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亮氨酸应答调控因子Lrp调控抗生素生物合成的分子机制及应用

摘要第3-7页
Abstract第7-9页
符号说明第14-17页
第一章 文献综述第17-28页
    1.1 Lrp转录调控家族的研究进展第17-24页
        1.1.1 Lrp家族蛋白的结构特征第17-18页
        1.1.2 Lrp家族蛋白的调控机制第18-20页
        1.1.3 Lrp家族蛋白的调控功能第20-23页
        1.1.4 放线菌中Lrp家族蛋白的研究进展第23-24页
    1.2 红霉素生物合成的分子调控的研究进展第24-26页
        1.2.1 红霉素的生物合成第24-25页
        1.2.2 红霉素生物合成的分子调控第25-26页
    1.3 本研究的选题意义和主要内容第26-28页
第二章 实验材料与方法第28-51页
    2.1 研究中所用菌株第28-29页
    2.2 研究中所用质粒第29-31页
    2.3 研究中所用引物第31-33页
    2.4 培养基和试剂第33-38页
    2.5 细菌的培养和保存第38-39页
    2.6 大肠杆菌和DNA操作的通用实验方法第39-41页
    2.7 糖多孢红霉菌和天蓝色链霉菌基因组DNA的提取第41页
    2.8 糖多孢红霉菌原生质体的制备和转化第41-42页
    2.9 两亲本介导的质粒DNA的跨属接合转移第42页
    2.10 糖多孢红霉菌和天蓝色链霉菌的发酵培养第42页
    2.11 HPLC法测定红霉素A标准曲线第42-43页
    2.12 糖多孢红霉菌和天蓝色链霉菌中抗生素的提取及检测第43-44页
    2.13 qRT-PCR检测基因转录水平第44-45页
    2.14 蛋白的表达、纯化和SDS-PAGE分析第45-48页
    2.15 EMSA分析第48页
    2.16 DNase I footprinting分析第48-49页
    2.17 胞内外游离氨基酸的含量测定第49页
    2.18 大肠杆菌相对荧光强度的检测第49-50页
    2.19 生物信息学分析第50-51页
第三章 糖多孢红霉菌SACE_Lrp对红霉素生物合成的调控第51-70页
    3.1 前言第51-53页
    3.2 SACE_Lrp直接结合SACE_Lrp-5387间隔区DNA第53-56页
        3.2.1 SACE_Lrp蛋白的表达与纯化第53-55页
        3.2.2 SACE_Lrp蛋白与SACE_Lrp-5387-int的EMSA分析第55-56页
    3.3 SACE_Lrp基因的体内功能研究第56-59页
        3.3.1 △SACE_Lrp缺失突变株的构建第56-58页
        3.3.2 SACE_Lrp的回复第58-59页
        3.3.3 SACE_Lrp的过表达第59页
    3.4 △SACE_Lrp红霉素生物合成产量的分析第59-60页
    3.5 △SACE_Lrp生物量和形态分化的分析第60-62页
    3.6 △SACE_Lrp中相关基因转录水平的检测第62-63页
    3.7 SACE_Lrp蛋白的EMSA分析第63-64页
    3.8 △SACE_Lrp胞内外分支氨基酸含量的分析第64-66页
    3.9 SACE_5387-5386过量表达对红霉素产量的影响第66-67页
    3.10 发酵培养中添加分支氨基酸对红霉素产量的影响第67-68页
    3.11 小结第68-70页
第四章 SACE_Lrp结合的靶序列及配体氨基酸的解析第70-81页
    4.1 前言第70页
    4.2 DNase I Footprinting解析SACE_Lrp保守结合序列第70-72页
        4.2.1 DNase I足迹法解析SACE_Lrp蛋白的保守结合序列第70-71页
        4.2.2 SACE_Lrp保守结合序列的精确定位第71-72页
    4.3 SACE_Lrp双向配体氨基酸的解析第72-76页
        4.3.1 SACE_Lrp蛋白的配体氨基酸的EMSA分析第72-74页
        4.3.2 SACE_Lrp蛋白的配体氨基酸的GFP报告系统分析第74-76页
    4.4 SACE_Lrp自我调控作用第76-80页
        4.4.1 SACE_Lrp和SACE_5387-5386启动子区的预测分析第76-77页
        4.4.2 GFP报告系统分析SACE_Lrp对自身转录的调控第77-80页
    4.5 小结第80-81页
第五章 以SACE_Lrp调控元件为基础的红霉素工业高产菌株的改造第81-86页
    5.1 前言第81页
    5.2 WB△SACE_Lrp和WB/5387-5386的构建第81-82页
    5.3 WB△SACE_Lrp/5387-5386的构建第82-83页
    5.4 WB△SACE_Lrp/5387-5386发酵培养中添加Val对红霉素产量的影响第83-85页
        5.4.1 WB△SACE_Lrp/5387-5386发酵培养中添加Val的摇瓶发酵检测第83-84页
        5.4.2 WB△SACE_Lrp/5387-5386发酵培养中添加Val的5-L发酵罐检测第84-85页
    5.5 小结第85-86页
第六章 天蓝色链霉菌中Lrp同源蛋白的功能研究第86-106页
    6.1 前言第86-87页
    6.2 SCO3361基因的体内功能研究第87-91页
        6.2.1 △SCO3361突变株的构建第87-89页
        6.2.2 SCO3361的回复第89-90页
        6.2.3 SCO3361的过表达第90-91页
    6.3 △SCO3361中次级代谢产物的分析第91-92页
    6.4 △SCO3361生物量和形态分化的分析第92-94页
    6.5 △SCO3361中相关基因转录水平的检测第94-96页
    6.6 SCO3361蛋白的EMSA分析第96-99页
        6.6.1 SCO3361蛋白的表达与纯化第96-97页
        6.6.2 SCO3361蛋白的EMSA分析第97-99页
    6.7 SCO3361配体氨基酸的解析第99-103页
        6.7.1 SCO3361蛋白的配体氨基酸的EMSA分析第99-101页
        6.7.2 SACE_Lrp蛋白的配体氨基酸的GFP报告系统分析第101-103页
    6.8 SCO3361与SACE_Lrp的交叉调控作用第103-104页
    6.9 小结第104-106页
第七章 总结与展望第106-109页
    7.1 全文总结第106-107页
    7.2 研究展望第107-109页
参考文献第109-118页
致谢第118-120页
科研成果第120页

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