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分子对接模拟酵母Pdr5p蛋白E574K突变致外排功能障碍的机制

致谢第4-5页
摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
1 绪论第11-27页
    1.1 研究背景第11-22页
        1.1.1 ABC转运蛋白的功能第11页
        1.1.2 ABC转运蛋白的转运机制第11-16页
            1.1.2.1 向内转运蛋白的转运机制第13-14页
            1.1.2.2 向外转运蛋白的转运机制第14-16页
        1.1.3 药物分子靶点筛查方法概述第16-22页
            1.1.3.1 生物学实验方法筛查小分子的靶点第17-20页
            1.1.3.2 生物信息学方法筛查小分子的靶点第20-22页
    1.2 研究现状第22-25页
        1.2.1 酿酒酵母的ABC转运蛋白Pdr5p研究现状第22-23页
        1.2.2 分子对接方法的研究现状第23-25页
    1.3 研究目的和意义第25-27页
2 PDR5P跨膜螺旋胞质侧末端带电位点突变的生化研究第27-35页
    2.1 概述第27页
    2.2 突变位点的确定第27-28页
    2.3 实验材料与方法第28-30页
        2.3.1 菌株、质粒和培养基第28-29页
        2.3.2 药品第29页
        2.3.3 生成突变第29页
        2.3.4 突变质粒YEplac195-PDR5~*转化入BY4741 pdr5△菌株第29页
        2.3.5 细胞质膜纯化第29页
        2.3.6 ATP酶活测定第29页
        2.3.7 药物耐受实验第29页
        2.3.8 R6G外排实验第29-30页
    2.4 实验结果第30-33页
        2.4.1 固体和液体培养药物耐受实验分析第30-31页
        2.4.2 Pdr5p表达水平和ATP酶活分析第31-32页
        2.4.3 R6G外排分析第32-33页
    2.5 讨论与小结第33-35页
3 分子对接分析突变株药物外排能力下降原因第35-49页
    3.1 概述第35-36页
    3.2 基于GLIDE的分子对接流程第36-44页
        3.2.1 Glide简介第36-39页
            3.2.1.1 Glide对接的一般流程第37-38页
            3.2.1.2 Glide打分函数第38-39页
        3.2.2 配体和受体结构的获取第39-42页
            3.2.2.1 配体结构的获取第39-40页
            3.2.2.2 受体结构的获取第40-42页
        3.2.3 配体和受体结构的对接前处理第42-43页
            3.2.3.1 配体结构的对接前处理第42页
            3.2.3.2 受体结构的对接前处理第42-43页
        3.2.4 配体和受体结构的分子对接第43-44页
            3.2.4.1 受体活性位点对接格点的生成第43-44页
            3.2.4.2 分子对接第44页
    3.3 对接结果分析第44-47页
        3.3.1 对E574K突变体的对接结果分析第44-46页
        3.3.2 对E580K突变体的对接结果分析第46-47页
    3.4 讨论与小结第47-49页
4 总结与展望第49-51页
参考文献第51-57页
附录第57-58页
作者简历及在读期间所取得的科研成果第58页

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