| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩写表及中英文对照 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-19页 |
| 第一章 鸟类microRNA组学的研究进展 | 第12-19页 |
| 0 前言 | 第12页 |
| 1 鸟类分类系统 | 第12-13页 |
| 2 非编码RNA简介 | 第13页 |
| 3 microRNA简介 | 第13-18页 |
| 3.1 microRNA的生物学发生 | 第13-14页 |
| 3.2 microRNA的作用机制 | 第14页 |
| 3.3 microRNA研究进展 | 第14-18页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第18-19页 |
| 第二部分 研究论文 | 第19-67页 |
| 第二章 虎皮鹦鹉microRNA组学研究 | 第19-67页 |
| 0 引言 | 第19页 |
| 1 实验材料与方法 | 第19-26页 |
| 1.1 实验材料 | 第19-21页 |
| 1.1.1 实验动物解剖 | 第19页 |
| 1.1.2 主要试剂耗材清单 | 第19-20页 |
| 1.1.3 主要实验仪器清单 | 第20-21页 |
| 1.2 实验方法 | 第21-26页 |
| 1.2.1 虎皮鹦鹉性腺总RNA的提取 | 第21-22页 |
| 1.2.2 microRNA测序文库构建、质检和测序 | 第22页 |
| 1.2.3 mi RNA数据分析 | 第22-23页 |
| 1.2.4 技术路线 | 第23页 |
| 1.2.5 q PCR验证 | 第23-26页 |
| 2 实验结果与讨论 | 第26-67页 |
| 2.1 实验结果 | 第26-62页 |
| 2.1.1 RNA质量检测 | 第26-27页 |
| 2.1.2 测序原始数据的预处理(QC目录) | 第27页 |
| 2.1.3 测序数据的质量控制和预处理分析 | 第27-31页 |
| 2.1.4 序列生物信息分析 | 第31-33页 |
| 2.1.5 预测新的microRNA | 第33-49页 |
| 2.1.6 碱基偏好性统计 | 第49-50页 |
| 2.1.7 精巢、卵巢组织中显著差异表达的microRNA | 第50-52页 |
| 2.1.8 qPCR验证精巢和卵巢中的microRNA | 第52-53页 |
| 2.1.9 已知和新microRNA假定的靶标预测 | 第53-60页 |
| 2.1.10 虎皮鹦鹉microRNA GO注释和KEGG通路功能分析 | 第60-61页 |
| 2.1.11 脊椎动物Mun-mi R-215 的进化分析 | 第61-62页 |
| 2.2 讨论 | 第62-64页 |
| 2.3 结论 | 第64-67页 |
| 参考文献 | 第67-72页 |
| 附录 | 第72-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 硕士期间发表论文及获奖情况 | 第75页 |
