致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
1 绪论 | 第11-27页 |
1.1 研究背景 | 第11-22页 |
1.1.1 ABC转运蛋白的功能 | 第11页 |
1.1.2 ABC转运蛋白的转运机制 | 第11-16页 |
1.1.2.1 向内转运蛋白的转运机制 | 第13-14页 |
1.1.2.2 向外转运蛋白的转运机制 | 第14-16页 |
1.1.3 药物分子靶点筛查方法概述 | 第16-22页 |
1.1.3.1 生物学实验方法筛查小分子的靶点 | 第17-20页 |
1.1.3.2 生物信息学方法筛查小分子的靶点 | 第20-22页 |
1.2 研究现状 | 第22-25页 |
1.2.1 酿酒酵母的ABC转运蛋白Pdr5p研究现状 | 第22-23页 |
1.2.2 分子对接方法的研究现状 | 第23-25页 |
1.3 研究目的和意义 | 第25-27页 |
2 PDR5P跨膜螺旋胞质侧末端带电位点突变的生化研究 | 第27-35页 |
2.1 概述 | 第27页 |
2.2 突变位点的确定 | 第27-28页 |
2.3 实验材料与方法 | 第28-30页 |
2.3.1 菌株、质粒和培养基 | 第28-29页 |
2.3.2 药品 | 第29页 |
2.3.3 生成突变 | 第29页 |
2.3.4 突变质粒YEplac195-PDR5~*转化入BY4741 pdr5△菌株 | 第29页 |
2.3.5 细胞质膜纯化 | 第29页 |
2.3.6 ATP酶活测定 | 第29页 |
2.3.7 药物耐受实验 | 第29页 |
2.3.8 R6G外排实验 | 第29-30页 |
2.4 实验结果 | 第30-33页 |
2.4.1 固体和液体培养药物耐受实验分析 | 第30-31页 |
2.4.2 Pdr5p表达水平和ATP酶活分析 | 第31-32页 |
2.4.3 R6G外排分析 | 第32-33页 |
2.5 讨论与小结 | 第33-35页 |
3 分子对接分析突变株药物外排能力下降原因 | 第35-49页 |
3.1 概述 | 第35-36页 |
3.2 基于GLIDE的分子对接流程 | 第36-44页 |
3.2.1 Glide简介 | 第36-39页 |
3.2.1.1 Glide对接的一般流程 | 第37-38页 |
3.2.1.2 Glide打分函数 | 第38-39页 |
3.2.2 配体和受体结构的获取 | 第39-42页 |
3.2.2.1 配体结构的获取 | 第39-40页 |
3.2.2.2 受体结构的获取 | 第40-42页 |
3.2.3 配体和受体结构的对接前处理 | 第42-43页 |
3.2.3.1 配体结构的对接前处理 | 第42页 |
3.2.3.2 受体结构的对接前处理 | 第42-43页 |
3.2.4 配体和受体结构的分子对接 | 第43-44页 |
3.2.4.1 受体活性位点对接格点的生成 | 第43-44页 |
3.2.4.2 分子对接 | 第44页 |
3.3 对接结果分析 | 第44-47页 |
3.3.1 对E574K突变体的对接结果分析 | 第44-46页 |
3.3.2 对E580K突变体的对接结果分析 | 第46-47页 |
3.4 讨论与小结 | 第47-49页 |
4 总结与展望 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
附录 | 第57-58页 |
作者简历及在读期间所取得的科研成果 | 第58页 |