植物SNP在线工具的开发及其在烟草中的应用
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| 1 前言 | 第9-14页 |
| 1.1 烟草的起源 | 第9页 |
| 1.2 分子标记 | 第9-12页 |
| 1.2.1 不基于已知序列的标记 | 第9-10页 |
| 1.2.1.1 RFLP | 第9-10页 |
| 1.2.1.2 RAPD | 第10页 |
| 1.2.1.3 AFLP | 第10页 |
| 1.2.2 基于已知序列的标记 | 第10-12页 |
| 1.2.2.1 SSR | 第11页 |
| 1.2.2.2 ILP | 第11-12页 |
| 1.2.2.3 SNP | 第12页 |
| 1.3 SNP的开发 | 第12-13页 |
| 1.4 生物数据库 | 第13页 |
| 1.5 实验目的与意义 | 第13-14页 |
| 2 材料与方法 | 第14-17页 |
| 2.1 实验材料 | 第14页 |
| 2.2 序列材料 | 第14-15页 |
| 2.3 实验方法 | 第15-17页 |
| 2.3.1 SNP 标记的开发 | 第15页 |
| 2.3.2 SNP 标记的验证试验 | 第15-17页 |
| 2.3.2.1 育苗 | 第15页 |
| 2.3.2.2 DNA 提取 | 第15-16页 |
| 2.3.2.3 引物设计 | 第16页 |
| 2.3.2.4 PCR 扩增反应体系 | 第16页 |
| 2.3.2.5 电泳验证及测序 | 第16页 |
| 2.3.2.6 结果比对 | 第16-17页 |
| 2.4 多物种SNP的发掘 | 第17页 |
| 2.5 数据库的构架 | 第17页 |
| 3 结果与分析 | 第17-32页 |
| 3.1 植物SNP的发掘 | 第17-22页 |
| 3.1.1 SNP开发工具 | 第17-21页 |
| 3.1.2 验证 | 第21-22页 |
| 3.2 烟草中SNP的开发 | 第22-26页 |
| 3.2.1 SNP统计 | 第23-24页 |
| 3.2.2 SNP位点的验证 | 第24-25页 |
| 3.2.3 302位点的分析 | 第25页 |
| 3.2.4 系统发育树分析 | 第25-26页 |
| 3.3 烟草SNP数据库 | 第26-32页 |
| 4 讨论 | 第32-33页 |
| 4.1 CsSNP数据库的构建 | 第32-33页 |
| 4.2 烟草SNP的开发 | 第33页 |
| 4.3 烟草SNP数据库的意义 | 第33页 |
| 4.4 数据库的更新 | 第33页 |
| 5 结论 | 第33-35页 |
| 参考文献 | 第35-42页 |
| 附件 | 第42-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第46页 |
