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水稻感染RSV产生症状的蛋白质组学分析及RNAi介导的抗RSV和RBSDV转基因水稻研究

附件第3-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-8页
英文缩略词第14-16页
第一章 引言第16-31页
    1.1 水稻条纹叶枯病第16-18页
        1.1.1 水稻条纹叶枯病症状、分布与危害第16-17页
        1.1.2 水稻条纹病毒第17-18页
    1.2 水稻黑条矮缩病第18-19页
        1.2.1 水稻黑条矮缩病症状、分布与危害第18-19页
        1.2.2 水稻黑条矮缩病毒第19页
    1.3 植物病毒的致病机理第19-20页
    1.4 蛋白质组学分析技术第20-23页
        1.4.1 双向电泳第21页
        1.4.2 质谱第21-22页
        1.4.3 iTRAQ第22-23页
    1.5 RNAi第23-27页
        1.5.1 RNAi概述第23-24页
        1.5.2 RNA沉默主要蛋白因子第24页
        1.5.3 DCL第24-25页
        1.5.4 RDR第25页
        1.5.5 AGO第25-27页
        1.5.6 RNA沉默抑制机制第27页
    1.6 水稻抗病性第27-29页
        1.6.1 病原介导的抗病策略第27-29页
        1.6.2 病原介导抗病性的扩散第29页
    1.7 转基因植物的标记基因第29-30页
    1.8 本研究的目的和意义第30-31页
第二章 利用i TRAQ技术解析水稻条纹叶枯病症状形成机理第31-65页
    2.1 材料与方法第32-41页
        2.1.1 材料第32页
        2.1.2 斑点杂交第32页
        2.1.3 RSV侵染第32页
        2.1.4 提取RNA第32-33页
        2.1.5 RT-PCR第33-34页
        2.1.6 反转录c DNA第34页
        2.1.7 RT-q PCR(reverse transcription quantitative polymerase chain reaction)第34-35页
        2.1.8 蛋白质提取第35-36页
        2.1.9 蛋白质酶解第36页
        2.1.10 iTRAQ标记第36-37页
        2.1.11 酶解肽段预分离及LC-MS/MS质谱分析第37-39页
        2.1.12 质谱数据分析第39页
        2.1.13 Gene Ontology及KEGG注释第39页
        2.1.14 差异表达蛋白质间互作分析第39-40页
        2.1.15 Northern印迹分析第40-41页
    2.2 结果与分析第41-62页
        2.2.1 灰飞虱带毒率第41-42页
        2.2.2 症状观察第42页
        2.2.3 RT-PCR检测第42-43页
        2.2.4 蛋白质鉴定及蛋白质定量第43页
        2.2.5 下调蛋白质GO注释第43-45页
        2.2.6 上调蛋白质GO注释第45-47页
        2.2.7 KEGG第47-49页
        2.2.8 差异表达蛋白质第49-60页
        2.2.9 症状相关基因表达第60-62页
    2.3 讨论第62-65页
第三章 RSV SP蛋白与水稻蛋白质RAP互作研究第65-73页
    3.1 材料与方法第65-69页
        3.1.1 材料第65页
        3.1.2 构建载体第65-68页
        3.1.3 酵母双杂交第68-69页
        3.1.4 β-半乳糖苷酶的活性检测第69页
    3.2 结果与分析第69-71页
        3.2.1 水稻基因克隆第69页
        3.2.2 猎物载体构建第69-70页
        3.2.3 病毒蛋白质pc3与水稻蛋白质互作第70-71页
        3.2.4 病毒蛋白质SP与水稻蛋白质互作第71页
    3.3 讨论第71-73页
第四章 RNAi介导的水稻抗RSV机制研究第73-88页
    4.1 材料与方法第73-79页
        4.1.1 材料第73页
        4.1.2 构建体外转录载体第73-75页
        4.1.3 sRNA印迹分析第75-77页
        4.1.4 反转录c DNA第77页
        4.1.5 RT-qPCR第77-79页
    4.2 结果与分析第79-86页
        4.2.1 构建克隆载体第79-80页
        4.2.2 构建表达载体第80页
        4.2.3 克隆载体和表达载体序列比对第80-81页
        4.2.4 接种RSV前后转基因水稻si RNAs积累量第81-82页
        4.2.5 内参基因引物特异性分析第82页
        4.2.6 转基因水稻中AGOs表达量第82-84页
        4.2.7 转基因水稻中RDRs表达量第84-85页
        4.2.8 转基因水稻中DCLs表达量第85-86页
    4.3 讨论第86-88页
第五章 抗RSV和RBSDV的转基因水稻第88-104页
    5.1 材料与方法第88-94页
        5.1.1 材料第88页
        5.1.2 提取水稻基因组第88-89页
        5.1.3 转基因水稻基因组PCR检测第89-90页
        5.1.4 Southern印迹分析第90-92页
        5.1.5 构建体外转录载体第92-93页
        5.1.6 s RNA印迹分析第93页
        5.1.7 抗病性鉴定第93-94页
    5.2 结果与分析第94-102页
        5.2.1 种植地灰飞虱虫量及带毒率调查第94页
        5.2.2 T2代转基因水稻第94-96页
        5.2.3 T3代转基因水稻第96-97页
        5.2.4 T4代转基因水稻第97-98页
        5.2.5 正义链和负义链检测第98-99页
        5.2.6 拷贝数鉴定第99-100页
        5.2.7 构建载体p MD18-DB第100页
        5.2.8 构建表达载体p SPT18-DB第100-101页
        5.2.9 克隆载体和表达载体序列比对第101-102页
        5.2.10 转基因水稻的si RNAs积累量第102页
    5.3 讨论第102-104页
第六章 结论第104-105页
参考文献第105-117页
附录第117-118页
致谢第118-119页
作者简历第119页

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