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紫花苜蓿在转录组水平响应低温胁迫的差异表达基因研究

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-28页
    1.1 植物抗寒性机理研究进展第13-17页
        1.1.1 植物在低温胁迫下的生理生化反应第13-15页
        1.1.2 植物叶片组织结构对低温的响应第15-16页
        1.1.3 分子水平上的植物抗寒性研究第16-17页
    1.2 植物转录因子研究进展第17-21页
        1.2.1 转录因子的概念第17页
        1.2.2 植物转录因子的分类第17-18页
        1.2.3 植物转录因子的结构第18-19页
        1.2.4 植物转录因子响应低温胁迫的研究概况第19-21页
    1.3 植物bZIP家族转录因子的研究进展第21-22页
        1.3.1 bZIP转录因子的结构和在细胞中的分布第21页
        1.3.2 bZIP转录因子分类第21-22页
        1.3.3 bZIP转录因子的调控机制和主要功能第22页
        1.3.4 植物bZIP转录因子对低温胁迫的响应第22页
    1.4 苜蓿抗寒性分子水平研究概况第22-23页
        1.4.1 苜蓿低温诱导表达基因资源研究第23页
        1.4.2 转基因抗寒苜蓿研究第23页
    1.5 转录组测序及其在植物逆境响应研究中的应用第23-26页
        1.5.1 转录组测序第24-25页
        1.5.2 转录组测序在植物低温响应研究中的应用第25-26页
    1.6 研究目的和主要内容第26-28页
第二章 紫花苜蓿响应低温胁迫的转录组分析第28-65页
    2.1 材料和方法第28-33页
        2.1.1 实验材料第28页
        2.1.2 处理方法第28页
        2.1.3 实验方法第28-33页
    2.2 结果与分析第33-61页
        2.2.1 样品RNA质量分析结果第33-34页
        2.2.2 测序数据质量评估与控制结果第34-36页
        2.2.3 转录组测序数据组装结果第36-38页
        2.2.4 转录组测序文库质量评估结果第38-41页
        2.2.5 Unigenes功能注释和富集结果第41-45页
        2.2.6 基因表达量计算统计结果第45-46页
        2.2.7 生物学重复相关性评估结果第46-48页
        2.2.8 DEGs筛选结果第48-49页
        2.2.9 DEGs功能注释和富集结果第49-58页
        2.2.10 对部分DEGs的RT-qPCR验证结果第58-61页
    2.3 讨论第61-63页
        2.3.1 紫花苜蓿转录组高通量测序与序列组装第61页
        2.3.2 不同抗寒能力紫花苜蓿品种在低温胁迫下的转录水平差异第61-62页
        2.3.3 DEGs注释结果分析第62-63页
    2.4 本章小结第63-65页
第三章 紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子鉴定和分析第65-80页
    3.1 材料和方法第65-66页
        3.1.1 实验材料第65页
        3.1.2 实验方法第65-66页
    3.2 结果与分析第66-75页
        3.2.1 全部Unigenes中转录因子鉴定结果第66页
        3.2.2 抗寒品种ZG9830响应低温胁迫的转录因子鉴定结果第66页
        3.2.3 抗寒品种ZG9830响应低温胁迫的差异表达转录因子分析结果第66-75页
    3.3 讨论第75-79页
        3.3.1 紫花苜蓿响应低温胁迫的转录因子鉴定第75-76页
        3.3.2 抗寒品种ZG9830响应低温的转录因子表达模式第76-79页
    3.4 本章小结第79-80页
第四章 紫花苜蓿bZIP家族转录因子鉴定及表达模式分析第80-105页
    4.1 材料和方法第80-81页
        4.1.1 实验材料第80页
        4.1.2 实验方法第80-81页
    4.2 结果与分析第81-102页
        4.2.1 紫花苜蓿bZIP转录因子的鉴定和命名第81-88页
        4.2.2 紫花苜蓿bZIP转录因子系统进化分析第88-89页
        4.2.3 MsbZIP转录因子其他保守结构域分析第89页
        4.2.4 ENC值和GC含量分析第89-90页
        4.2.5 基因RSCU分析第90页
        4.2.6 紫花苜蓿bZIP基因的功能注释第90-92页
        4.2.7 MsbZIP基因表达相关性分析第92-93页
        4.2.8 MsbZIP基因在不同器官中的表达分析第93-102页
    4.3 讨论第102-104页
        4.3.1 紫花苜蓿bZIP家族转录因子的鉴定及结构、功能分析第102-103页
        4.3.2 不同器官中MsbZIP基因的表达模式第103-104页
    4.4 本章小结第104-105页
第五章 结论与展望第105-107页
    5.1 全文结论第105页
    5.2 创新点第105页
    5.3 后续研究展望第105-107页
参考文献第107-124页
致谢第124-126页
作者简历第126页

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