| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 序言 | 第13-16页 |
| 1 引言 | 第16-36页 |
| 1.1 相关概念及研究背景 | 第16-30页 |
| 1.1.1 系统理论与系统生物学 | 第16-18页 |
| 1.1.2 骨生理学 | 第18-19页 |
| 1.1.3 单核细胞的定义和生物学功能简介 | 第19-20页 |
| 1.1.4 蛋白质组学研究 | 第20-26页 |
| 1.1.5 生物信息学 | 第26-29页 |
| 1.1.6 多重组学研究 | 第29-30页 |
| 1.2 相关领域研究现状 | 第30-32页 |
| 1.2.1 骨质疏松研究现状 | 第30页 |
| 1.2.2 单核细胞应用在骨学研究领域现状 | 第30-31页 |
| 1.2.3 针对单核细胞的蛋白质组学研究现状 | 第31-32页 |
| 1.3 本研究主要内容及流程 | 第32-36页 |
| 2 单核细胞的蛋白质组学剖析 | 第36-46页 |
| 2.1 研究样本 | 第36-37页 |
| 2.2 外周血单核细胞(PBMs)的提取 | 第37-39页 |
| 2.3 蛋白质的提取和样本的制备 | 第39-42页 |
| 2.3.1 研究Ⅰ中单核细胞总蛋白提取 | 第39-40页 |
| 2.3.2 研究Ⅱ中单核细胞亚细胞组分蛋白提取 | 第40-41页 |
| 2.3.3 蛋白样本的制备 | 第41-42页 |
| 2.4 基于色谱-质谱联用平台的单核细胞蛋白质组分析 | 第42-44页 |
| 2.5 小结 | 第44-46页 |
| 3 鉴定差异表达的蛋白或基因 | 第46-54页 |
| 3.1 鉴定差异表达蛋白 | 第46-50页 |
| 3.1.1 鉴定方法 | 第46页 |
| 3.1.2 差异表达蛋白 | 第46-50页 |
| 3.2 研究Ⅰ中蛋白质-RNA荟萃分析鉴定差异表达基因 | 第50-51页 |
| 3.3 小结 | 第51-54页 |
| 4 基因富集、生物学通路和网络分析 | 第54-70页 |
| 4.1 基因富集分析和功能注释 | 第54-59页 |
| 4.1.1 基于DAVID的分析方法 | 第54-55页 |
| 4.1.2 结果 | 第55-59页 |
| 4.2 生物学通路分析和网络分析 | 第59-68页 |
| 4.2.1 基于STRING和Cytoscape的分析方法 | 第59-60页 |
| 4.2.2 结果 | 第60-68页 |
| 4.3 小结 | 第68-70页 |
| 5 转录组或全基因组水平验证研究 | 第70-74页 |
| 5.1 验证研究数据集及方法 | 第70-71页 |
| 5.1.1 研究Ⅰ结果在全基因组水平的验证 | 第70页 |
| 5.1.2 研究Ⅱ结果在转录组和全基因组水平的验证 | 第70-71页 |
| 5.2 结果 | 第71-72页 |
| 5.3 小结 | 第72-74页 |
| 6 讨论 | 第74-82页 |
| 6.1 研究Ⅰ | 第74-78页 |
| 6.2 研究Ⅱ | 第78-82页 |
| 7 结论 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-92页 |
| 附录 | 第92-102页 |
| 附录A | 第92-93页 |
| 附录B | 第93-94页 |
| 附录C | 第94-95页 |
| 附录D | 第95-96页 |
| 附录E | 第96-97页 |
| 附录F | 第97-99页 |
| 附录G | 第99-100页 |
| 附录H | 第100-102页 |
| 作者简历及攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第102-106页 |
| 学位论文数据集 | 第106页 |
