| 摘要 | 第8-13页 |
| ABSTRACT | 第13-19页 |
| 缩写词表 | 第20-21页 |
| 第一章 研究背景 | 第21-41页 |
| 1.1 纤维素资源的开发利用 | 第21-22页 |
| 1.2 纤维素的结构 | 第22-23页 |
| 1.3 纤维素的微生物降解 | 第23-26页 |
| 1.3.1 纤维素降解微生物 | 第23-24页 |
| 1.3.2 纤维素降解酶 | 第24-26页 |
| 1.4 纤维素降解策略 | 第26-30页 |
| 1.4.1 游离纤维素酶的协同降解机制 | 第26-27页 |
| 1.4.2 纤维小体(纤维素酶复合体)降解机制 | 第27-28页 |
| 1.4.3 细胞结合型非纤维小体降解机制 | 第28-29页 |
| 1.4.4 其它纤维素降解机制 | 第29-30页 |
| 1.5 纤维素吸附 | 第30-31页 |
| 1.5.1 纤维素酶的CBM | 第30页 |
| 1.5.2 纤维小体 | 第30-31页 |
| 1.5.3 菌体表面的纤毛或菌毛 | 第31页 |
| 1.5.4 菌体表面糖被层 | 第31页 |
| 1.6 微生物色素 | 第31-36页 |
| 1.6.1 微生物色素的分类 | 第31-33页 |
| 1.6.2 微生物色素的生物学功能 | 第33页 |
| 1.6.3 Flexirubin色素的研究进展 | 第33-36页 |
| 1.7 Cytophaga hutchinsonii研究背景 | 第36-38页 |
| 1.7.1 C. hutchinsonii的特征及分类学地位 | 第36-37页 |
| 1.7.2 C.hutchinsonii的研究进展 | 第37-38页 |
| 1.8 论文的立题依据和思路 | 第38-41页 |
| 第二章 C. hutchinsonii β-葡萄糖苷酶功能及其对纤维素降解的影响,C.hutchinsonii纤维素降解产物检测及其双途经降解体系 | 第41-91页 |
| 2.1 材料及方法 | 第41-60页 |
| 2.1.1 菌种 | 第41页 |
| 2.1.2 培养基与缓冲液 | 第41-42页 |
| 2.1.3 试剂与仪器 | 第42-43页 |
| 2.1.4 实验中涉及到的质粒及引物 | 第43-47页 |
| 2.1.5 分子生物学反应体系及操作 | 第47-48页 |
| 2.1.6 E.coli感受态的制备及热激转化 | 第48-49页 |
| 2.1.7 C.hutchinsonu感受态细胞的制备及电击转化 | 第49-50页 |
| 2.1.8 C.hutchinsonii生长曲线的测定 | 第50-51页 |
| 2.1.9 蛋白浓度测定(Bradford法) | 第51页 |
| 2.1.10 C.hutchinsonii纤维素降解检测 | 第51-52页 |
| 2.1.11 C.hutchinsonii菌落在软琼脂表面的扩散 | 第52页 |
| 2.1.12 C.hutchinsonii菌体在滤纸表面排列的扫描电子显微镜(SEM)观察 | 第52页 |
| 2.1.13 C.hutchinsonii纤维素酶活测定 | 第52-53页 |
| 2.1.14 C.hutchinsonii RNA的提取 | 第53页 |
| 2.1.15 C.hutchinsonii外膜蛋白、全膜蛋白及可溶蛋白的提取 | 第53-54页 |
| 2.1.16 聚丙烯酰胺凝胶电泳及β-葡萄糖苷酶复性电泳 | 第54-56页 |
| 2.1.17 Western blot | 第56-57页 |
| 2.1.18 纤维寡糖及纤维素降解产物检测 | 第57-59页 |
| 2.1.19 E.coli与 C.hutchinsonii共培养实验 | 第59-60页 |
| 2.1.20 纤维寡糖混合样的制备 | 第60页 |
| 2.1.21 再生非结晶无定形纤维素(RAC)的制备 | 第60页 |
| 2.2 实验结果 | 第60-82页 |
| 2.2.1 C.hittchinsonii β-葡萄糖苷的生物信息学分析 | 第60-61页 |
