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西瓜根系渗透胁迫下转录组与microRNA分析及相关基因功能研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第14-25页
    1.1 干旱对植物的影响第14-16页
        1.1.1 干旱对植物生长、发育及产量的影响第14页
        1.1.2 干旱对光合作用的影响第14-15页
        1.1.3 干旱对水分生理、营养吸收及代谢的影响第15页
        1.1.4 过氧化伤害第15页
        1.1.5 对ABA的影响第15-16页
    1.2 植物对干旱胁迫的响应第16-21页
        1.2.1 干旱胁迫信号的感应与传递第16-17页
        1.2.2 干旱胁迫应答相关基因的表达调控第17-19页
        1.2.3 渗透调节第19-20页
        1.2.4 活性氧清除第20页
        1.2.5 保护性蛋白及其他渗透胁迫适应途径第20-21页
    1.3 microRNA(miRNA)与植物干旱胁迫第21页
    1.4 转录组测序在西瓜干旱研究上的运用第21-22页
    1.5 脯氨酸研究进展第22-24页
        1.5.1 脯氨酸合成及转运第22-23页
        1.5.2 P5CS基因研究进展第23-24页
    1.6 研究目的、意义和内容第24-25页
        1.6.1 研究的目的和意义第24页
        1.6.2 研究内容第24-25页
第二章 干旱胁迫下西瓜根系转录组第25-42页
    2.1 材料和方法第25-28页
        2.1.1 西瓜材料准备及处理第25-26页
        2.1.2 qRT-PCR分析第26-27页
        2.1.3 文库建立和RNA-seq分析第27页
        2.1.4 数据处理和分析第27-28页
    2.2 结果与分析第28-38页
        2.2.1 测序时间点选择第28-30页
        2.2.2 转录组测序及数据分析第30页
        2.2.3 转录组数据可靠性分析第30-32页
        2.2.4 差异表达基因、及其GO和KEGG分析第32-36页
        2.2.5 渗透胁迫中保护基因第36-37页
        2.2.6 涉及蛋白激酶、磷酸酶和转录因子的差异表达基因第37页
        2.2.7 植物激素第37-38页
        2.2.8 其它差异表达基因第38页
    2.3 讨论第38-42页
        2.3.1 西瓜根系渗透调节第38-39页
        2.3.2 活性氧清除第39页
        2.3.3 转录因子第39页
        2.3.4 渗透胁迫的适应第39-42页
第三章 microRNA介导的西瓜根系干旱胁迫响应第42-61页
    3.1 材料和方法第42-43页
        3.1.1 试验材料及处理第42页
        3.1.2 miRNAs和降解组文库构建及测序第42页
        3.1.3 miRNA鉴定第42-43页
        3.1.4 miRNA的差异表达分析第43页
        3.1.5 降解组测序鉴定miRNA的靶基因第43页
    3.2 结果与分析第43-59页
        3.2.1 西瓜根系miRNA和降解组文库构建第43-44页
        3.2.2 小RNA分类注释第44-45页
        3.2.3 miRNA鉴定第45-48页
        3.2.4 miRNA表达分析第48-49页
        3.2.5 差异表达miRNA分析第49-50页
        3.2.6 miRNA靶基因预测第50-51页
        3.2.7 差异表达miRNA靶基因注释第51页
        3.2.8 降解组位点检测第51-59页
    3.3 讨论第59-61页
第四章 渗透胁迫下西瓜根系脯氨酸积累第61-78页
    4.1 材料和方法第61-66页
        4.1.1 植物材料及处理第61页
        4.1.2 载体、菌株、酶及试剂耗材第61-62页
        4.1.3 脯氨酸含量测定第62页
        4.1.4 P5CS、OAT及PDH酶活性测定第62-63页
        4.1.5 qRT-PCR第63-64页
        4.1.6 脯氨酸从叶片到根部的转运第64页
        4.1.7 启动子的克隆及载体连接第64-65页
        4.1.8 Cla017928与Cla006553的启动子转化拟南芥第65页
        4.1.9 GUS染色第65-66页
    4.2 结果与分析第66-76页
        4.2.1 脯氨酸含量第66-67页
        4.2.2 脯氨酸合成相关酶的活性及编码基因的表达第67-69页
        4.2.3 脯氨酸从叶片到根部的转运第69-70页
        4.2.4 启动子克隆第70-74页
        4.2.5 拟南芥转基因植株检测第74-76页
        4.2.6 GUS组织染色分析第76页
    4.3 讨论第76-78页
第五章 脯氨酸合成酶基因Cal017928及Cal006553功能验证第78-92页
    5.1 材料和方法第78-80页
        5.1.1 植物材料第78页
        5.1.2 载体、菌株及试剂第78页
        5.1.3 Cal017928及Cal006553的克隆及表达载体构建第78-80页
        5.1.4 载体的农杆菌转化及农杆菌侵染拟南芥第80页
        5.1.5 拟南芥转基因植株筛选第80页
        5.1.6 转基因拟南芥植株的抗旱性第80页
    5.2 结果与分析第80-90页
        5.2.1 M08的ClP5CS基因克隆和生物信息学分析第80-86页
        5.2.2 转基因拟南芥阳性植株的获得第86-87页
        5.2.3 转基因拟南芥中在渗透胁迫下的发芽率第87页
        5.2.4 转基因拟南芥幼苗耐逆鉴定第87-89页
        5.2.5 转基因拟南芥株系耐盐耐旱鉴定第89-90页
    5.3 讨论第90-92页
第六章 结论和创新点第92-93页
    6.1 结论第92页
    6.2 创新点第92-93页
参考文献第93-105页
缩微词表第105-106页
致谢第106-107页
作者简介第107页

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