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Pif1家族解旋机制的结构基础研究

致谢第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
缩写汇总第15-16页
1 引言第16-40页
    1.1 解旋酶概述第16-22页
        1.1.1 什么是解旋酶?及其作用对象第16-18页
        1.1.2 解旋酶的分类及结构特征第18-20页
        1.1.3 解旋酶解旋机制研究第20-22页
    1.2 Pif1家族成员第22-28页
        1.2.1 酿酒酵母ScPif1及Rrm3第23-24页
        1.2.2 裂殖酵母Pfh1第24-27页
        1.2.3 人源hPif1第27页
        1.2.4 原核生物细菌BaPif1第27-28页
    1.3 Pif1解旋酶的功能第28-38页
        1.3.1 Pif1对端粒稳定性的调控作用第29-31页
        1.3.2 Pif1对G4结构的解旋作用第31-34页
        1.3.3 Pif1促进损失修复的DNA合成第34-35页
        1.3.4 Pif1促进刚崎片段的成熟第35-36页
        1.3.5 Pif1维持线粒体基因组稳定性第36-37页
        1.3.6 Pif1调控rDNA的复制第37-38页
    1.4 本研究的意义与目的第38-40页
2 材料与方法第40-66页
    2.1 材料第40-43页
        2.1.1 实验材料第40页
        2.1.2 实验试剂第40-42页
        2.1.3 实验仪器第42-43页
    2.2 方法第43-66页
        2.2.1 基因克隆第43-48页
        2.2.2 蛋白质表达与纯化第48-57页
        2.2.3 蛋白质单体结晶与结构解析第57-60页
        2.2.4 蛋白质/DNA复合物结晶与结构解析第60-61页
        2.2.5 蛋白质突变体克隆与纯化第61-63页
        2.2.6 蛋白质与核酸结合的EMSA实验第63-64页
        2.2.7 蛋白质与核酸结合的ITC实验第64-65页
        2.2.8 解旋酶活性测定实验第65-66页
3 实验结果与讨论第66-94页
    3.1 Pif1蛋白质的表达与纯化第66-71页
        3.1.1 ScPif1全长与Helicase domain(HD)截短的表达与纯化第66-68页
        3.1.2 hPif1全长与Helicase domain(HD)截短的表达与纯化第68-70页
        3.1.3 BaPif1全长的表达与纯化第70-71页
    3.2 Pif1蛋白及与DNA复合物的晶体衍射数据收集第71-77页
        3.2.1 hPif1-HD蛋白晶体衍射数据收集第71-72页
        3.2.2 BaPif1蛋白晶体衍射数据收集第72-73页
        3.2.3 BaPif1蛋白与单链DNA dT10的复合物晶体衍射数据收集第73-74页
        3.2.4 BaPif1蛋白与双链DNAH的复合物晶体衍射数据收集第74-77页
    3.3 Pif1蛋白及与DNA复合物的结构分析第77-87页
        3.3.1 Pif1单体结构分析第77-81页
        3.3.2 BaPif1/DNA复合物结构分析第81-84页
        3.3.3 Pif1-like解旋酶结构比对第84-87页
    3.4 BaPif1蛋白的Signature motif功能与解旋酶机制分析第87-94页
        3.4.1 BaPif1蛋白的Signature motif功能第87-88页
        3.4.2 BaPif1蛋白结合DNA后构象的变化第88-91页
        3.4.3 BaPif1蛋白可能的解旋机制第91-94页
4 总结与展望第94-98页
    4.1 总结第94-96页
    4.2 展望第96-98页
参考文献第98-110页
个人简历及科研成果第110页

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