| 2.2.2 C.hutchinsonii β-萄糖苷酶表达水平的检测及蛋白定位 | 第61-62页 |
| 2.2.3 C.hutchinsonii-葡萄糖苷酶基因敲除菌株的构建 | 第62-64页 |
| 2.2.4 通过可复制质粒的基因回补 | 第64-66页 |
| 2.2.5 C.hutchinsonii β-葡萄糖苷酶基因敲除菌株表型研究 | 第66-68页 |
| 2.2.6 C.hutchinsonii β-葡萄糖苷酶敲除株对碳源降解能力的研究 | 第68-74页 |
| 2.2.7 C.hutchinsonii降解产物检测 | 第74-80页 |
| 2.2.8 C.hutchinsonii细胞表面降解途径对菌体的意义 | 第80-82页 |
| 2.3 讨论 | 第82-88页 |
| 2.4 小结 | 第88-91页 |
| 第三章 C.hutchinsonii纤维素吸附蛋白的鉴定和吸附蛋白CHU_0344功能的研究 | 第91-105页 |
| 3.1 材料与方法 | 第91-98页 |
| 3.1.1 菌种 | 第91页 |
| 3.1.2 培养基和缓冲液 | 第91-92页 |
| 3.1.3 试剂与仪器 | 第92-93页 |
| 3.1.4 实验中涉及到的质粒引物 | 第93-94页 |
| 3.1.5 分子生物学反应体系及操作 | 第94页 |
| 3.1.6 C.hutchinsonii全细胞吸附蛋白提取及SDS-PAGE | 第94-95页 |
| 3.1.7 蛋白表达水平检测 | 第95-96页 |
| 3.1.8 全细胞吸附蛋白LC-MS/MS实验流程和数据分析 | 第96-97页 |
| 3.1.9 E.coli感受态的制备及热激转化 | 第97页 |
| 3.1.10 C.hutchinsonii感受态的制备及电转化 | 第97页 |
| 3.1.11 表型研究 | 第97-98页 |
| 3.2 结果 | 第98-102页 |
| 3.2.1 SDS-PAGE | 第98-99页 |
| 3.2.2 混合样质谱结果 | 第99-100页 |
| 3.2.3 chu_0344基因敲除与回补 | 第100页 |
| 3.2.4 △0344的表型检测 | 第100-102页 |
| 3.3 讨论 | 第102-103页 |
| 3.4 小结 | 第103-105页 |
| 第四章 C.hutchinsonii flexirubin色素合成相关β-羟酰-ACP脱水酶的功能及flexirubin色素生物学功能的研究 | 第105-125页 |
| 4.1 材料与方法 | 第105-112页 |
| 4.1.1 菌种 | 第105页 |
| 4.1.2 培养基和缓冲液 | 第105-106页 |
| 4.1.3 试剂与仪器 | 第106-107页 |
| 4.1.4 实验中涉及到的菌株、质粒及引物 | 第107-108页 |
| 4.1.5 分子生物学反应体系及操作 | 第108-109页 |
| 4.1.6 E.coli感受态的制备及热激转化 | 第109页 |
| 4.1.7 C.hutchinsonii感受态的制备及电转化 | 第109页 |
| 4.1.8 Himar转座子随机插入突变 | 第109页 |
| 4.1.9 反向PCR检测插入位点 | 第109-110页 |
| 4.1.10 B-1突变株的表型检测 | 第110-111页 |
| 4.1.11 C.hutchinsonii细胞色素提取及检测 | 第111页 |
| 4.1.12 C.hutchinsoni菌体抗逆性检测 | 第111-112页 |
| 4.2 实验结果 | 第112-121页 |
| 4.3 讨论 | 第121-124页 |
| 4.4 小结 | 第124-125页 |
| 全文总结及展望 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-137页 |
| 在读期间发表学术论文 | 第137-138页 |
| 致谢 | 第138-139页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第139页 |
