-75页 |
| 2.4 小结 | 第75-79页 |
| 2.4.1 外源MI影响拟南芥生长表型 | 第75页 |
| 2.4.2 外源MI影响拟南芥根愈伤组织的生长 | 第75-76页 |
| 2.4.3 外源MI影响拟南芥根受体对农杆菌转化的敏感性 | 第76-77页 |
| 2.4.4 拟南芥根在农杆菌转化前、后的基因表达差异分析 | 第77-78页 |
| 2.4.5 外源MI影响组织体内P_i和IP_6的含量 | 第78-79页 |
| 第三章 外源肌醇对拟南芥植株转录组的影响 | 第79-99页 |
| 3.1 材料 | 第79页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第79页 |
| 3.1.2 试剂 | 第79页 |
| 3.1.3 仪器 | 第79页 |
| 3.1.4 培养基 | 第79页 |
| 3.2 方法 | 第79-84页 |
| 3.2.1 植物材料培养 | 第79-80页 |
| 3.2.2 RNA提取与质量检测 | 第80页 |
| 3.2.3 RNA-seq测序 | 第80-81页 |
| 3.2.4 数据分析 | 第81-84页 |
| 3.3 结果与分析 | 第84-95页 |
| 3.3.1 RNA质量检测结果 | 第84-85页 |
| 3.3.2 RNA-seq测序与原始reads处理结果 | 第85-88页 |
| 3.3.3 RNA-seq数据综合分析和差异基因(DEGs)表达评估 | 第88页 |
| 3.3.4 DEGs的层级聚类分析 | 第88页 |
| 3.3.5 RNA-seq数据的GO分析 | 第88-90页 |
| 3.3.6 DEGs的KEGG和MapMan分析 | 第90-95页 |
| 3.3.7 DEGs数据的验证结果 | 第95页 |
| 3.4 小结 | 第95-99页 |
| 第四章 AtIPK1在农杆菌介导拟南芥根转化中的作用 | 第99-127页 |
| 4.1 材料 | 第99-100页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第99页 |
| 4.1.2 菌株和质粒 | 第99页 |
| 4.1.3 化学试剂 | 第99页 |
| 4.1.4 仪器 | 第99页 |
| 4.1.5 培养基和试剂配制 | 第99-100页 |
| 4.2 方法 | 第100-103页 |
| 4.2.1 突变体的鉴定 | 第100-101页 |
| 4.2.2 Col-0野生型和atipk1突变体的AtIPK1过表达材料转化 | 第101-102页 |
| 4.2.3 农杆菌转化敏感性分析 | 第102-103页 |
| 4.2.4 高效色谱离子分析(HPIC) | 第103页 |
| 4.2.5 统计分析 | 第103页 |
| 4.3 结果与分析 | 第103-123页 |
| 4.3.1 atipk1和atipk2β突变体鉴定 | 第103-104页 |
| 4.3.2 Col-0野生型和atipk1突变体的AtIPK1过表达材料鉴定 | 第104-106页 |
| 4.3.3 农杆菌转化敏感性分析 | 第106-108页 |
| 4.3.4 根组织相关基因的表达分析 | 第108-121页 |
| 4.3.5 植物内源P_i和IP_6的HPIC分析 | 第121-123页 |
| 4.4 小结 | 第123-127页 |
| 4.4.1 植物材料的鉴定与表型 | 第123页 |
| 4.4.2 农杆菌介导的根转化效率 | 第123页 |
| 4.4.3 AtIPK1对根组织内源基因的影响 | 第123-125页 |
| 4.4.4 AtIPK2β对根组织内源基因的影响 | 第125-126页 |
| 4.4.5 AtIPK1影响组织体内P_i和IP_6的含量 | 第126-127页 |
| 第五章 讨论与结论 | 第127-132页 |
| 5.1 全文讨论 | 第127-131页 |
| 5.1.1 外源MI对拟南芥形态学的影响 | 第127页 |
| 5.1.2 外源MI对拟南芥根受体转化敏感性的影响 | 第127-128页 |
| 5.1.3 外源MI对拟南芥转录组的影响 | 第128-129页 |
| 5.1.4 外源MI对受体内P_i和IP_6代谢的影响 | 第129页 |
| 5.1.5 受体基因AtIPK1对农杆菌转化敏感性的作用 | 第129-130页 |
| 5.1.6 受体基因AtIPK2β对农杆菌转化敏感性的影响 | 第130页 |
| 5.1.7 AtIPK1和AtIPK2β对P_i和IP_6代谢调节 | 第130-131页 |
| 5.2 全文结论 | 第131-132页 |
| 5.2.1 外源MI影响拟南芥的生长表型 | 第131页 |
| 5.2.2 外源MI影响拟南芥根受体的转化敏感性 | 第131页 |
| 5.2.3 外源MI影响拟南芥的转录组代谢 | 第131页 |
| 5.2.4 AtIPK1影响根受体对农杆菌介导转化的敏感性 | 第131页 |
| 5.2.5 植物体P_i和IP_6代谢受外源MI和AtIPK1调节 | 第131-132页 |
| 附件 | 第132-149页 |
| 参考文献 | 第149-172页 |
| 致谢 | 第172-173页 |
| 个人简历 | 第173页 |
