| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstrat | 第11-17页 |
| 缩略词表 | 第17-18页 |
| 第1章 文献综述 | 第18-40页 |
| ·miRNA特征,功能,与靶位点作用过程及方式 | 第19-28页 |
| ·miRNA特征 | 第21-23页 |
| ·miRNA功能 | 第23-26页 |
| ·miRNA与靶位点作用过程及方式 | 第26-28页 |
| ·miRNA及其靶位点的鉴定,预测,相关软件 | 第28-30页 |
| ·miRNA鉴定方式 | 第28页 |
| ·miRNA预测方式 | 第28-29页 |
| ·miRNA靶位点鉴定 | 第29-30页 |
| ·miRNA及其靶基因预测软件 | 第30页 |
| ·多倍体化 | 第30-34页 |
| ·多倍体的优势和多倍化的利用 | 第31-32页 |
| ·种间杂交及多倍化时所发生的基因组,转录组及小RNA的变化 | 第32-34页 |
| ·甘蓝和白菜杂交研究进展 | 第34-36页 |
| ·甘蓝和白菜种间杂交在DNA水平上的变化 | 第34-35页 |
| ·甘蓝和白菜种间杂交在表达水平上的变化 | 第35页 |
| ·甘蓝和白菜种间杂交的表观遗传学变化 | 第35页 |
| ·甘蓝和白菜种间杂交的表型变化 | 第35-36页 |
| ·小RNA在芸薹属中的研究进展 | 第36-39页 |
| ·本研究的技术路线 | 第39-40页 |
| 第2章 材料和方法 | 第40-50页 |
| ·试验材料 | 第40-41页 |
| ·植物材料 | 第40页 |
| ·供试试剂 | 第40页 |
| ·收集已发表的miRNA信息 | 第40-41页 |
| ·试验地点 | 第41页 |
| ·试验方法 | 第41-50页 |
| ·胚珠培养 | 第41-42页 |
| ·染色体加倍和检测 | 第42页 |
| ·田间形态学鉴定 | 第42页 |
| ·繁殖方式 | 第42-43页 |
| ·试验数据统计处理 | 第43页 |
| ·RNA的提取与检测 | 第43页 |
| ·高通量测序流程 | 第43-44页 |
| ·高通量测序分析技术路线 | 第44-45页 |
| ·原始数据的杂质的过滤、整理和统计 | 第45页 |
| ·基因组比对 | 第45-46页 |
| ·已知miRNA鉴定和统计信息 | 第46-48页 |
| ·miRNA差异分析 | 第48-49页 |
| ·miRNA靶基因预测 | 第49页 |
| ·miRNA遗传效应分析 | 第49-50页 |
| 第3章 结果与分析 | 第50-82页 |
| ·不同世代的人工合成甘蓝型油菜S群体创建 | 第50-51页 |
| ·亲本选择和杂交 | 第50页 |
| ·胚挽救 | 第50页 |
| ·染色体加倍效果检测 | 第50-51页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜不同世代S群体的材料创建 | 第51页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜的miRNA研究 | 第51-70页 |
| ·Illumina HiSeq2000高通量测序结果 | 第51-56页 |
| ·测序的miRNA的鉴定分析 | 第56-59页 |
| ·miRNA特征分析 | 第59-60页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜sRNA表达规律研究 | 第60-63页 |
| ·靶基因预测 | 第63-64页 |
| ·靶基因功能注释 | 第64-70页 |
| ·甘蓝、白菜和甘蓝型油菜基因组内的miRNA的特征、变异及进化分析 | 第70-82页 |
| ·miRNA长度和碱基组成分析 | 第71-74页 |
| ·miRNA在基因组中的分布区域 | 第74-75页 |
| ·产生miRNA的重复序列类型分析 | 第75-77页 |
| ·靶位点分析 | 第77-82页 |
| 第4章 讨论 | 第82-88页 |
| ·转座子与小RNA的关系 | 第82-84页 |
| ·siRNA和miRNA在多倍体化中的作用 | 第84-85页 |
| ·多倍体化过程中非加性基因的表达 | 第85-86页 |
| ·还有其它的需要解决的问题 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-102页 |
| 附录 | 第102-106页 |
| 致谢 | 第106-108页 |
| 在读期间发表的论文 | 第108-109页 |
